Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Peixoto, Haila Chagas
Data de Publicação: 2014
Outros Autores: Estévez Garcia, Andrea Isabel, Silva, Sheila Oliveira de Souza, Ramos, Ofir de Sales, Silva, Lucila Pereira da, Brandão, Paulo Eduardo, Richtzenhain, Leonardo José
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
Texto Completo: https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/64516
Resumo: Amostras do vírus da raiva (n = 17) isoladas de bovinos (n = 11), equinos (n = 4) e bubalinos (n = 2) procedentes do Pará (n = 7), Tocantins (n = 6) e Rondônia (n = 4) foram submetidas à técnica de RT-PCR para amplificação parcial dos genes da Nucleoproteína (N) e Glicoproteína (G). As sequências nucleotídicas obtidas foram analisadas pelo método de reconstrução filogenética Neighbor-Joining com o modelo evolutivo Kimura 2-parâmetros. Todas as 17 amostras pertenceram ao cluster A, que se encontrou na linhagem associado com morcego hematófago Desmodus rotundus. A análise filogenética baseada nos genes N e G, sugere a presença de cinco sublinhagens (A1-A5) e sete sublinhagens (A1-A7), respectivamente. Quando se compara ambas as filogenias, as sublinhagens A1 até A3 mostram composição e distribuição geográfica concordante, já a diversidade observada na composição das sublinhagens restantes é atribuída ao uso de sequências de diferentes alinhamentos. A glicoproteína mostrou marcadores moleculares nas sublinhagens A2, A3, A4 e A7, o que fornece elementos para melhor compreensão da epidemiologia molecular da raiva das linhagens circulantes na Amazônia Brasileira.
id USP-49_92561d8988520a7e9b09728fdf574c28
oai_identifier_str oai:revistas.usp.br:article/64516
network_acronym_str USP-49
network_name_str Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
repository_id_str https://www.revistas.usp.br/bjvras/index
spelling Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileiraMolecular epidemiology of rabies virus isolated of herbivores from Brazilian AmazonherbivorousnucleoproteinglycoproteinphylogenyrabiesherbívorosnucleoproteínaglicoproteínafilogeniaraivaAmostras do vírus da raiva (n = 17) isoladas de bovinos (n = 11), equinos (n = 4) e bubalinos (n = 2) procedentes do Pará (n = 7), Tocantins (n = 6) e Rondônia (n = 4) foram submetidas à técnica de RT-PCR para amplificação parcial dos genes da Nucleoproteína (N) e Glicoproteína (G). As sequências nucleotídicas obtidas foram analisadas pelo método de reconstrução filogenética Neighbor-Joining com o modelo evolutivo Kimura 2-parâmetros. Todas as 17 amostras pertenceram ao cluster A, que se encontrou na linhagem associado com morcego hematófago Desmodus rotundus. A análise filogenética baseada nos genes N e G, sugere a presença de cinco sublinhagens (A1-A5) e sete sublinhagens (A1-A7), respectivamente. Quando se compara ambas as filogenias, as sublinhagens A1 até A3 mostram composição e distribuição geográfica concordante, já a diversidade observada na composição das sublinhagens restantes é atribuída ao uso de sequências de diferentes alinhamentos. A glicoproteína mostrou marcadores moleculares nas sublinhagens A2, A3, A4 e A7, o que fornece elementos para melhor compreensão da epidemiologia molecular da raiva das linhagens circulantes na Amazônia Brasileira.Rabies virus samples (n = 17) isolated from bovines (n = 11), equines (n = 4) and buffalo (n = 2) from Pará State (n = 7), Tocantins (n = 6) and Rondônia (n = 4) were submitted to RT-PCR in order to obtain partial sequences of nucleoprotein (N) and glycoprotein gene (G). Nucleotide sequences were analyzed using Neighbor-Joining model, Kimura 2-parameters evolutionary model. All the 17 samples analyzed were related to cluster A, lineage associated with the hematophagous bat Desmodus rotundus. The phylogenetic analysis based on the N and G genes, suggests the presence of five sub-lineages (A1-A5), while G gene showed seven sub-lineages (A1-A7). In both phylogenies, sublineages A1 to A3 exhibit a similar composition and geographic distribution. Diverse composition of remaining groups of N and G gene is attributable to different sequences used in the alignments for each genomic region. Glycoprotein amino acid sequence showed molecular markers in sub-lineages A2, A3, A4 and A7. This information provides a better comprehension of molecular epidemiology of rabies, starting with the knowledge of viral lineages circulating in the Brazilian Amazon.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia2014-09-23info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/6451610.11606/issn.1678-4456.v51i2p122-130Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 51 Núm. 2 (2014); 122-130Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 51 No. 2 (2014); 122-130Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; v. 51 n. 2 (2014); 122-130Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; V. 51 N. 2 (2014); 122-1301678-44561413-9596reponame:Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Scienceinstname:Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)instacron:USPenghttps://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/64516/87435Peixoto, Haila ChagasEstévez Garcia, Andrea IsabelSilva, Sheila Oliveira de SouzaRamos, Ofir de SalesSilva, Lucila Pereira daBrandão, Paulo EduardoRichtzenhain, Leonardo Joséinfo:eu-repo/semantics/openAccess2020-06-23T04:06:20Zoai:revistas.usp.br:article/64516Revistahttps://www.revistas.usp.br/bjvrasPUBhttps://www.revistas.usp.br/bjvras/oaibjvras@usp.br1413-95961413-9596opendoar:https://www.revistas.usp.br/bjvras/index2023-01-12T16:43:49.445770Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
Molecular epidemiology of rabies virus isolated of herbivores from Brazilian Amazon
title Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
spellingShingle Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
Peixoto, Haila Chagas
herbivorous
nucleoprotein
glycoprotein
phylogeny
rabies
herbívoros
nucleoproteína
glicoproteína
filogenia
raiva
title_short Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
title_full Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
title_fullStr Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
title_full_unstemmed Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
title_sort Epidemiologia molecular de vírus da raiva isolados de herbívoros procedentes da Amazônia brasileira
author Peixoto, Haila Chagas
author_facet Peixoto, Haila Chagas
Estévez Garcia, Andrea Isabel
Silva, Sheila Oliveira de Souza
Ramos, Ofir de Sales
Silva, Lucila Pereira da
Brandão, Paulo Eduardo
Richtzenhain, Leonardo José
author_role author
author2 Estévez Garcia, Andrea Isabel
Silva, Sheila Oliveira de Souza
Ramos, Ofir de Sales
Silva, Lucila Pereira da
Brandão, Paulo Eduardo
Richtzenhain, Leonardo José
author2_role author
author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Peixoto, Haila Chagas
Estévez Garcia, Andrea Isabel
Silva, Sheila Oliveira de Souza
Ramos, Ofir de Sales
Silva, Lucila Pereira da
Brandão, Paulo Eduardo
Richtzenhain, Leonardo José
dc.subject.por.fl_str_mv herbivorous
nucleoprotein
glycoprotein
phylogeny
rabies
herbívoros
nucleoproteína
glicoproteína
filogenia
raiva
topic herbivorous
nucleoprotein
glycoprotein
phylogeny
rabies
herbívoros
nucleoproteína
glicoproteína
filogenia
raiva
description Amostras do vírus da raiva (n = 17) isoladas de bovinos (n = 11), equinos (n = 4) e bubalinos (n = 2) procedentes do Pará (n = 7), Tocantins (n = 6) e Rondônia (n = 4) foram submetidas à técnica de RT-PCR para amplificação parcial dos genes da Nucleoproteína (N) e Glicoproteína (G). As sequências nucleotídicas obtidas foram analisadas pelo método de reconstrução filogenética Neighbor-Joining com o modelo evolutivo Kimura 2-parâmetros. Todas as 17 amostras pertenceram ao cluster A, que se encontrou na linhagem associado com morcego hematófago Desmodus rotundus. A análise filogenética baseada nos genes N e G, sugere a presença de cinco sublinhagens (A1-A5) e sete sublinhagens (A1-A7), respectivamente. Quando se compara ambas as filogenias, as sublinhagens A1 até A3 mostram composição e distribuição geográfica concordante, já a diversidade observada na composição das sublinhagens restantes é atribuída ao uso de sequências de diferentes alinhamentos. A glicoproteína mostrou marcadores moleculares nas sublinhagens A2, A3, A4 e A7, o que fornece elementos para melhor compreensão da epidemiologia molecular da raiva das linhagens circulantes na Amazônia Brasileira.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-09-23
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/64516
10.11606/issn.1678-4456.v51i2p122-130
url https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/64516
identifier_str_mv 10.11606/issn.1678-4456.v51i2p122-130
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/64516/87435
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia
publisher.none.fl_str_mv Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia
dc.source.none.fl_str_mv Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 51 Núm. 2 (2014); 122-130
Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 51 No. 2 (2014); 122-130
Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; v. 51 n. 2 (2014); 122-130
Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; V. 51 N. 2 (2014); 122-130
1678-4456
1413-9596
reponame:Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
instname:Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)
instacron:USP
instname_str Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
collection Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
repository.name.fl_str_mv Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)
repository.mail.fl_str_mv bjvras@usp.br
_version_ 1797051566059945984