Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Curi, Rogério Abdallah
Data de Publicação: 2002
Outros Autores: Lopes, Catalina Romero
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
Texto Completo: https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/5974
Resumo: Paternity misidentification is harmful due to the reduction in annual genetic earnings of the population and because it endangers an efficient genetic improvement program. The objectives of the present study was to evaluate nine microsatellites in Paternity Testing and to investigate misidentification paternity frequency in families of Gyr breed bovines population. In the present experiment blood samples from forty Gir breed families ( bull / cow / calf ), registered pure breed in the Zebu Breeders Brazilian Association (ABCZ) were used. The most part of the microsatellites used in this work were recommended by the International Society of Animal Genetics (ISAG). The genomic DNA extraction was performed from whole blood samples. The microsatellites TGLA122, TGLA126, BM1824, BMS2533, SPS115, ETH3, ETH10, ETH225 and POTCHA were amplified by PCR. The amplification products were separated by electrophoresis in denaturing polyacrylamide gel. from the obtained data, allele frequencies, Gene Diversity, Polymorphism Informative Content and Probability of Exclusion for each microsatellite marker were calculated. the genotype frequencies, Heterozygosity, Combined Probability of Exclusion and Probability of Paternity have also been calculated in the considered families. The Combined Exclusion Probability for all microsatellites was around 0.9789. The Paternity Testing results showed misidentification in eleven of the 40 studied families, that means, 27.5% of the sample. The Paternity Probability ranged from 0.8691 to 0.9999, and the mean was 0.9512.
id USP-49_e13452a780405e48ee4dbbb1d3d857bf
oai_identifier_str oai:revistas.usp.br:article/5974
network_acronym_str USP-49
network_name_str Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
repository_id_str https://www.revistas.usp.br/bjvras/index
spelling Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça GirEvaluation of nine microsatellite loci and misidentification paternity frequency in a population of Gyr breed bovinesDNAMicrossatélitesPaternidadeBovinosGado GyrDNAMicrosatellitesPaternityBovineGyrPaternity misidentification is harmful due to the reduction in annual genetic earnings of the population and because it endangers an efficient genetic improvement program. The objectives of the present study was to evaluate nine microsatellites in Paternity Testing and to investigate misidentification paternity frequency in families of Gyr breed bovines population. In the present experiment blood samples from forty Gir breed families ( bull / cow / calf ), registered pure breed in the Zebu Breeders Brazilian Association (ABCZ) were used. The most part of the microsatellites used in this work were recommended by the International Society of Animal Genetics (ISAG). The genomic DNA extraction was performed from whole blood samples. The microsatellites TGLA122, TGLA126, BM1824, BMS2533, SPS115, ETH3, ETH10, ETH225 and POTCHA were amplified by PCR. The amplification products were separated by electrophoresis in denaturing polyacrylamide gel. from the obtained data, allele frequencies, Gene Diversity, Polymorphism Informative Content and Probability of Exclusion for each microsatellite marker were calculated. the genotype frequencies, Heterozygosity, Combined Probability of Exclusion and Probability of Paternity have also been calculated in the considered families. The Combined Exclusion Probability for all microsatellites was around 0.9789. The Paternity Testing results showed misidentification in eleven of the 40 studied families, that means, 27.5% of the sample. The Paternity Probability ranged from 0.8691 to 0.9999, and the mean was 0.9512.Erros de identificação de paternidade são prejudiciais por reduzir o ganho genético anual e comprometer um programa eficiente de melhoramento genético. O objetivo principal deste trabalho foi avaliar o potencial de uso de nove microssatélites em testes de paternidade e investigar a freqüência de erro de identificação de famílias de um rebanho de animais da raça Gir. No experimento foram utilizadas amostras de sangue de quarenta famílias (touro/ vaca/ bezerro) de animais da raça Gir, Puros de Origem e registrados na Associação Brasileira dos Criadores de Zebu (ABCZ). A maior parte dos microssatélites avaliados neste trabalho são recomendados, para Testes de Paternidade em bovinos, pela Sociedade Internacional de Genética Animal (ISAG). As regiões microssatélites TGLA122, TGLA126, BM1824, BMS2533, SPS115, ETH3, ETH10, ETH225 e POTCHA foram amplificadas por meio da técnica de PCR. Os produtos da amplificação foram separados por eletroforese em gel de poliacrilamida desnaturante. A partir dos dados obtidos foram calculadas as freqüências alélicas, diversidade gênica, conteúdo de polimorfismo informativo e probabilidade de exclusão para cada microssatélite. Também foram calculadas as freqüências genotípicas, heterozigosidade, probabilidade de exclusão combinada e probabilidade de Paternidade nas famílias consideradas. A probabilidade de exclusão combinada para todos os microssatélites estudados foi de 0,9789. Os resultados dos testes de paternidade acusaram erro de identificação em onze das 40 famílias estudadas, ou seja, 27,5% da amostra. A probabilidade de paternidade variou entre 0,8691 e 0,9999, com valor médio de 0,9512.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia2002-01-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/597410.1590/S1413-95962002000300004Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 39 Núm. 3 (2002); 129-135 Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 39 No. 3 (2002); 129-135 Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; v. 39 n. 3 (2002); 129-135 Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; V. 39 N. 3 (2002); 129-135 1678-44561413-9596reponame:Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Scienceinstname:Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)instacron:USPenghttps://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/5974/7505Curi, Rogério AbdallahLopes, Catalina Romeroinfo:eu-repo/semantics/openAccess2020-06-23T04:36:47Zoai:revistas.usp.br:article/5974Revistahttps://www.revistas.usp.br/bjvrasPUBhttps://www.revistas.usp.br/bjvras/oaibjvras@usp.br1413-95961413-9596opendoar:https://www.revistas.usp.br/bjvras/index2023-01-12T16:42:32.567299Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
Evaluation of nine microsatellite loci and misidentification paternity frequency in a population of Gyr breed bovines
title Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
spellingShingle Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
Curi, Rogério Abdallah
DNA
Microssatélites
Paternidade
Bovinos
Gado Gyr
DNA
Microsatellites
Paternity
Bovine
Gyr
title_short Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
title_full Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
title_fullStr Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
title_full_unstemmed Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
title_sort Avaliação de nove locos microssatélite e freqüência de paternidade incorreta em uma população de bovinos da raça Gir
author Curi, Rogério Abdallah
author_facet Curi, Rogério Abdallah
Lopes, Catalina Romero
author_role author
author2 Lopes, Catalina Romero
author2_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Curi, Rogério Abdallah
Lopes, Catalina Romero
dc.subject.por.fl_str_mv DNA
Microssatélites
Paternidade
Bovinos
Gado Gyr
DNA
Microsatellites
Paternity
Bovine
Gyr
topic DNA
Microssatélites
Paternidade
Bovinos
Gado Gyr
DNA
Microsatellites
Paternity
Bovine
Gyr
description Paternity misidentification is harmful due to the reduction in annual genetic earnings of the population and because it endangers an efficient genetic improvement program. The objectives of the present study was to evaluate nine microsatellites in Paternity Testing and to investigate misidentification paternity frequency in families of Gyr breed bovines population. In the present experiment blood samples from forty Gir breed families ( bull / cow / calf ), registered pure breed in the Zebu Breeders Brazilian Association (ABCZ) were used. The most part of the microsatellites used in this work were recommended by the International Society of Animal Genetics (ISAG). The genomic DNA extraction was performed from whole blood samples. The microsatellites TGLA122, TGLA126, BM1824, BMS2533, SPS115, ETH3, ETH10, ETH225 and POTCHA were amplified by PCR. The amplification products were separated by electrophoresis in denaturing polyacrylamide gel. from the obtained data, allele frequencies, Gene Diversity, Polymorphism Informative Content and Probability of Exclusion for each microsatellite marker were calculated. the genotype frequencies, Heterozygosity, Combined Probability of Exclusion and Probability of Paternity have also been calculated in the considered families. The Combined Exclusion Probability for all microsatellites was around 0.9789. The Paternity Testing results showed misidentification in eleven of the 40 studied families, that means, 27.5% of the sample. The Paternity Probability ranged from 0.8691 to 0.9999, and the mean was 0.9512.
publishDate 2002
dc.date.none.fl_str_mv 2002-01-01
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/5974
10.1590/S1413-95962002000300004
url https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/5974
identifier_str_mv 10.1590/S1413-95962002000300004
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv https://www.revistas.usp.br/bjvras/article/view/5974/7505
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia
publisher.none.fl_str_mv Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia
dc.source.none.fl_str_mv Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 39 Núm. 3 (2002); 129-135
Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; Vol. 39 No. 3 (2002); 129-135
Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; v. 39 n. 3 (2002); 129-135
Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science; V. 39 N. 3 (2002); 129-135
1678-4456
1413-9596
reponame:Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
instname:Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)
instacron:USP
instname_str Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
collection Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
repository.name.fl_str_mv Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (FMVZ-USP)
repository.mail.fl_str_mv bjvras@usp.br
_version_ 1797051555927556096