Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Castro, Ruth Elizabeth Ortiz
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-09122021-125029/
Resumo: Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 foi isolado na década de 1960 a partir de uma amostra de solo brasileira. Produz a antraciclina cosmomicina D, que tem atividade antitumoral e atraiu interesse por causa de seu padrão peculiar de glicosilação. Após anos de estudos sobre a molécula da cosmomicina e sua via biossintética, o estudo do cluster genético permitiu identificar os produtos codificados em cada ORF e agrupá-los, de acordo com sua funcionalidade, em genes envolvidos na biossíntese de agliconas, modificação da aglicona, biossíntese de açúcares, glicosiltransferases, genes de resistência e genes com função desconhecida. Entretanto o tamanho exato do cluster e o número de genes permaneceram desconhecidos. Neste estudo concluímos que o cluster biossintético da cosmomicina D em Streptomyces olindensis é constituído por 38 ORFs, tendo como extremos definidos ORF17 cosU e ORF54 cosV G1Pdt (glicose-1-fosfato-timidiltransferase); e que o cluster da cosmomicina tem um tamanho de aproximadamente 40 kb (39,972 pb). Estudamos também os genes cosY e cosM. Quando cosY foi inativado, a produção de cosmomicina aumentou, indicando uma potencial atividade reguladora. Para cosK, a inativação produziu um desvio na via biossintética levando à síntese de substâncias possivelmente inéditas. Estudos adicionais são necessários para estabelecer a real função desses dois genes.
id USP_0028671b3b75f3f9912e618cb403d40f
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-09122021-125029
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.Characterization of putative biosynthetic genes of the antitumor cosmomycin D.Streptomyces olindensisStreptomyces olindensisanthracyclinesantraciclinasbiosynthetic clustercluster biossintéticocosmomicinacosmomycingene reguladorregulatory geneStreptomyces olindensis DAUFPE 5622 foi isolado na década de 1960 a partir de uma amostra de solo brasileira. Produz a antraciclina cosmomicina D, que tem atividade antitumoral e atraiu interesse por causa de seu padrão peculiar de glicosilação. Após anos de estudos sobre a molécula da cosmomicina e sua via biossintética, o estudo do cluster genético permitiu identificar os produtos codificados em cada ORF e agrupá-los, de acordo com sua funcionalidade, em genes envolvidos na biossíntese de agliconas, modificação da aglicona, biossíntese de açúcares, glicosiltransferases, genes de resistência e genes com função desconhecida. Entretanto o tamanho exato do cluster e o número de genes permaneceram desconhecidos. Neste estudo concluímos que o cluster biossintético da cosmomicina D em Streptomyces olindensis é constituído por 38 ORFs, tendo como extremos definidos ORF17 cosU e ORF54 cosV G1Pdt (glicose-1-fosfato-timidiltransferase); e que o cluster da cosmomicina tem um tamanho de aproximadamente 40 kb (39,972 pb). Estudamos também os genes cosY e cosM. Quando cosY foi inativado, a produção de cosmomicina aumentou, indicando uma potencial atividade reguladora. Para cosK, a inativação produziu um desvio na via biossintética levando à síntese de substâncias possivelmente inéditas. Estudos adicionais são necessários para estabelecer a real função desses dois genes.Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 was isolated in the 1960s from a Brazilian soil sample. It produces the anthracycline cosmomycin D, which has antitumor activity and has attracted interest because of its distinctive glycosylation pattern. After many years and studies on the cosmomycin molecule and its biosynthetic pathway, the study of the gene cluster has allowed to identify the products encoded by each ORF and grouped them according to their functionality in genes involved in aglycone biosynthesis, aglycone modification, sugar biosynthesis, glycosyltransferases, resistance genes and genes with unknown function. However, the exact size of the cluster and number of genes remained unknown. In this study we can conclude that the cosmomycin D cluster in Streptomyces olindensis is comprised of 38 ORFs, having as defined ends ORF17 cosU and ORF54 cosV G1Pdt (glucose-1-phosphate thymidyltransferase); and that the cosmomycin cluster has a size of approximately 40Kb (39.972bp). We also studied the cosY and cosM genes. When cosY was inactivated the production of cosmomycin increased, indicating a potential regulatory activity. The cosK inactivation lead to a deviation in the biosynthetic pathway leading to the synthesis of probably new substances. Additional studies are necessary to establish the real functions of these two genes.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMaldonado, Gabriel PadillaCastro, Ruth Elizabeth Ortiz2019-07-24info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-09122021-125029/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-12-09T13:00:29Zoai:teses.usp.br:tde-09122021-125029Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-12-09T13:00:29Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
Characterization of putative biosynthetic genes of the antitumor cosmomycin D.
title Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
spellingShingle Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
Castro, Ruth Elizabeth Ortiz
Streptomyces olindensis
Streptomyces olindensis
anthracyclines
antraciclinas
biosynthetic cluster
cluster biossintético
cosmomicina
cosmomycin
gene regulador
regulatory gene
title_short Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
title_full Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
title_fullStr Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
title_full_unstemmed Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
title_sort Caracterização de genes putativos biossintéticos do antitumoral cosmomicina D.
author Castro, Ruth Elizabeth Ortiz
author_facet Castro, Ruth Elizabeth Ortiz
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Maldonado, Gabriel Padilla
dc.contributor.author.fl_str_mv Castro, Ruth Elizabeth Ortiz
dc.subject.por.fl_str_mv Streptomyces olindensis
Streptomyces olindensis
anthracyclines
antraciclinas
biosynthetic cluster
cluster biossintético
cosmomicina
cosmomycin
gene regulador
regulatory gene
topic Streptomyces olindensis
Streptomyces olindensis
anthracyclines
antraciclinas
biosynthetic cluster
cluster biossintético
cosmomicina
cosmomycin
gene regulador
regulatory gene
description Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 foi isolado na década de 1960 a partir de uma amostra de solo brasileira. Produz a antraciclina cosmomicina D, que tem atividade antitumoral e atraiu interesse por causa de seu padrão peculiar de glicosilação. Após anos de estudos sobre a molécula da cosmomicina e sua via biossintética, o estudo do cluster genético permitiu identificar os produtos codificados em cada ORF e agrupá-los, de acordo com sua funcionalidade, em genes envolvidos na biossíntese de agliconas, modificação da aglicona, biossíntese de açúcares, glicosiltransferases, genes de resistência e genes com função desconhecida. Entretanto o tamanho exato do cluster e o número de genes permaneceram desconhecidos. Neste estudo concluímos que o cluster biossintético da cosmomicina D em Streptomyces olindensis é constituído por 38 ORFs, tendo como extremos definidos ORF17 cosU e ORF54 cosV G1Pdt (glicose-1-fosfato-timidiltransferase); e que o cluster da cosmomicina tem um tamanho de aproximadamente 40 kb (39,972 pb). Estudamos também os genes cosY e cosM. Quando cosY foi inativado, a produção de cosmomicina aumentou, indicando uma potencial atividade reguladora. Para cosK, a inativação produziu um desvio na via biossintética levando à síntese de substâncias possivelmente inéditas. Estudos adicionais são necessários para estabelecer a real função desses dois genes.
publishDate 2019
dc.date.none.fl_str_mv 2019-07-24
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-09122021-125029/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-09122021-125029/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815256849314742272