Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Campos Junior, Ricardo Fernandes
Data de Publicação: 2012
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-22012013-102652/
Resumo: Dendrocolaptes platyrostris é uma espécie de ave florestal associada às matas de galeria do corredor de vegetação aberta da América do sul (D. p. intermedius) e à Floresta Atlântica (D. p. platyrostris). Em um trabalho anterior, foi observada estrutura genética populacional associada às subespécies, além de dois clados dentro da Floresta Atlântica e evidências de expansão na população do sul, o que é compatível com o modelo Carnaval-Moritz. Utilizando approximate Bayesian computation, o presente trabalho avaliou a diversidade genética de dois marcadores nucleares e um marcador mitocondrial dessa espécie com o objetivo de comparar os resultados obtidos anteriormente com os obtidos utilizando uma estratégia multi-locus e considerando variação coalescente. Os resultados obtidos sugerem uma relação de politomia entre as populações que se separaram durante o último período interglacial, mas expandiram após o último máximo glacial. Este resultado é consistente com o modelo de Carnaval-Moritz, o qual sugere que as populações sofreram alterações demográficas devido às alterações climáticas ocorridas nestes períodos. Trabalhos futuros incluindo outros marcadores e modelos que incluam estabilidade em algumas populações e expansão em outras são necessários para avaliar o presente resultado
id USP_045900eb0c11237de98e0daebfc4cabe
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-22012013-102652
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do QuaternárioPopulation divergence and demographic expansion of Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) in the late QuaternaryApproximate Bayesian computationApproximate Bayesian computationDemographic expansionExpansão demográficaFilogeografiaPhylogeographyDendrocolaptes platyrostris é uma espécie de ave florestal associada às matas de galeria do corredor de vegetação aberta da América do sul (D. p. intermedius) e à Floresta Atlântica (D. p. platyrostris). Em um trabalho anterior, foi observada estrutura genética populacional associada às subespécies, além de dois clados dentro da Floresta Atlântica e evidências de expansão na população do sul, o que é compatível com o modelo Carnaval-Moritz. Utilizando approximate Bayesian computation, o presente trabalho avaliou a diversidade genética de dois marcadores nucleares e um marcador mitocondrial dessa espécie com o objetivo de comparar os resultados obtidos anteriormente com os obtidos utilizando uma estratégia multi-locus e considerando variação coalescente. Os resultados obtidos sugerem uma relação de politomia entre as populações que se separaram durante o último período interglacial, mas expandiram após o último máximo glacial. Este resultado é consistente com o modelo de Carnaval-Moritz, o qual sugere que as populações sofreram alterações demográficas devido às alterações climáticas ocorridas nestes períodos. Trabalhos futuros incluindo outros marcadores e modelos que incluam estabilidade em algumas populações e expansão em outras são necessários para avaliar o presente resultadoDendrocolaptes platyrostris is a forest specialist bird associated to gallery forests of the open vegetation corridor of South America (D. p. intermedius) and to the Atlantic forest (D. p. platyrostris). A previous study showed a population genetic structure associated with the subspecies, two clades within the Atlantic forest, and evidence of population expansion in the south, which is compatible with Carnaval- Moritz\'s model. The present study evaluated the genetic diversity of two nuclear and one mitochondrial markers of this species using approximate Bayesian computation, in order to compare the results previously obtained with those based on a multi-locus strategy and considering the coalescent variation. The results suggest a polytomic relationship among the populations that split during the last interglacial period and expanded after the last glacial maximum. This result is consistent with the model of Carnaval-Moritz, which suggests that populations have undergone demographic changes due to climatic changes that occurred in these periods. Future studies including other markers and models that include stability in some populations and expansion in others are needed to evaluate the present resultBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMiyaki, Cristina YumiCampos Junior, Ricardo Fernandes2012-10-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-22012013-102652/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-07-28T16:10:35Zoai:teses.usp.br:tde-22012013-102652Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-07-28T16:10:35Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
Population divergence and demographic expansion of Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) in the late Quaternary
title Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
spellingShingle Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
Campos Junior, Ricardo Fernandes
Approximate Bayesian computation
Approximate Bayesian computation
Demographic expansion
Expansão demográfica
Filogeografia
Phylogeography
title_short Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
title_full Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
title_fullStr Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
title_full_unstemmed Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
title_sort Divergência populacional e expansão demográfica de Dendrocolaptes platyrostris (Aves: Dendrocolaptidae) no final do Quaternário
author Campos Junior, Ricardo Fernandes
author_facet Campos Junior, Ricardo Fernandes
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Miyaki, Cristina Yumi
dc.contributor.author.fl_str_mv Campos Junior, Ricardo Fernandes
dc.subject.por.fl_str_mv Approximate Bayesian computation
Approximate Bayesian computation
Demographic expansion
Expansão demográfica
Filogeografia
Phylogeography
topic Approximate Bayesian computation
Approximate Bayesian computation
Demographic expansion
Expansão demográfica
Filogeografia
Phylogeography
description Dendrocolaptes platyrostris é uma espécie de ave florestal associada às matas de galeria do corredor de vegetação aberta da América do sul (D. p. intermedius) e à Floresta Atlântica (D. p. platyrostris). Em um trabalho anterior, foi observada estrutura genética populacional associada às subespécies, além de dois clados dentro da Floresta Atlântica e evidências de expansão na população do sul, o que é compatível com o modelo Carnaval-Moritz. Utilizando approximate Bayesian computation, o presente trabalho avaliou a diversidade genética de dois marcadores nucleares e um marcador mitocondrial dessa espécie com o objetivo de comparar os resultados obtidos anteriormente com os obtidos utilizando uma estratégia multi-locus e considerando variação coalescente. Os resultados obtidos sugerem uma relação de politomia entre as populações que se separaram durante o último período interglacial, mas expandiram após o último máximo glacial. Este resultado é consistente com o modelo de Carnaval-Moritz, o qual sugere que as populações sofreram alterações demográficas devido às alterações climáticas ocorridas nestes períodos. Trabalhos futuros incluindo outros marcadores e modelos que incluam estabilidade em algumas populações e expansão em outras são necessários para avaliar o presente resultado
publishDate 2012
dc.date.none.fl_str_mv 2012-10-29
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-22012013-102652/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-22012013-102652/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257257566273536