Análise dos substratos da MMP-2 em tecidos cardíacos usando a proteômica quantitativa N-terminal multiplex
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/58/58138/tde-14022023-122058/ |
Resumo: | As metaloproteinases da matriz (MMPs) pertencem à família das endopeptidases e são dependentes de zinco e cálcio. Elas são proteases que degradam proteínas da matriz extracelular (MEC), como laminina, elastina, colágeno e proteoglicanos. As MMPs estão envolvidas em várias funções e vários processos patológicos devido à grande variedade de seus substratos. Entre os processos em que estão envolvidas estão: destruição e remodelação de tecidos, cicatrização, inflamação e progressão tumoral. Saber e controlar a atividade enzimática é altamente desejável para que possamos compreender e estudar seus papéis individuais e propor novos agentes terapêuticos. Neste trabalho procuramos identificar os substratos da metaloproteinase da matriz 2 (MMP-2) no coração, para tentar compreender o seu papel proteolítico e seus produtos de clivagens. Isso foi feito com o uso de análise de peptídeos representados diferentemente no coração de animais (ratos) que receberam a MMP-2 recombinante humana (rhMMP-2) por 4 semanas. Essa análise envolveu a análise proteômica, seguindo-se a busca dos resultados em bancos de dados de vias de cascatas de proteínas. Os resultados revelaram que os principais conjuntos de proteínas que se modificaram nos animais que receberam a rhMMP-2 em relação aos animais controles foram enzimas de vias metabólicas do coração, sendo as 3 principais: CAC, TCA e KEGG. Os resultados também mostram não ter havido diferença na quantidade de peptídeos que compõe a maior parte das proteínas estruturais do coração, sugerindo que os resultados de alteração funcional vistos nos corações destes animais estejam mais associados a alterações metabólicas do que a alterações de filamentos proteicos envolvidos nos batimentos cardíacos ou nas junções celulares. Este é o primeiro estudo, ao que sabemos, que mostra a expressão diferencial de proteínas de vias metabólicas em corações expostos a MMP-2 exógena. |
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Análise dos substratos da MMP-2 em tecidos cardíacos usando a proteômica quantitativa N-terminal multiplexAnalysis of MMP-2 substrates in cardiac tissues using quantitative N-terminal multiplex proteomicsCardiovascular diseasesDoenças cardiovascularesMetalloproteinaseMetaloproteinaseProteômicaProteomicsAs metaloproteinases da matriz (MMPs) pertencem à família das endopeptidases e são dependentes de zinco e cálcio. Elas são proteases que degradam proteínas da matriz extracelular (MEC), como laminina, elastina, colágeno e proteoglicanos. As MMPs estão envolvidas em várias funções e vários processos patológicos devido à grande variedade de seus substratos. Entre os processos em que estão envolvidas estão: destruição e remodelação de tecidos, cicatrização, inflamação e progressão tumoral. Saber e controlar a atividade enzimática é altamente desejável para que possamos compreender e estudar seus papéis individuais e propor novos agentes terapêuticos. Neste trabalho procuramos identificar os substratos da metaloproteinase da matriz 2 (MMP-2) no coração, para tentar compreender o seu papel proteolítico e seus produtos de clivagens. Isso foi feito com o uso de análise de peptídeos representados diferentemente no coração de animais (ratos) que receberam a MMP-2 recombinante humana (rhMMP-2) por 4 semanas. Essa análise envolveu a análise proteômica, seguindo-se a busca dos resultados em bancos de dados de vias de cascatas de proteínas. Os resultados revelaram que os principais conjuntos de proteínas que se modificaram nos animais que receberam a rhMMP-2 em relação aos animais controles foram enzimas de vias metabólicas do coração, sendo as 3 principais: CAC, TCA e KEGG. Os resultados também mostram não ter havido diferença na quantidade de peptídeos que compõe a maior parte das proteínas estruturais do coração, sugerindo que os resultados de alteração funcional vistos nos corações destes animais estejam mais associados a alterações metabólicas do que a alterações de filamentos proteicos envolvidos nos batimentos cardíacos ou nas junções celulares. Este é o primeiro estudo, ao que sabemos, que mostra a expressão diferencial de proteínas de vias metabólicas em corações expostos a MMP-2 exógena.Matrix metalloproteinases (MMPs) belong to the endopeptidase family and are dependent on zinc and calcium. They are proteases that degrade extracellular matrix (ECM) proteins such as laminin, elastin, collagen, and proteoglycans. As MMPs are involved in various functions and various pathological processes due to the wide variety of their substrates. Among the processes in which they are involved are: tissue destruction and remodeling, wound healing, inflammation and tumor progression. Knowing and controlling enzymatic activity is highly desirable so that we can understand and study their individual roles and propose new therapeutic agents. In this work, we tried to identify substrates of matrix metalloproteinase 2 (MMP-2) in the heart, in order to try to understand its proteolytic role and its cleavage products. This was done using differently represented peptide analysis in the hearts of animals (rats) that received recombinant human MMP-2 (rhMMP-2) for 4 weeks. This analysis involved proteomics analysis, followed by searching the protein cascade pathway databases for results. The results revealed that the main sets of proteins that were modified in the animals that received rhMMP-2 in relation to the control animals were enzymes of the heart\'s metabolic pathways, the 3 main ones being: CAC, TCA and KEGG. The results also show that there was no difference in the number of peptides that make up most of the heart\'s structural proteins, suggesting that the functional alteration results seen in the hearts of these animals are more associated with metabolic alterations than with alterations in the protein filaments involved in the processes. heartbeat or cell junctions. This is the first study, to our knowledge, that shows the differential expression of metabolic pathway proteins in hearts exposed to exogenous MMP-2.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGerlach, Raquel FernandaValle, Valéria Beatriz do2022-12-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/58/58138/tde-14022023-122058/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-04-17T15:39:14Zoai:teses.usp.br:tde-14022023-122058Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-04-17T15:39:14Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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As metaloproteinases da matriz (MMPs) pertencem à família das endopeptidases e são dependentes de zinco e cálcio. Elas são proteases que degradam proteínas da matriz extracelular (MEC), como laminina, elastina, colágeno e proteoglicanos. As MMPs estão envolvidas em várias funções e vários processos patológicos devido à grande variedade de seus substratos. Entre os processos em que estão envolvidas estão: destruição e remodelação de tecidos, cicatrização, inflamação e progressão tumoral. Saber e controlar a atividade enzimática é altamente desejável para que possamos compreender e estudar seus papéis individuais e propor novos agentes terapêuticos. Neste trabalho procuramos identificar os substratos da metaloproteinase da matriz 2 (MMP-2) no coração, para tentar compreender o seu papel proteolítico e seus produtos de clivagens. Isso foi feito com o uso de análise de peptídeos representados diferentemente no coração de animais (ratos) que receberam a MMP-2 recombinante humana (rhMMP-2) por 4 semanas. Essa análise envolveu a análise proteômica, seguindo-se a busca dos resultados em bancos de dados de vias de cascatas de proteínas. Os resultados revelaram que os principais conjuntos de proteínas que se modificaram nos animais que receberam a rhMMP-2 em relação aos animais controles foram enzimas de vias metabólicas do coração, sendo as 3 principais: CAC, TCA e KEGG. Os resultados também mostram não ter havido diferença na quantidade de peptídeos que compõe a maior parte das proteínas estruturais do coração, sugerindo que os resultados de alteração funcional vistos nos corações destes animais estejam mais associados a alterações metabólicas do que a alterações de filamentos proteicos envolvidos nos batimentos cardíacos ou nas junções celulares. Este é o primeiro estudo, ao que sabemos, que mostra a expressão diferencial de proteínas de vias metabólicas em corações expostos a MMP-2 exógena. |
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