Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Puglia, Ana Lia Pradella
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-05122014-150500/
Resumo: O Semliki Forest Vírus recombinante (rSFV) vem sendo apontado como um dos vetores virais mais promissores, tanto para a expressão de proteínas de interesse biotecnológico, como para a utilização como vetor vacinal. Neste trabalho obtivemos um rSFV carregando o gene da proteína verde fluorescente GFP (rSFV-GFP), que foi utilizado para a padronização de métodos de obtenção do vetor viral e de sua titulação, duas etapas importantes para os trabalhos que utilizam rSFVs. Por meio da análise da expressão da GFP em células BHK-21 infectadas por lotes de vírus obtidos por um reagente de transfecção lipídico ou por eletroporação, estabelecemos as melhores condições de obtenção dos rSFV e de sua utilização para a infecção e produção de proteínas recombinantes de interesse. Além disso, padronizamos criteriosamente uma metodologia de RT-PCR quantitativa (qRT-PCR) absoluta, baseada em uma curva padrão, para realizar a titulação de partículas rSFV, independentemente do gene heterólogo clonado. A análise direta da quantidade de células infectadas, por citometria de fluxo e por microscopia de fluorescência, fez do rSFV-GFP a ferramenta adequada para nossos estudos de titulação viral por qRT-PCR. Foi demonstrada a associação entre o número de cópias do RNA viral utilizado para a infecção das células e a quantidade de células expressando GFP. Essa abordagem levou ao desenvolvimento de competências técnica e tecnológica (construção, avaliação e titulação) que facilitarão a obtenção de outros rSFV de interesse. Concluímos que a eletroporação é o melhor método de obtenção das partículas e que o título viral, determinado por qRT-PCR, pode ser utilizado para calcular o volume de um lote de rSFV necessário para obter a multiplicidade de infeção desejada.
id USP_15432d0fbbe384463709a52ef5009bac
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-05122014-150500
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.Production and utilization of an SFV vector expressing GFP.GFPGFPqRT-PCRqRT-PCRSemliki Forest virusSemliki Forest vírusO Semliki Forest Vírus recombinante (rSFV) vem sendo apontado como um dos vetores virais mais promissores, tanto para a expressão de proteínas de interesse biotecnológico, como para a utilização como vetor vacinal. Neste trabalho obtivemos um rSFV carregando o gene da proteína verde fluorescente GFP (rSFV-GFP), que foi utilizado para a padronização de métodos de obtenção do vetor viral e de sua titulação, duas etapas importantes para os trabalhos que utilizam rSFVs. Por meio da análise da expressão da GFP em células BHK-21 infectadas por lotes de vírus obtidos por um reagente de transfecção lipídico ou por eletroporação, estabelecemos as melhores condições de obtenção dos rSFV e de sua utilização para a infecção e produção de proteínas recombinantes de interesse. Além disso, padronizamos criteriosamente uma metodologia de RT-PCR quantitativa (qRT-PCR) absoluta, baseada em uma curva padrão, para realizar a titulação de partículas rSFV, independentemente do gene heterólogo clonado. A análise direta da quantidade de células infectadas, por citometria de fluxo e por microscopia de fluorescência, fez do rSFV-GFP a ferramenta adequada para nossos estudos de titulação viral por qRT-PCR. Foi demonstrada a associação entre o número de cópias do RNA viral utilizado para a infecção das células e a quantidade de células expressando GFP. Essa abordagem levou ao desenvolvimento de competências técnica e tecnológica (construção, avaliação e titulação) que facilitarão a obtenção de outros rSFV de interesse. Concluímos que a eletroporação é o melhor método de obtenção das partículas e que o título viral, determinado por qRT-PCR, pode ser utilizado para calcular o volume de um lote de rSFV necessário para obter a multiplicidade de infeção desejada.The recombinant Semliki Forest Virus (rSFV) has been considered as one of the most promising viral vectors, both for the expression of proteins of biotechnological interest or as a vector for immunizations. In this study, an rSFV carrying the gene of the green fluorescent protein (GFP) was obtained (rSFV-GFP) and used for the standardization of rSFV production and of a novel titration methodology. Through the analysis of the amounts of GFP expressed in BHK-21 cells infected with virus stocks obtained by transfection with a lipid reagent or electroporation, we established the best conditions for rSFV production based on the production of this recombinant protein. In addition, a standardized method of absolute quantitative RT-PCR (qRT-PCR), based in a standard curve and applicable to virtually all rSFV particles, regardless of the heterologous gene cloned, was validated. The direct analysis of the quantity of infected cells, by flow cytometry and fluorescence microscopy, confirmed that the rSFV-GFP was an appropriated tool to support ours studies of viral titration by qRT-PCR. It was demonstrated the association between the amount of copies of viral RNA used for culture infection and the amount of GFP expression. This approach led to the development of technical and technological competence (construction, evaluation and titration) in the laboratory, that shall help the establishment of other rSFV of interest. We concluded that electroporation is the best methodology to obtain rSFV particles and the viral titre, as determined by qRT-PCR, can be used to calculate the volume of an rSFV stock necessary to obtain the desired multiplicity of infection.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPAstray, Renato ManciniPuglia, Ana Lia Pradella2014-04-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-05122014-150500/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-12-09T05:00:18Zoai:teses.usp.br:tde-05122014-150500Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-12-09T05:00:18Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
Production and utilization of an SFV vector expressing GFP.
title Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
spellingShingle Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
Puglia, Ana Lia Pradella
GFP
GFP
qRT-PCR
qRT-PCR
Semliki Forest virus
Semliki Forest vírus
title_short Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
title_full Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
title_fullStr Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
title_full_unstemmed Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
title_sort Obtenção e utilização do vetor viral SFV expressando GFP.
author Puglia, Ana Lia Pradella
author_facet Puglia, Ana Lia Pradella
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Astray, Renato Mancini
dc.contributor.author.fl_str_mv Puglia, Ana Lia Pradella
dc.subject.por.fl_str_mv GFP
GFP
qRT-PCR
qRT-PCR
Semliki Forest virus
Semliki Forest vírus
topic GFP
GFP
qRT-PCR
qRT-PCR
Semliki Forest virus
Semliki Forest vírus
description O Semliki Forest Vírus recombinante (rSFV) vem sendo apontado como um dos vetores virais mais promissores, tanto para a expressão de proteínas de interesse biotecnológico, como para a utilização como vetor vacinal. Neste trabalho obtivemos um rSFV carregando o gene da proteína verde fluorescente GFP (rSFV-GFP), que foi utilizado para a padronização de métodos de obtenção do vetor viral e de sua titulação, duas etapas importantes para os trabalhos que utilizam rSFVs. Por meio da análise da expressão da GFP em células BHK-21 infectadas por lotes de vírus obtidos por um reagente de transfecção lipídico ou por eletroporação, estabelecemos as melhores condições de obtenção dos rSFV e de sua utilização para a infecção e produção de proteínas recombinantes de interesse. Além disso, padronizamos criteriosamente uma metodologia de RT-PCR quantitativa (qRT-PCR) absoluta, baseada em uma curva padrão, para realizar a titulação de partículas rSFV, independentemente do gene heterólogo clonado. A análise direta da quantidade de células infectadas, por citometria de fluxo e por microscopia de fluorescência, fez do rSFV-GFP a ferramenta adequada para nossos estudos de titulação viral por qRT-PCR. Foi demonstrada a associação entre o número de cópias do RNA viral utilizado para a infecção das células e a quantidade de células expressando GFP. Essa abordagem levou ao desenvolvimento de competências técnica e tecnológica (construção, avaliação e titulação) que facilitarão a obtenção de outros rSFV de interesse. Concluímos que a eletroporação é o melhor método de obtenção das partículas e que o título viral, determinado por qRT-PCR, pode ser utilizado para calcular o volume de um lote de rSFV necessário para obter a multiplicidade de infeção desejada.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-04-28
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-05122014-150500/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-05122014-150500/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815256752511254528