Mapas de ligação de Citrus sunki Hort. ex. Tan. e Poncirus trifoliataL.) Raf. cv. Rubidoux e localização do gene de resistência ao vírus da tristeza
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 1997 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20231122-093602/ |
Resumo: | Mapas de ligação foram construídos para indivíduos de Citrus sunki Hort. ex. Tan. e Poncirus trifoliataL.) Raf. cv. Rubidoux explorando a estratégia de mapeamento pseudo-testcross com marcadores RAPD. A partir de cruzamentos controlados realizados em 1993 foram obtidos 314 indivíduos F1. Dois conjuntos de dados foram obtidos, um para cada progenitor. As análises de ligação foram realizadas utilizando o programa MAPMAKER para Macintosh versão 2.0 a um LOD > 4,0 e uma frequência máxima de recombinação (θ) = 0,30. Um total de 208 primers decâmeros de sequência arbitrária foram utilizados para selecionar aqueles que mostravam polimorfismo na progênie. A configuração pseudo-testcross foi detectada por 78 primers onde o marcador estava presente em um parental, ausente em outro e segregava na F1. Os 78 "primers" selecionados foram utilizados para análise RAPD em 80 indivíduos da progênie F1 produzindo um total de 168 marcadores. A análise de ligação dos Iocos revelou que 123 marcadores foram mapeados em 18 grupos de ligação (10 grupos de Sunki e 8 grupos de Rubidoux) enquanto que 45 marcadores não se ligaram a qualquer grupo. O comprimento total dos mapas foi de 732,32 cM para Sunki e 867,58 cM para Rubidoux com a distância entre marcadores variando de 0 a 43,8 cM (Kosambi). Marcadores moleculares ligados ao gene de imunidade ao vírus da tristeza dos citros foram mapeados no grupo de ligação l de Poncirus trifoliata (L.) Raf. cv. Rubidoux. O marcador encontrado mais próximo ao Ctv foi o OPAV12_ 470 localizado a 17,8 cM do gene. Cem híbridos obtidos no cruzamento entre Citrus sunki Hort. ex. Tan. e Poncirus trifoliata (L.) Raf. Rubidoux foram também avaliados quanto sua capacidade de multiplicação in vitro e enraizamento de estacas, visando futuros trabalhos de seleção à gomose de Phytophthora. Os marcadores RAPD foram utilizados também para a identificação de plântulas nucelares e zigóticas dos cruzamentos: laranja Caipira (Citrus sinensis L. Osbeck) x laranja Azeda (Citrus aurantium L.) e laranja Caipira (Citrus sinensis L. Osbeck) x limão Cravo (Citrus limonia Osbeck), sendo que foram obtidos 17 (6%) e 8 (9,6%) híbridos em cada cruzamento, respectivamente. |
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Mapas de ligação de Citrus sunki Hort. ex. Tan. e Poncirus trifoliataL.) Raf. cv. Rubidoux e localização do gene de resistência ao vírus da tristezaGenetic linkage mapping of Citrus sunki Hort. ex. Tan. and Poncirus trifoliata (L.) Raf. cv. Rubidoux and localization of the citrus tristeza virus resistance geneCITROSCLOSTEROVIRUSGENESMAPEAMENTO GENÉTICOMARCADOR MOLECULARPORTA-ENXERTOSRESISTÊNCIA GENÉTICA VEGETALTANGERINA SUNKITRIFOLIATATRISTEZA CÍTRICAMapas de ligação foram construídos para indivíduos de Citrus sunki Hort. ex. Tan. e Poncirus trifoliataL.) Raf. cv. Rubidoux explorando a estratégia de mapeamento pseudo-testcross com marcadores RAPD. A partir de cruzamentos controlados realizados em 1993 foram obtidos 314 indivíduos F1. Dois conjuntos de dados foram obtidos, um para cada progenitor. As análises de ligação foram realizadas utilizando o programa MAPMAKER para Macintosh versão 2.0 a um LOD > 4,0 e uma frequência máxima de recombinação (θ) = 0,30. Um total de 208 primers decâmeros de sequência arbitrária foram utilizados para selecionar aqueles que mostravam polimorfismo na progênie. A configuração pseudo-testcross foi detectada por 78 primers onde o marcador estava presente em um parental, ausente em outro e segregava na F1. Os 78 "primers" selecionados foram utilizados para análise RAPD em 80 indivíduos da progênie F1 produzindo um total de 168 marcadores. A análise de ligação dos Iocos revelou que 123 marcadores foram mapeados em 18 grupos de ligação (10 grupos de Sunki e 8 grupos de Rubidoux) enquanto que 45 marcadores não se ligaram a qualquer grupo. O comprimento total dos mapas foi de 732,32 cM para Sunki e 867,58 cM para Rubidoux com a distância entre marcadores variando de 0 a 43,8 cM (Kosambi). Marcadores moleculares ligados ao gene de imunidade ao vírus da tristeza dos citros foram mapeados no grupo de ligação l de Poncirus trifoliata (L.) Raf. cv. Rubidoux. O marcador encontrado mais próximo ao Ctv foi o OPAV12_ 470 localizado a 17,8 cM do gene. Cem híbridos obtidos no cruzamento entre Citrus sunki Hort. ex. Tan. e Poncirus trifoliata (L.) Raf. Rubidoux foram também avaliados quanto sua capacidade de multiplicação in vitro e enraizamento de estacas, visando futuros trabalhos de seleção à gomose de Phytophthora. Os marcadores RAPD foram utilizados também para a identificação de plântulas nucelares e zigóticas dos cruzamentos: laranja Caipira (Citrus sinensis L. Osbeck) x laranja Azeda (Citrus aurantium L.) e laranja Caipira (Citrus sinensis L. Osbeck) x limão Cravo (Citrus limonia Osbeck), sendo que foram obtidos 17 (6%) e 8 (9,6%) híbridos em cada cruzamento, respectivamente.Genetic linkage maps for Citrus sunki Hort. ex. Tan. and Poncirus trifoliata (L.) Raf. cv. Rubidoux have been developed exploiting the pseudo-testcross mapping strategy using RAPD markers. From controlled crosses 314 F1 zygotic progeny individuals were obtained. Two separate data sets were generated, one for each parent. Preliminary linkage analysis was carried out using MAPMAKER V2.0 for Mac under a phase-unknown backcross model at a LOD > 4.0 and max. θ = 0.30. A total of 208 arbitrary 10-mer primers were screened for segregating RAPD markers. Pseudo-testcross mating configurations were displayed by 78 primers where the marker was present in one parent, absent in the other and segregating in the progeny. These 78 primers were run on 80 progeny amplifying a total of 168 RAPD markers. Linkage analysis revealed that 123 of these RAPD loci fell into 18 linkage groups (10 groups for Sunki e 8 groups for Rubidoux) while 45 loci remained unassigned to any linkage group. The total length of the maps was 732.32 cM for Sunki and 867.58 cM for Rubidoux with the distance between markers ranging from 0 to 43.8 cM. A QTL for citrus tristeza virus immunity in Poncirus trifoliata was mapped. The Ctv gene region was found to be located on linkage group I of Poncirus trifoliata (L.) Raf. cv. Rubidoux. The closest molecular marker to the CTV immunity locus was OPAV12_470 at 17.8 cM. One hundred hybrids obtained from the cross between Citrus sunki Hort. ex. Tan. and Poncirus trifoliata (L.) Raf. cv. Rubidoux were multiplied using micropropagation and rooting of stem cuttings. RAPD markers were also used to identify nucellar and zygotic seedlings in crosses of sweet orange Caipira (Citrus sinensis L. Osbeck) x sour orange (Citrus aurantium L.) and sweet orange Caipira (Citrus sinensis L. Osbeck) x Rangpur lime (Citrus limonia Osbeck. ln each cross, 17 (6%) and 8 (9.6%) hybrids were obtained, respectively.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPTulmann Neto, AugustoCristofani, Mariângela1997-03-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20231122-093602/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-11-24T18:57:05Zoai:teses.usp.br:tde-20231122-093602Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-11-24T18:57:05Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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