Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2006 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://doi.org/10.11606/T.95.2006.tde-09032007-172617 |
Resumo: | Nesta tese são apresentados um novo modelo estatístico para cálculo de probabilidade de paternidade e sua implementação em software. O modelo proposto utiliza o genótipo como informação básica, em contraste com outros modelos que usam alelos. Por esta diferença, o modelo proposto resulta mais abrangente, mas que, sob certas restrições, reproduz os resultados dos modelos que usam alelos. Este modelo foi implementado em um software que recebe descrições da genealogia e dos marcadores em uma linguagem dedicada a isso e constrói uma rede bayesiana para cada marcador. O usuário pode definir livremente a genealogia e os marcadores. O cálculo da probabilidade de paternidade é feito, sobre as redes construídas, por um software para inferência em redes bayesianas e a probabilidade de paternidade combinada considerando todos os marcadores é calculada, resultando em um \"índice de paternidade. |
id |
USP_19d5e1cc61943111abca4368c68e44f2 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-09032007-172617 |
network_acronym_str |
USP |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
repository_id_str |
2721 |
spelling |
info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação A Novel Model for Paternity Probability Calculation - Design and Implementation 2006-11-09Carlos Alberto de Braganca PereiraJorge Alberto AchcarFabio Gagliardi CozmanLouis Bernard KlaczkoPaulo Alberto OttoFábio NakanoUniversidade de São PauloBioinformáticaUSPBR Bayesian Networks DNA DNA Estatística índice de paternidade Microssatelite microssatélites Paternity Index Paternity Test Redes Bayesianas Short Tandem Repeat Short Tandem Repeat Statistics teste de paternidade Nesta tese são apresentados um novo modelo estatístico para cálculo de probabilidade de paternidade e sua implementação em software. O modelo proposto utiliza o genótipo como informação básica, em contraste com outros modelos que usam alelos. Por esta diferença, o modelo proposto resulta mais abrangente, mas que, sob certas restrições, reproduz os resultados dos modelos que usam alelos. Este modelo foi implementado em um software que recebe descrições da genealogia e dos marcadores em uma linguagem dedicada a isso e constrói uma rede bayesiana para cada marcador. O usuário pode definir livremente a genealogia e os marcadores. O cálculo da probabilidade de paternidade é feito, sobre as redes construídas, por um software para inferência em redes bayesianas e a probabilidade de paternidade combinada considerando todos os marcadores é calculada, resultando em um \"índice de paternidade. This thesis presents a novel statistical model for calculation of the probability of paternity and its implementation as a software. The proposed model uses genotype as basic information. Other models use alleles as basic information. As a result the proposed model is broader, in the sense that, under certain constraints the results from the other models are reproduced. The software implementation receives pedigree and markers data, in a specifically designed language, as input and builds one bayesian network for each marker. The user can freely define any pedigree and any marker. Paternity probabilities for each locus are calculated, from the built networks, by a software for inference on Bayesian Networks and these probabilities are combined into a single \"paternity index\". https://doi.org/10.11606/T.95.2006.tde-09032007-172617info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USP2023-12-21T18:31:11Zoai:teses.usp.br:tde-09032007-172617Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-12-22T12:22:18.254032Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
dc.title.pt.fl_str_mv |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação |
dc.title.alternative.en.fl_str_mv |
A Novel Model for Paternity Probability Calculation - Design and Implementation |
title |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação |
spellingShingle |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação Fábio Nakano |
title_short |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação |
title_full |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação |
title_fullStr |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação |
title_full_unstemmed |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação |
title_sort |
Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação |
author |
Fábio Nakano |
author_facet |
Fábio Nakano |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Carlos Alberto de Braganca Pereira |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Jorge Alberto Achcar |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Fabio Gagliardi Cozman |
dc.contributor.referee3.fl_str_mv |
Louis Bernard Klaczko |
dc.contributor.referee4.fl_str_mv |
Paulo Alberto Otto |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Fábio Nakano |
contributor_str_mv |
Carlos Alberto de Braganca Pereira Jorge Alberto Achcar Fabio Gagliardi Cozman Louis Bernard Klaczko Paulo Alberto Otto |
description |
Nesta tese são apresentados um novo modelo estatístico para cálculo de probabilidade de paternidade e sua implementação em software. O modelo proposto utiliza o genótipo como informação básica, em contraste com outros modelos que usam alelos. Por esta diferença, o modelo proposto resulta mais abrangente, mas que, sob certas restrições, reproduz os resultados dos modelos que usam alelos. Este modelo foi implementado em um software que recebe descrições da genealogia e dos marcadores em uma linguagem dedicada a isso e constrói uma rede bayesiana para cada marcador. O usuário pode definir livremente a genealogia e os marcadores. O cálculo da probabilidade de paternidade é feito, sobre as redes construídas, por um software para inferência em redes bayesianas e a probabilidade de paternidade combinada considerando todos os marcadores é calculada, resultando em um \"índice de paternidade. |
publishDate |
2006 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2006-11-09 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://doi.org/10.11606/T.95.2006.tde-09032007-172617 |
url |
https://doi.org/10.11606/T.95.2006.tde-09032007-172617 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade de São Paulo |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Bioinformática |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
USP |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade de São Paulo |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
instacron_str |
USP |
institution |
USP |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
_version_ |
1794502588393062400 |