Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Cardoso, Gisele Antoniazzi
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-03062019-140639/
Resumo: Espécies muito próximas da família Calliphoridae apresentam hábitos alimentares muito distintos, como alimentação em tecido de um hospedeiro vivo (parasitismo obrigatório) e alimentação em matéria orgânica em decomposição (necro-saprofagia). As origens evolu-tivas do hábito de parasitismo nesta família ainda são desconhecidas. No entanto, o que a torna ideal para o estudo da evolução do hábito alimentar é o aparecimento do parasitis-mo obrigatório em pelo menos três ocasiões independentes em sua história. Neste traba-lho, foram utilizados métodos para entender a evolução do parasitismo obrigatório assim como os genes envolvidos em três diferentes hábitos alimentares. O primeiro passo foi a inferência do hábito ancestral de Calliphoridae. Com o mapeamento de caracteres na filo-genia da família, o hábito ancestral mais provável seria a necro-saprofagia e o parasitismo obrigatório teria surgido posteriormente (independentemente do parasitismo facultati-vo). Ensaios de escolha com fêmeas permitiram a classificação precisa das espécies quan-to ao hábito alimentar. Ensaios com as larvas mostraram que tanto espécies necro-saprófagas como parasitas facultativas se alimentam tanto de carne em decomposição como carne fresca. Por outro lado, a espécie parasita obrigatória Co. hominivorax, apresentou um comportamento aversivo pela carne em decomposição e se desenvolveu somente na carne fresca. Esses resultados permitiram a formulação da hipótese de que o parasitismo tenha surgido a partir de uma mudança da atração das fêmeas pelos substra-tos para oviposição, seguida da especialização da larva parasita. A busca dos genes envol-vidos nos diferentes hábitos foi realizada por meio da análise de expressão gênica dife-rencial em dados de RNA-seq gerados para seis califorídeos. No total, foram encontrados 230 potenciais genes candidatos para investigação futura. Além disso, o padrão geral observado indicou que variações tanto nas regiões regulatórias como codificadoras, sofrem a ação predominante de seleção purificadora
id USP_321b39052b65bc422e44fcd94d3467f1
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-03062019-140639
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismoGene expression evolution in Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): a model to study feeding habitsChrysomyaChrysomyaCochlimyiaCochlimyiaLuciliaLuciliaRNA-seqRNA-seqEspécies muito próximas da família Calliphoridae apresentam hábitos alimentares muito distintos, como alimentação em tecido de um hospedeiro vivo (parasitismo obrigatório) e alimentação em matéria orgânica em decomposição (necro-saprofagia). As origens evolu-tivas do hábito de parasitismo nesta família ainda são desconhecidas. No entanto, o que a torna ideal para o estudo da evolução do hábito alimentar é o aparecimento do parasitis-mo obrigatório em pelo menos três ocasiões independentes em sua história. Neste traba-lho, foram utilizados métodos para entender a evolução do parasitismo obrigatório assim como os genes envolvidos em três diferentes hábitos alimentares. O primeiro passo foi a inferência do hábito ancestral de Calliphoridae. Com o mapeamento de caracteres na filo-genia da família, o hábito ancestral mais provável seria a necro-saprofagia e o parasitismo obrigatório teria surgido posteriormente (independentemente do parasitismo facultati-vo). Ensaios de escolha com fêmeas permitiram a classificação precisa das espécies quan-to ao hábito alimentar. Ensaios com as larvas mostraram que tanto espécies necro-saprófagas como parasitas facultativas se alimentam tanto de carne em decomposição como carne fresca. Por outro lado, a espécie parasita obrigatória Co. hominivorax, apresentou um comportamento aversivo pela carne em decomposição e se desenvolveu somente na carne fresca. Esses resultados permitiram a formulação da hipótese de que o parasitismo tenha surgido a partir de uma mudança da atração das fêmeas pelos substra-tos para oviposição, seguida da especialização da larva parasita. A busca dos genes envol-vidos nos diferentes hábitos foi realizada por meio da análise de expressão gênica dife-rencial em dados de RNA-seq gerados para seis califorídeos. No total, foram encontrados 230 potenciais genes candidatos para investigação futura. Além disso, o padrão geral observado indicou que variações tanto nas regiões regulatórias como codificadoras, sofrem a ação predominante de seleção purificadoraClosely related species of the Calliphoridae family have contrasting feeding habits, such as feeding on living tissues of a host (obligate parasitism) and feeding on decaying organ-ic matter (necro-saprophagy). The evolutionary origins of parasitism in Calliphoridae are still unknown. However, what makes this family ideal for the study of the evolution of feeding habits is the appearance of obligate parasitism in at least three independent oc-casions. In this study, we used methods to understand the evolution of parasitism, as well as the genes involved in in three different feeding habits. First, we inferred the ancestral habit of Calliphoridae. By using stochastic character mapping along the phylogeny of the family, the most likely ancestral habit was revealed as necro-saprophagy. Obligate para-sitism could have evolved later (with an independent evolution of the facultative parasit-ism). Two-choice essays with females allowed the precise classification of the species regarding their feeding habits. Essays with larvae showed that both necro-saprophagous and facultative parasites feed on decaying flesh and fresh meat. On the other hand, the obligate parasite, Co. hominivorax, showed an aversive behavior to decaying meat and able to develop only in fresh meat. These results led to the formulation of the hy-pothesis that parasitism arose from a shift in the attraction of the female attraction to new oviposition sites, followed by the specialization of the parasitic larvae. The search for the genes involved in the different feeding habits was performed through an analysis of differential gene expression using RNA-seq data generated for six califorids. Within a da-taset containing more than 1000 candidate genes, 230 genes potential candidate genes were found for future research. In addition, the general pattern observed indicated that both regulatory and coding regions have predominantly undergone the action of purifying selectionBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPTorres, Tatiana TeixeiraCardoso, Gisele Antoniazzi2019-03-08info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-03062019-140639/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-05-05T18:00:51Zoai:teses.usp.br:tde-03062019-140639Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-05-05T18:00:51Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
Gene expression evolution in Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): a model to study feeding habits
title Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
spellingShingle Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
Cardoso, Gisele Antoniazzi
Chrysomya
Chrysomya
Cochlimyia
Cochlimyia
Lucilia
Lucilia
RNA-seq
RNA-seq
title_short Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
title_full Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
title_fullStr Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
title_full_unstemmed Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
title_sort Evolução da expressão gênica em Calliphoridae (Diptera, Calyptratae): um modelo para o estudo do hábito de parasitismo
author Cardoso, Gisele Antoniazzi
author_facet Cardoso, Gisele Antoniazzi
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Torres, Tatiana Teixeira
dc.contributor.author.fl_str_mv Cardoso, Gisele Antoniazzi
dc.subject.por.fl_str_mv Chrysomya
Chrysomya
Cochlimyia
Cochlimyia
Lucilia
Lucilia
RNA-seq
RNA-seq
topic Chrysomya
Chrysomya
Cochlimyia
Cochlimyia
Lucilia
Lucilia
RNA-seq
RNA-seq
description Espécies muito próximas da família Calliphoridae apresentam hábitos alimentares muito distintos, como alimentação em tecido de um hospedeiro vivo (parasitismo obrigatório) e alimentação em matéria orgânica em decomposição (necro-saprofagia). As origens evolu-tivas do hábito de parasitismo nesta família ainda são desconhecidas. No entanto, o que a torna ideal para o estudo da evolução do hábito alimentar é o aparecimento do parasitis-mo obrigatório em pelo menos três ocasiões independentes em sua história. Neste traba-lho, foram utilizados métodos para entender a evolução do parasitismo obrigatório assim como os genes envolvidos em três diferentes hábitos alimentares. O primeiro passo foi a inferência do hábito ancestral de Calliphoridae. Com o mapeamento de caracteres na filo-genia da família, o hábito ancestral mais provável seria a necro-saprofagia e o parasitismo obrigatório teria surgido posteriormente (independentemente do parasitismo facultati-vo). Ensaios de escolha com fêmeas permitiram a classificação precisa das espécies quan-to ao hábito alimentar. Ensaios com as larvas mostraram que tanto espécies necro-saprófagas como parasitas facultativas se alimentam tanto de carne em decomposição como carne fresca. Por outro lado, a espécie parasita obrigatória Co. hominivorax, apresentou um comportamento aversivo pela carne em decomposição e se desenvolveu somente na carne fresca. Esses resultados permitiram a formulação da hipótese de que o parasitismo tenha surgido a partir de uma mudança da atração das fêmeas pelos substra-tos para oviposição, seguida da especialização da larva parasita. A busca dos genes envol-vidos nos diferentes hábitos foi realizada por meio da análise de expressão gênica dife-rencial em dados de RNA-seq gerados para seis califorídeos. No total, foram encontrados 230 potenciais genes candidatos para investigação futura. Além disso, o padrão geral observado indicou que variações tanto nas regiões regulatórias como codificadoras, sofrem a ação predominante de seleção purificadora
publishDate 2019
dc.date.none.fl_str_mv 2019-03-08
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-03062019-140639/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-03062019-140639/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815256638387388416