Expressão gênica da interação soja Meloidogyne javanica via microarranjos de DNA

• Autor(a) principal: Wendland, Adriane
• Data de Publicação: 2005
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-20200111-153812/
• topic: MELOIDOGYNE; DNA; EXPRESSÃO GÊNICA; GENÓTIPOS; NEMATOIDE DE GALHAS; RESISTÊNCIA GENÉTICA VEGETAL; SOJA

O nematóide de galhas da espécie Meloidogyne javanica é um patógeno de importância econômica na cultura da soja. O controle eficiente deste nematóide é na maioria das vezes, dependente da utilização de genótipos de soja resistente. A interação genética deste patossistema é complexa e a análise da expressão simultânea de genes envolvidos no processo infeccioso se faz necessária. O objetivo deste trabalho incluiu a identificação e caracterização de genes envolvidos na interação soja-nematóide por comparação das diferenças na expressão gênica ocorridas em genótipos de soja resistente (JF 7056) e suscetível (266-S) a M. javanica, por meio de microarranjos de DNA. Estes genótipos foram utilizados para a obtenção de quatro tratamentos: plantas resistentes inoculadas, não inoculadas, plantas suscetível inoculadas e não inoculadas com uma concentração de 6700 juvenis J2 de M. javanica. O RNA total foi extraído das raízes de cada tratamento e utilizado para construir bibliotecas de cDNA. Após o seqüenciamento, aproximadamente 1000 seqüências únicas foram amplificadas e fixadas em lâminas de vidro. As sondas de cDNA foram marcadas com Cy3 (plantas inoculada) e Cy5 (plantas não inoculadas) sendo estes fluoróforos incorporados diretamente por transcrição reversa. Os arranjos foram hibridizados e intensidade da imagem foi quantificada, normalizada e analisada através da ferramenta estatística SAM. A comparação dos padrões de expressão nas plantas resistentes e suscetíveis mostrou que no genótipo resistente JF 7056, 208 genes apresentam expressão diferencial. Entre eles, 158 genes foram induzidos e 50 genes foram reprimidos nas plantas resistentes a M. javanica. No genótipo suscetível 266-S, 103 genes apresentaram expressão diferencial, onde 76 genes foram induzidos e 27 foram reprimidos nas plantas suscetíveis a M. javanica. Estes genes foram distribuídos em diferentes categorias funcionais atribuídas por comparação de seqüências de outros organismos depositados em banco de dados. Entretanto, grande proporção dos genes expressos não apresentou homologia com outros genes conhecidos sendo provavelmente, específicos em soja. A expressão induzida nas plantas resistentes inoculadas está relacionada em sua maioria com genes que atuam na interação patógeno-hospedeiro. Entre os genes com expressão induzida no genótipo resistente está Hs1pro-1, (primeiro gene de Resistência a nematóides identificado em plantas) e PR proteína SH2 (relacionada a patogenicidade). A expressão induzida nas plantas suscetíveis inoculadas, no entanto, apresentou vários genes envolvidos com a produção de hormônios como etileno, auxina, giberelina e proteínas relacionadas à maturação e senescência em plantas