Avaliação de modelos in vitro para o estudo da inativação do cromossomo X em humanos
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-23102023-180216/ |
Resumo: | A inativação do cromossomo X (ICX) é um processo de compensação de dose que ocorre nas células fêmeas de mamíferos placentários. A ICX em humanos inicia-se por volta do estágio de blastocisto, e seu entendimento é prejudicado pelas dificuldades associadas ao uso de embriões em pesquisa. Para lidar com esse problema, nós avaliamos diferentes modelos para o estudo da ICX in vitro. Células no estado primed exibiram expressão monoalélica do gene MECP2, ligado ao cromossomo X, e uma única nuvem de XIST. Após conversão para o estado naive, expressão bialélica do gene MECP2 foi observada, assim como a ausência de nuvens de XIST durante as primeiras duas passagens. Avaliação de EPSCs in vitro e in silico sugeriram que essas células já passaram pelo processo de ICX. Resultados similares foram observados para células cultivadas no meio 4CL. Depois de nova conversão para o estado primed, células naive cultivadas em 5iLA passaram pela inativação do mesmo alelo do gene MECP2 previamente inativo. Por outro lado, blastoides gerados a partir de células cultivadas no meio PXGL demonstraram ICX progressiva e aleatória, apesar de viés para re-inativação do alelo de MECP2 previamente inativo ter sido observado. Esses resultados sugerem que blastoides humanos podem ser usados para o estudo da ICX humana in vitro. |
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Avaliação de modelos in vitro para o estudo da inativação do cromossomo X em humanosEvaluation of in vitro models for the study of human X chromosome inactivationBlastoidesBlastoidsCélulas tronco pluripotentesInativação do cromossomo XPluripotent stem cellsX chromosome inactivationA inativação do cromossomo X (ICX) é um processo de compensação de dose que ocorre nas células fêmeas de mamíferos placentários. A ICX em humanos inicia-se por volta do estágio de blastocisto, e seu entendimento é prejudicado pelas dificuldades associadas ao uso de embriões em pesquisa. Para lidar com esse problema, nós avaliamos diferentes modelos para o estudo da ICX in vitro. Células no estado primed exibiram expressão monoalélica do gene MECP2, ligado ao cromossomo X, e uma única nuvem de XIST. Após conversão para o estado naive, expressão bialélica do gene MECP2 foi observada, assim como a ausência de nuvens de XIST durante as primeiras duas passagens. Avaliação de EPSCs in vitro e in silico sugeriram que essas células já passaram pelo processo de ICX. Resultados similares foram observados para células cultivadas no meio 4CL. Depois de nova conversão para o estado primed, células naive cultivadas em 5iLA passaram pela inativação do mesmo alelo do gene MECP2 previamente inativo. Por outro lado, blastoides gerados a partir de células cultivadas no meio PXGL demonstraram ICX progressiva e aleatória, apesar de viés para re-inativação do alelo de MECP2 previamente inativo ter sido observado. Esses resultados sugerem que blastoides humanos podem ser usados para o estudo da ICX humana in vitro.X chromosome inactivation is a dose compensation mechanism that takes place in the cells of female placental mammals. Human XCI starts around the early blastocyst stage, and its understanding is hampered by the difficulties associated with the use of embryos in research. In order to address this issue, we evaluated different models for the study of XCI in vitro. Primed cells displayed monoallelic expression of the X-linked gene MECP2 and a single XIST cloud. Upon conversion to the naive state, biallelic MECP2 expression was observed, as well as absence of XIST clouds for the first two passages. Evaluation of EPSCs in vitro and in silico suggests that these cells have already undergone XCI. Similar results were observed for cells cultured in 4CL medium. After repriming, naive cells cultured in 5iLA displayed inactivation of the previously inactive MECP2 allele. On the other hand, blastoids generated from cells cultured in PXGL underwent progressive random XCI, although bias for the previously inactive allele was still observed. These results suggest that blastoids could be potentially employed for the study of human XCI in vitro.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPCarramaschi, Lygia da Veiga PereiraOrsi, Ana Elisa Ribeiro2023-08-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-23102023-180216/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-10-25T15:48:02Zoai:teses.usp.br:tde-23102023-180216Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-10-25T15:48:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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A inativação do cromossomo X (ICX) é um processo de compensação de dose que ocorre nas células fêmeas de mamíferos placentários. A ICX em humanos inicia-se por volta do estágio de blastocisto, e seu entendimento é prejudicado pelas dificuldades associadas ao uso de embriões em pesquisa. Para lidar com esse problema, nós avaliamos diferentes modelos para o estudo da ICX in vitro. Células no estado primed exibiram expressão monoalélica do gene MECP2, ligado ao cromossomo X, e uma única nuvem de XIST. Após conversão para o estado naive, expressão bialélica do gene MECP2 foi observada, assim como a ausência de nuvens de XIST durante as primeiras duas passagens. Avaliação de EPSCs in vitro e in silico sugeriram que essas células já passaram pelo processo de ICX. Resultados similares foram observados para células cultivadas no meio 4CL. Depois de nova conversão para o estado primed, células naive cultivadas em 5iLA passaram pela inativação do mesmo alelo do gene MECP2 previamente inativo. Por outro lado, blastoides gerados a partir de células cultivadas no meio PXGL demonstraram ICX progressiva e aleatória, apesar de viés para re-inativação do alelo de MECP2 previamente inativo ter sido observado. Esses resultados sugerem que blastoides humanos podem ser usados para o estudo da ICX humana in vitro. |
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