Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Karolski, Bruno
Data de Publicação: 2007
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-01112007-171834/
Resumo: Elementos de transposição são sequências de DNA que possuem a habilidade de se transpor. Estes elementos são divididos em dois grupos de acordo com seu mecanismo de transposição. Aqueles que se transpõem diretamente a partir de moléculas de DNA são chamados de transposons e os que se transpõem através de um intermediário de RNA são chamados de retrotransposons. Os retrotransposons são encontrados nos mais diversos organismos e sua atividade é altamente regulada pelos seus hospedeiros, uma vez que no processo de transposição, efeitos deletérios decorrentes da inserção/inativação de genes podem resultar em eventos drásticos para o organismo. Foram descritos dois mecanismos de controle desses elementos. O primeiro consiste na inativação da transcrição do elemento (inibição transcricional), e o segundo consiste na degradação do mRNA pelo sistema de interferência de RNA (Inibição pós-transcricional). Apesar de serem regulados negativamente, foi verificado em plantas de fumo a indução da expressão do retrotransposon Tnt1 em situações de estresse como em injúrias e processo de regeneração. De forma geral a ativação destes é bastante intrigante e durante diversos anos estes elementos foram considerados “DNA lixo" ou “DNA egoísta". O presente trabalho procurou avaliar a função destes elementos na regeneração de plantas de fumo através de sua inibição nessa fase. A inibição foi realizada através de construções que induzem o sistema de inteferência de RNA, clivando o mRNA dos elementos provindos de qualquer cópia no genoma. Foram selecionados indivíduos geneticamente modificados que apresentaram deficiência de desenvolvimento, ausência de raízes e resposta de hipersensibilidade.
id USP_3790eeb6bb77612cc46b244cc06fcbde
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-01112007-171834
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumoRetrotransposon Tnt1 inactivation: effect upon regeneration of tobacco plantsRNAiRNAiTnt1Tnt1Elementos de transposição são sequências de DNA que possuem a habilidade de se transpor. Estes elementos são divididos em dois grupos de acordo com seu mecanismo de transposição. Aqueles que se transpõem diretamente a partir de moléculas de DNA são chamados de transposons e os que se transpõem através de um intermediário de RNA são chamados de retrotransposons. Os retrotransposons são encontrados nos mais diversos organismos e sua atividade é altamente regulada pelos seus hospedeiros, uma vez que no processo de transposição, efeitos deletérios decorrentes da inserção/inativação de genes podem resultar em eventos drásticos para o organismo. Foram descritos dois mecanismos de controle desses elementos. O primeiro consiste na inativação da transcrição do elemento (inibição transcricional), e o segundo consiste na degradação do mRNA pelo sistema de interferência de RNA (Inibição pós-transcricional). Apesar de serem regulados negativamente, foi verificado em plantas de fumo a indução da expressão do retrotransposon Tnt1 em situações de estresse como em injúrias e processo de regeneração. De forma geral a ativação destes é bastante intrigante e durante diversos anos estes elementos foram considerados “DNA lixo" ou “DNA egoísta". O presente trabalho procurou avaliar a função destes elementos na regeneração de plantas de fumo através de sua inibição nessa fase. A inibição foi realizada através de construções que induzem o sistema de inteferência de RNA, clivando o mRNA dos elementos provindos de qualquer cópia no genoma. Foram selecionados indivíduos geneticamente modificados que apresentaram deficiência de desenvolvimento, ausência de raízes e resposta de hipersensibilidade.Transposable elements are DNA sequences that have the ability of transposition. These elements are divided in two groups according to their transposition mechanism. Those that transpose directly as a DNA molecule are called transposons and those that are dependent on a RNA intermediate are called retrotransposons. Retrotransposons are found in various organisms and are highly regulated by their hosts. In many cases of transposition, the retroelements may be inserted into other genes, causing deleterious effects and damages to the organism. Two control mechanisms have been described in previous studies. One consists of the element transcription inactivation (transcriptional inhibition), and the second consists of the mRNA degradation by the RNA interference system (post-transcriptional inhibition). Despite the negative regulation of these elements, the induction of expression of Tnt1 retrotransposon was described in tobacco plants under stress situations such as injuries and regeneration. The function of the retroelements, in general, is not yet known although they are usually considered as “junk DNA" or “selfish genes". Therefore, studies on the inactivation of these elements are particularly interesting. In this work, the function of these elements in tobacco plants was studied by the use of RNAi methods and analysis during the regeneration phase and plant development were evaluated. Phenotypes are described which are related to previous expression studies supporting a specific role for these elements not yet described.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSluys, Marie Anne vanKarolski, Bruno2007-08-08info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-01112007-171834/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2019-04-16T20:48:23Zoai:teses.usp.br:tde-01112007-171834Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212019-04-16T20:48:23Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
Retrotransposon Tnt1 inactivation: effect upon regeneration of tobacco plants
title Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
spellingShingle Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
Karolski, Bruno
RNAi
RNAi
Tnt1
Tnt1
title_short Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
title_full Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
title_fullStr Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
title_full_unstemmed Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
title_sort Efeito da inativação do retroelemento Tnt1 na regeneração de plantas de fumo
author Karolski, Bruno
author_facet Karolski, Bruno
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Sluys, Marie Anne van
dc.contributor.author.fl_str_mv Karolski, Bruno
dc.subject.por.fl_str_mv RNAi
RNAi
Tnt1
Tnt1
topic RNAi
RNAi
Tnt1
Tnt1
description Elementos de transposição são sequências de DNA que possuem a habilidade de se transpor. Estes elementos são divididos em dois grupos de acordo com seu mecanismo de transposição. Aqueles que se transpõem diretamente a partir de moléculas de DNA são chamados de transposons e os que se transpõem através de um intermediário de RNA são chamados de retrotransposons. Os retrotransposons são encontrados nos mais diversos organismos e sua atividade é altamente regulada pelos seus hospedeiros, uma vez que no processo de transposição, efeitos deletérios decorrentes da inserção/inativação de genes podem resultar em eventos drásticos para o organismo. Foram descritos dois mecanismos de controle desses elementos. O primeiro consiste na inativação da transcrição do elemento (inibição transcricional), e o segundo consiste na degradação do mRNA pelo sistema de interferência de RNA (Inibição pós-transcricional). Apesar de serem regulados negativamente, foi verificado em plantas de fumo a indução da expressão do retrotransposon Tnt1 em situações de estresse como em injúrias e processo de regeneração. De forma geral a ativação destes é bastante intrigante e durante diversos anos estes elementos foram considerados “DNA lixo" ou “DNA egoísta". O presente trabalho procurou avaliar a função destes elementos na regeneração de plantas de fumo através de sua inibição nessa fase. A inibição foi realizada através de construções que induzem o sistema de inteferência de RNA, clivando o mRNA dos elementos provindos de qualquer cópia no genoma. Foram selecionados indivíduos geneticamente modificados que apresentaram deficiência de desenvolvimento, ausência de raízes e resposta de hipersensibilidade.
publishDate 2007
dc.date.none.fl_str_mv 2007-08-08
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-01112007-171834/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-01112007-171834/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809090287824273408

Registros relacionados