Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Márcia Cristina Teixeira dos
Data de Publicação: 2011
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-28052012-100927/
Resumo: A proteína nucleolar Nop8p de levedura foi identificada inicialmente através de sua interação com Nip7p e está envolvida na formação da subunidade ribossomal 60S. A depleção de Nop8p em células de levedura leva à degradação prematura dos rRNAs, porém o mecanismo bioquímico responsável por este fenótipo ainda não é conhecido. Neste trabalho, mostramos que a interação de Nop8p com o rRNA 5.8S se dá através de sua região amino-terminal, enquanto que a porção carboxi-terminal é responsável pela interação com Nip7p e complementa parcialmente o defeito no crescimento observado na cepa mutante condicional Δnop8/GAL::NOP8. Além disso, Nop8p media a associação de Nip7p com as partículas pré-ribossomais. Nop8p também interage com a subunidade Rrp6p do exossomo e inibe a atividade do complexo in vitro, sugerindo que a diminuição dos níveis da subunidade ribosomal 60S detectada após a depleção de Nop8p pode ser resultado da degradação dos pré-rRNAs pelo exossomo. Estes resultados indicam que Nop8p pode regular a atividade do exossomo durante o processamento do pré-rRNA.
id USP_421c05fd0c2ce6b8bfafaf8c00cc4974
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-28052012-100927
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiaeFunctional characterization of the Saccharomyces cerevisiae nucleolar protein Nop8pComplexo TRAMPControle de qualidade de RNAExosomeExossomoNip7pNip7pNop8pNop8pProcessamento de rRNARNARNARNA-surveillancerRNA processingTRAMPcomplex.A proteína nucleolar Nop8p de levedura foi identificada inicialmente através de sua interação com Nip7p e está envolvida na formação da subunidade ribossomal 60S. A depleção de Nop8p em células de levedura leva à degradação prematura dos rRNAs, porém o mecanismo bioquímico responsável por este fenótipo ainda não é conhecido. Neste trabalho, mostramos que a interação de Nop8p com o rRNA 5.8S se dá através de sua região amino-terminal, enquanto que a porção carboxi-terminal é responsável pela interação com Nip7p e complementa parcialmente o defeito no crescimento observado na cepa mutante condicional Δnop8/GAL::NOP8. Além disso, Nop8p media a associação de Nip7p com as partículas pré-ribossomais. Nop8p também interage com a subunidade Rrp6p do exossomo e inibe a atividade do complexo in vitro, sugerindo que a diminuição dos níveis da subunidade ribosomal 60S detectada após a depleção de Nop8p pode ser resultado da degradação dos pré-rRNAs pelo exossomo. Estes resultados indicam que Nop8p pode regular a atividade do exossomo durante o processamento do pré-rRNA.The yeast nucleolar protein Nop8p has previously been shown to interact with Nip7p and to be required for 60S ribosomal subunit formation. Although depletion of Nop8p in yeast cells leads to premature degradation of rRNAs, the biochemical mechanism responsible for this phenotype is still not known. In this work, we show that the Nop8p amino-terminal region mediates interaction with the 5.8S rRNA, while its carboxylterminal portion interacts with Nip7p and can partially complement the growth defect of the conditional mutant strain Δnop8/GAL::NOP8. Interestingly, Nop8p mediates the association of Nip7p to pre-ribosomal particles. Nop8p also interacts with the exosome subunit Rrp6p and inhibits the complex activity in vitro, suggesting that the decrease in 60S ribosomal subunit levels detected upon depletion of Nop8p may result from degradation of pre-rRNAs by the exosome. These results strongly indicate that Nop8p may control exosome function during pre-rRNA processing.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPOliveira, Carla Columbano deSantos, Márcia Cristina Teixeira dos2011-10-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-28052012-100927/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-07-28T16:10:31Zoai:teses.usp.br:tde-28052012-100927Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-07-28T16:10:31Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
Functional characterization of the Saccharomyces cerevisiae nucleolar protein Nop8p
title Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
spellingShingle Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
Santos, Márcia Cristina Teixeira dos
Complexo TRAMP
Controle de qualidade de RNA
Exosome
Exossomo
Nip7p
Nip7p
Nop8p
Nop8p
Processamento de rRNA
RNA
RNA
RNA-surveillance
rRNA processing
TRAMPcomplex.
title_short Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
title_full Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
title_fullStr Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
title_full_unstemmed Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
title_sort Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae
author Santos, Márcia Cristina Teixeira dos
author_facet Santos, Márcia Cristina Teixeira dos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Oliveira, Carla Columbano de
dc.contributor.author.fl_str_mv Santos, Márcia Cristina Teixeira dos
dc.subject.por.fl_str_mv Complexo TRAMP
Controle de qualidade de RNA
Exosome
Exossomo
Nip7p
Nip7p
Nop8p
Nop8p
Processamento de rRNA
RNA
RNA
RNA-surveillance
rRNA processing
TRAMPcomplex.
topic Complexo TRAMP
Controle de qualidade de RNA
Exosome
Exossomo
Nip7p
Nip7p
Nop8p
Nop8p
Processamento de rRNA
RNA
RNA
RNA-surveillance
rRNA processing
TRAMPcomplex.
description A proteína nucleolar Nop8p de levedura foi identificada inicialmente através de sua interação com Nip7p e está envolvida na formação da subunidade ribossomal 60S. A depleção de Nop8p em células de levedura leva à degradação prematura dos rRNAs, porém o mecanismo bioquímico responsável por este fenótipo ainda não é conhecido. Neste trabalho, mostramos que a interação de Nop8p com o rRNA 5.8S se dá através de sua região amino-terminal, enquanto que a porção carboxi-terminal é responsável pela interação com Nip7p e complementa parcialmente o defeito no crescimento observado na cepa mutante condicional Δnop8/GAL::NOP8. Além disso, Nop8p media a associação de Nip7p com as partículas pré-ribossomais. Nop8p também interage com a subunidade Rrp6p do exossomo e inibe a atividade do complexo in vitro, sugerindo que a diminuição dos níveis da subunidade ribosomal 60S detectada após a depleção de Nop8p pode ser resultado da degradação dos pré-rRNAs pelo exossomo. Estes resultados indicam que Nop8p pode regular a atividade do exossomo durante o processamento do pré-rRNA.
publishDate 2011
dc.date.none.fl_str_mv 2011-10-21
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-28052012-100927/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-28052012-100927/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257432325095424