O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Moraes, Lumi Shiose
Data de Publicação: 2024
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-15082024-151008/
Resumo: Dentro da complexa rede de mecanismos moleculares que conduzem o desenvolvimento das plantas, as proteínas BBXs surgem como reguladores cruciais, controlando vários processos fisiológicos em resposta a sinais ambientais. As proteínas BBXs, nomeadas por seu domínio B-box conservado, constituem uma família diversa de fatores de transcrição que exercem funções regulatórias por meio da interação direta e indireta com outros componentes moleculares, incluindo fatores de transcrição, modificadores de cromatina e fitohormônios. Nos últimos anos, o estudo das proteínas BBXs tem recebido atenção significativa, especialmente em planta modelo como Arabidopsis thaliana, sendo inicialmente caracterizadas como fatores de sinalização luminosa. Além disso, por meio de estudos genômicos, a família de genes BBX também foi identificada em várias espécies de plantas, desde culturas ornamentais até alimentares. No entanto, seus papéis na determinação de características agronômicas essenciais em espécies economicamente importantes, como o tomate (Solanum lycopersicum L.), ainda são limitados. Recentemente, um levantamento genômico foi realizado e 31 genes que codificam proteínas BBX foram identificados em tomateiro. Um abrangente perfil de transcritos revelou seis genes que apesentam uma clara associação com o amadurecimento do fruto: SlBBX16 (Solyc12g005750), SlBBX19 (Solyc01g110370), SlBBX20 (Solyc12g089240), SlBBX26 (Solyc10g006750), SlBBX28 (Solyc12g005660) e SlBBX29 (Solyc02g079430). Interessantemente, as regiões promotoras desses seis genes possuem motivos de ligação para fatores de sinalização luminosa e para o RIPENING INHIBITOR (inibidor de amadurecimento; SlRIN), fator de transcrição mestre do amadurecimento. Nesse contexto, este projeto teve como objetivo caracterizar o papel dos seis genes que codificam as proteínas SlBBXs, cujo perfil de mRNA aumenta ou diminui durante a transição cloroplasto-cromoplasto. Portanto, os resultados deste trabalho estão organizados em três capítulos: (I) Regulação transcricional dos SlBBXs mediada por fitocromos e genes do amadurecimento; (II) Caracterização fenotípica da mutante Slbbx20; e (III) Caracterização fenotípica da mutante Slbbx26.
id USP_43d3ec7b7c9dc05d379209b1e78741be
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-15082024-151008
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiroThe role of B-box containing proteins in vegetative and reproductive development in tomatoBBXsBBXsCaracterização funcionalCrisprCrisprFatores de transcriçãoFunctional characterizationSolanum lycopersicum LSolanum lycopersicum LTranscription factorsDentro da complexa rede de mecanismos moleculares que conduzem o desenvolvimento das plantas, as proteínas BBXs surgem como reguladores cruciais, controlando vários processos fisiológicos em resposta a sinais ambientais. As proteínas BBXs, nomeadas por seu domínio B-box conservado, constituem uma família diversa de fatores de transcrição que exercem funções regulatórias por meio da interação direta e indireta com outros componentes moleculares, incluindo fatores de transcrição, modificadores de cromatina e fitohormônios. Nos últimos anos, o estudo das proteínas BBXs tem recebido atenção significativa, especialmente em planta modelo como Arabidopsis thaliana, sendo inicialmente caracterizadas como fatores de sinalização luminosa. Além disso, por meio de estudos genômicos, a família de genes BBX também foi identificada em várias espécies de plantas, desde culturas ornamentais até alimentares. No entanto, seus papéis na determinação de características agronômicas essenciais em espécies economicamente importantes, como o tomate (Solanum lycopersicum L.), ainda são limitados. Recentemente, um levantamento genômico foi realizado e 31 genes que codificam proteínas BBX foram identificados em tomateiro. Um abrangente perfil de transcritos revelou seis genes que apesentam uma clara associação com o amadurecimento do fruto: SlBBX16 (Solyc12g005750), SlBBX19 (Solyc01g110370), SlBBX20 (Solyc12g089240), SlBBX26 (Solyc10g006750), SlBBX28 (Solyc12g005660) e SlBBX29 (Solyc02g079430). Interessantemente, as regiões promotoras desses seis genes possuem motivos de ligação para fatores de sinalização luminosa e para o RIPENING INHIBITOR (inibidor de amadurecimento; SlRIN), fator de transcrição mestre do amadurecimento. Nesse contexto, este projeto teve como objetivo caracterizar o papel dos seis genes que codificam as proteínas SlBBXs, cujo perfil de mRNA aumenta ou diminui durante a transição cloroplasto-cromoplasto. Portanto, os resultados deste trabalho estão organizados em três capítulos: (I) Regulação transcricional dos SlBBXs mediada por fitocromos e genes do amadurecimento; (II) Caracterização fenotípica da mutante Slbbx20; e (III) Caracterização fenotípica da mutante Slbbx26.Within the intricate network of molecular mechanisms governing plant development, BBX proteins emerge as crucial regulators, orchestrating various physiological processes in response to environmental cues. BBX proteins, named after their conserved B-box domain, constitute a diverse family of transcription factors that exert regulatory functions through direct and indirect interaction with other molecular components, including transcription factors, chromatin modifiers, and phytohormones. In recent years, the study of BBX proteins has garnered significant attention, particularly in model plants like Arabidopsis thaliana, which were initially characterized as light signaling factors. Further, through genome-wide studies, the BBX gene family has also been identified in various plant species, from ornamental to food crops. However, their roles in determining agronomical essential traits in economically important crops, such as tomato (Solanum lycopersicum L.), remain limited. Recently, by performing a genome-wide survey, our group has identified 31 BBX encoding genes in tomato. A comprehensive mRNA profiling revealed six genes that showed a clear fruit ripening association: SlBBX16 (Solyc12g005750), SlBBX19 (Solyc01g110370), SlBBX20 (Solyc12g089240), SlBBX26 (Solyc10g006750), SlBBX28 (Solyc12g005660) and SlBBX29 (Solyc02g079430). Interestingly, the promoter regions of these six genes showed binding motifs for light signaling factors and RIPENING INHIBITOR (SlRIN), the master ripening transcription factor. In this context, this project aimed to characterize the role of the six SlBBX protein encoding genes, whose mRNA profiles increase or decrease along chloroplast-chromoplast transition. Therefore, the results of this work are organized in three chapters: (I) PHYTOCHROME- and ripening-mediated transcriptional regulation of SlBBX genes; (II) Slbbx20 mutant phenotypic characterization; and (III) Slbbx26 mutant phenotypic characterization.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPRossi, Maria MagdalenaMoraes, Lumi Shiose2024-06-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-15082024-151008/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPReter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-08-20T18:27:02Zoai:teses.usp.br:tde-15082024-151008Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-08-20T18:27:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
The role of B-box containing proteins in vegetative and reproductive development in tomato
title O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
spellingShingle O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
Moraes, Lumi Shiose
BBXs
BBXs
Caracterização funcional
Crispr
Crispr
Fatores de transcrição
Functional characterization
Solanum lycopersicum L
Solanum lycopersicum L
Transcription factors
title_short O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
title_full O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
title_fullStr O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
title_full_unstemmed O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
title_sort O papel das proteínas que contém domínio B-box no desenvolvimento vegetativo e reprodutivo do tomateiro
author Moraes, Lumi Shiose
author_facet Moraes, Lumi Shiose
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Rossi, Maria Magdalena
dc.contributor.author.fl_str_mv Moraes, Lumi Shiose
dc.subject.por.fl_str_mv BBXs
BBXs
Caracterização funcional
Crispr
Crispr
Fatores de transcrição
Functional characterization
Solanum lycopersicum L
Solanum lycopersicum L
Transcription factors
topic BBXs
BBXs
Caracterização funcional
Crispr
Crispr
Fatores de transcrição
Functional characterization
Solanum lycopersicum L
Solanum lycopersicum L
Transcription factors
description Dentro da complexa rede de mecanismos moleculares que conduzem o desenvolvimento das plantas, as proteínas BBXs surgem como reguladores cruciais, controlando vários processos fisiológicos em resposta a sinais ambientais. As proteínas BBXs, nomeadas por seu domínio B-box conservado, constituem uma família diversa de fatores de transcrição que exercem funções regulatórias por meio da interação direta e indireta com outros componentes moleculares, incluindo fatores de transcrição, modificadores de cromatina e fitohormônios. Nos últimos anos, o estudo das proteínas BBXs tem recebido atenção significativa, especialmente em planta modelo como Arabidopsis thaliana, sendo inicialmente caracterizadas como fatores de sinalização luminosa. Além disso, por meio de estudos genômicos, a família de genes BBX também foi identificada em várias espécies de plantas, desde culturas ornamentais até alimentares. No entanto, seus papéis na determinação de características agronômicas essenciais em espécies economicamente importantes, como o tomate (Solanum lycopersicum L.), ainda são limitados. Recentemente, um levantamento genômico foi realizado e 31 genes que codificam proteínas BBX foram identificados em tomateiro. Um abrangente perfil de transcritos revelou seis genes que apesentam uma clara associação com o amadurecimento do fruto: SlBBX16 (Solyc12g005750), SlBBX19 (Solyc01g110370), SlBBX20 (Solyc12g089240), SlBBX26 (Solyc10g006750), SlBBX28 (Solyc12g005660) e SlBBX29 (Solyc02g079430). Interessantemente, as regiões promotoras desses seis genes possuem motivos de ligação para fatores de sinalização luminosa e para o RIPENING INHIBITOR (inibidor de amadurecimento; SlRIN), fator de transcrição mestre do amadurecimento. Nesse contexto, este projeto teve como objetivo caracterizar o papel dos seis genes que codificam as proteínas SlBBXs, cujo perfil de mRNA aumenta ou diminui durante a transição cloroplasto-cromoplasto. Portanto, os resultados deste trabalho estão organizados em três capítulos: (I) Regulação transcricional dos SlBBXs mediada por fitocromos e genes do amadurecimento; (II) Caracterização fenotípica da mutante Slbbx20; e (III) Caracterização fenotípica da mutante Slbbx26.
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-06-10
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-15082024-151008/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-15082024-151008/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Reter o conteúdo por motivos de patente, publicação e/ou direitos autoriais.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257029130846208