Linhagens evolutivas na espécie taxonômica Drosophila serido (grupo D. repleta)
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-12022020-172728/ |
Resumo: | O \"cluster\" Drosophila buzzatii é formado por sete espécies endêmicas da América do Sul e que apresentam relação ecológica obrigatória com cactos. Entre elas, Drosophila serido possui uma distribuição geográfica muito ampla. Análises de inversões cromossômicas polimórficas, hidrocarbonetos da cutícula, diversidade haplotípica mitocondrial e análises cariotípicas apontam a existência de dois grupos populacionais de D. serido: populações do litoral e populações do nordeste. Neste trabalho, utilizando sequências dos genes nucleares GstD1, kl5 e ? esterase-5 e mitocondrial COI, testamos a hipótese de que a espécie taxonômica D. serido é composta por mais de uma linhagem evolutiva, por meio de análises de estrutura populacional, agrupamento populacional, rede haplotípica e filogenia. Os resultados para a análise de estrutura populacional apontam dois (ou mais) agrupamentos para a espécie. Para a análise de agrupamento populacional com base na distância genética, analisamos que algumas populações do litoral estão se distanciando do restante das populações do litoral e nordeste, porém ainda temos as duas populações dos dois agrupamentos hipotéticos próximas. Para a análise das redes haplotípicas, os genes que separam os dois agrupamentos são ? esterase-5 e GstD1. Para o restante dos marcadores, ainda apontam o compartilhamento de alguns haplótipos entre as populações. Nas análises filogenéticas, os genes GstD1, ? esterase-5 e os quatro analisados em conjunto separam as populações em dois agrupamentos, enquanto os marcadores COI e Kl-5 ainda têm as duas populações hipotéticas misturadas, corroborando com as outras análises. Contudo, nossos dados apoiam que existam duas linhagens evolutivas para D. serido |
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Linhagens evolutivas na espécie taxonômica Drosophila serido (grupo D. repleta)Evolutive lineages of the taxonomic species Drosophila serido (D. repleta group)Delimitação de espéciesDelimitation of speciesMarcadores molecularesMolecular markersNew lineagesNovas linhagensO \"cluster\" Drosophila buzzatii é formado por sete espécies endêmicas da América do Sul e que apresentam relação ecológica obrigatória com cactos. Entre elas, Drosophila serido possui uma distribuição geográfica muito ampla. Análises de inversões cromossômicas polimórficas, hidrocarbonetos da cutícula, diversidade haplotípica mitocondrial e análises cariotípicas apontam a existência de dois grupos populacionais de D. serido: populações do litoral e populações do nordeste. Neste trabalho, utilizando sequências dos genes nucleares GstD1, kl5 e ? esterase-5 e mitocondrial COI, testamos a hipótese de que a espécie taxonômica D. serido é composta por mais de uma linhagem evolutiva, por meio de análises de estrutura populacional, agrupamento populacional, rede haplotípica e filogenia. Os resultados para a análise de estrutura populacional apontam dois (ou mais) agrupamentos para a espécie. Para a análise de agrupamento populacional com base na distância genética, analisamos que algumas populações do litoral estão se distanciando do restante das populações do litoral e nordeste, porém ainda temos as duas populações dos dois agrupamentos hipotéticos próximas. Para a análise das redes haplotípicas, os genes que separam os dois agrupamentos são ? esterase-5 e GstD1. Para o restante dos marcadores, ainda apontam o compartilhamento de alguns haplótipos entre as populações. Nas análises filogenéticas, os genes GstD1, ? esterase-5 e os quatro analisados em conjunto separam as populações em dois agrupamentos, enquanto os marcadores COI e Kl-5 ainda têm as duas populações hipotéticas misturadas, corroborando com as outras análises. Contudo, nossos dados apoiam que existam duas linhagens evolutivas para D. seridoThe \"cluster\" Drosophila buzzatii is formed by seven endemic species from South America and have a mandatory ecological relationship with cacti. Among them, Drosophila serido has a very broad geographic distribution. Analyses of polymorphic chromosomal inversions, cuticle hydrocarbons, haplotypical mitochondrial diversity and karyotypic analyses indicate the existence of two population groups of D. serido: coastal populations and northeastern populations. In this study, using sequences of the nuclear genes GstD1, KL5 and ? Esterase-5 and mitochondrial COI, we tested the hypothesis that the taxonomic species D. serido is composed of more than one evolutionary lineage, through analysis of population structure, population grouping, haplotypical network and phylogeny. The results for the population structure analysis indicate two (or more) groupings for the species. For population cluster analysis based on genetic distance, we analyzed that some coastal populations are moving away from the rest of the coastal and northeast populations, but we still have the two populations of the two hypothetical clusters nearby. For haplotypic network analysis, the genes that separate the two clusters are ? esterase-5 and GstD1. For the remaining markers, they still point to the sharing of some haplotypes among the populations. In phylogenetic analyzes, the GstD1, ? esterase-5 and the four genes analyzed together separate the populations into two clusters, while the markers COI and Kl-5 still have the two hypothetical populations mixed, corroborating the other analyzes. However, our data support that there are two evolutionary lineages for D. seridoBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPManfrin, Maura HelenaZichinelli, Ana Beatriz2019-11-22info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-12022020-172728/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2020-03-18T23:16:01Zoai:teses.usp.br:tde-12022020-172728Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212020-03-18T23:16:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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