Avaliação da diversidade genética entre cultivares brasileiras de soja, através de marcadores AFLP

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bonato, Ana Lídia Variani
Data de Publicação: 2000
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20231122-093353/
Resumo: Esta tese é composta por dois trabalhos. O objetivo do primeiro foi investigar o potencial de medidas de distâncias genéticas obtidas a partir de marcadores moleculares AFLP (AFD) e do coeficiente de parentesco (DG) na predição da variabilidade genética de populações segregantes de soja. A distância genética entre as seis combinações possíveis entre quatro genótipos foi baseada em 165 polimorfismos, obtidos com 21 combinações de primers EcoRI/Msel. A variância genética aditiva foi estimada para sete caracteres avaliados em quatro épocas de semeadura (setembro, outubro, novembro e dezembro) em quatro anos. Os resultados mostraram correlação negativa entre os coeficientes AFD e DG. A correlação entre a variância genética aditiva de produção de grãos e a distância genética (AFD), na média dos quatro anos e das quatro épocas de semeadura, foi baixa, mas significativa. Quando a estimativa foi feita separadamente por época, a correlação mais alta foi observada no mês de outubro. Obtiveram-se coeficientes de correlação maiores em épocas específicas para cada caráter, sendo estas estimativas maiores, também, em relação aos respectivos coeficientes gerais. Entre a variância genética aditiva e a distância genética (DG) houve correlação significativa apenas para peso de 100 sementes em outubro e dezembro e para número de dias para floração em setembro. Esse estudo mostrou, portanto, que a distância genética avaliada por AFLP pode ser uma ferramenta útil na predição da variabilidade genética da soja e, consequentemente, na escolha de genitores para programas de melhoramento genético. O segundo trabalho teve como objetivo avaliar a similaridade genética com marcadores AFLP (AFS) entre 317 cultivares de soja, liberadas no Brasil no período de 1962 a 1998. Para isso, foram utilizadas seis combinações de primers EcoRVMsel e estimados os coeficientes de similaridade genética pelo método de Nei & Li (1979). Os coeficientes de parentesco entre 100 cultivares, liberadas entre 1984 e 1998, foram estimados e correlacionados com os coeficientes de similaridade obtidos com os marcadores. A análise de AFLP revelou a ocorrência de aproximadamente 394 bandas, sendo 78 destas polimórficas. Esse número foi suficiente para avaliar a similaridade genética entre as cultivares, conforme revelou a análise bootstrap. A interpretação do dendrograma foi dificultada pelo grande número de cultivares utilizadas. Mesmo assim foi possível detectar agrupamentos de cultivares formados de acordo com o esperado através da genealogia dos mesmos. A utilização de um dendrograma formado por um número menor de cultivares permitiu uma melhor interpretação das similaridades entre as mesmas. Não foi encontrada correlação significativa entre os coeficientes de parentesco e os de similaridade genética (AFS). Os resultados mostraram que as cultivares de soja liberadas no Brasil no período entre 1962 e 1998 apresentam alta similaridade genética, a qual permaneceu constante no período estudado. Apesar disso, têm sido obtidos progressos substanciais com o melhoramento genético. (Anexo disponível somente na versão impressa)
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spelling Avaliação da diversidade genética entre cultivares brasileiras de soja, através de marcadores AFLPEvaluation of genetic diversity among brazilian soybean cul tivars using AFLP markersDIVERSIDADE GENÉTICAMARCADOR MOLECULARSOJAVARIEDADES VEGETAISEsta tese é composta por dois trabalhos. O objetivo do primeiro foi investigar o potencial de medidas de distâncias genéticas obtidas a partir de marcadores moleculares AFLP (AFD) e do coeficiente de parentesco (DG) na predição da variabilidade genética de populações segregantes de soja. A distância genética entre as seis combinações possíveis entre quatro genótipos foi baseada em 165 polimorfismos, obtidos com 21 combinações de primers EcoRI/Msel. A variância genética aditiva foi estimada para sete caracteres avaliados em quatro épocas de semeadura (setembro, outubro, novembro e dezembro) em quatro anos. Os resultados mostraram correlação negativa entre os coeficientes AFD e DG. A correlação entre a variância genética aditiva de produção de grãos e a distância genética (AFD), na média dos quatro anos e das quatro épocas de semeadura, foi baixa, mas significativa. Quando a estimativa foi feita separadamente por época, a correlação mais alta foi observada no mês de outubro. Obtiveram-se coeficientes de correlação maiores em épocas específicas para cada caráter, sendo estas estimativas maiores, também, em relação aos respectivos coeficientes gerais. Entre a variância genética aditiva e a distância genética (DG) houve correlação significativa apenas para peso de 100 sementes em outubro e dezembro e para número de dias para floração em setembro. Esse estudo mostrou, portanto, que a distância genética avaliada por AFLP pode ser uma ferramenta útil na predição da variabilidade genética da soja e, consequentemente, na escolha de genitores para programas de melhoramento genético. O segundo trabalho teve como objetivo avaliar a similaridade genética com marcadores AFLP (AFS) entre 317 cultivares de soja, liberadas no Brasil no período de 1962 a 1998. Para isso, foram utilizadas seis combinações de primers EcoRVMsel e estimados os coeficientes de similaridade genética pelo método de Nei & Li (1979). Os coeficientes de parentesco entre 100 cultivares, liberadas entre 1984 e 1998, foram estimados e correlacionados com os coeficientes de similaridade obtidos com os marcadores. A análise de AFLP revelou a ocorrência de aproximadamente 394 bandas, sendo 78 destas polimórficas. Esse número foi suficiente para avaliar a similaridade genética entre as cultivares, conforme revelou a análise bootstrap. A interpretação do dendrograma foi dificultada pelo grande número de cultivares utilizadas. Mesmo assim foi possível detectar agrupamentos de cultivares formados de acordo com o esperado através da genealogia dos mesmos. A utilização de um dendrograma formado por um número menor de cultivares permitiu uma melhor interpretação das similaridades entre as mesmas. Não foi encontrada correlação significativa entre os coeficientes de parentesco e os de similaridade genética (AFS). Os resultados mostraram que as cultivares de soja liberadas no Brasil no período entre 1962 e 1998 apresentam alta similaridade genética, a qual permaneceu constante no período estudado. Apesar disso, têm sido obtidos progressos substanciais com o melhoramento genético. (Anexo disponível somente na versão impressa)This thesis is composed by two parts. The first carries out an investigation on the potential of genetic distance measurements obtained from AFLP molecular markers (AFD) and from the parentage coefficient (GD) to predict the genetic variability of segregant soybean populations. The genetic distance among the six possible combinations of four genotypes was based on 165 polymorphisms obtained from 21 EcoRI/Msel primer combinations. The additive genetic variance was estimated for seven traits in four sowing periods and four years. The results showed a negative correlation among AFLP and the parentage coefficient estimates of genetic divergence. The correlation between the additive varianve for grain yield and the AFLP genetic distance in the average of the four years and four planting periods was low, but significant. Greater correlation coefficients were observed in specific periods for each trait, and these greater estimates were larger than the respectiva general coefficients. There was significant correlation among the additive variance and the genetic distance (GD) only for the of 100 seed weight trait in October and December and for days to flowering in September. This study showed that the genetic distance estimated by AFLP can be a useful tool for predicting genetic variability in soybean and for the choice of parents to be used in a plant breeding program. The second study aimed to assess the genetic similarity measured by AFLP among 317 soybean cultivars released in Brazil between 1962 and 1998. Six combinations of EcoRI/Msel primers were used and the genetic similarity coefficients were estimated by the Nei and Li method (1979). The parentage coefficients among 100 cultivars, released between 1984 and 1998, were estimated and correlated with the similarity coefficients obtained by the markers. AFLP analysis showed 78 polymorphic bands out of a total of approximately 394. This number was sufficient to assess the genetic similarity among the cultivars in accordance with bootstrap analysis. The dendogram interpretation was hindered by the large number of cultivars used, but it was possible to detect cultivar groups formed as expected from their genealogy. The use of the dendogram involving a lower number of cultivars enabled a better interpretation of the similarities. No significant correlation was found among the parentage coefficient and AFLP similarity coefficients. The results showed that the soybean cultivars, released in Brazil between 1962 and 1998, had a high genetic similarity that remained constant throughout the period studied. ln spite of this, substantial gains have been obtained in soybean breeding. (Attachments only available in print verson)Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPGeraldi, Isaías OlivioBonato, Ana Lídia Variani2000-09-14info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20231122-093353/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-11-24T17:36:06Zoai:teses.usp.br:tde-20231122-093353Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-11-24T17:36:06Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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