Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Travieso, Gonzalo
Data de Publicação: 1993
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/54/54132/tde-18042007-143803/
Resumo: Neste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas.
id USP_680938909815e60a443459ae56fa34f6
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-18042007-143803
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.Proposal and implementation of a parallel processing system for molecular dynamics.Communicating sequential processesDinâmica molecularMolecular dynamicsParallel processingProcessamento paraleloProcessos seqüênciais comunicantesNeste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas.A method for parallelization of molecular dynamics simulations in distributed memory machines operating under the message-passing paradigm is proposed. Even though the analysis and implementation presented in this work were primarily restricted to the system model known as microcanonical emsemble of Lennard--Jones particles. the obtained system can easily be adapted for inclusion of other characteristics. It is shown t,hat. the developed system is well suited for parallelization, resulting in a feasible a1ternative for simulation of many-particle systems.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSlaets, Jan Frans WillemTravieso, Gonzalo1993-05-25info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/54/54132/tde-18042007-143803/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2016-07-28T16:09:51Zoai:teses.usp.br:tde-18042007-143803Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212016-07-28T16:09:51Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
Proposal and implementation of a parallel processing system for molecular dynamics.
title Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
spellingShingle Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
Travieso, Gonzalo
Communicating sequential processes
Dinâmica molecular
Molecular dynamics
Parallel processing
Processamento paralelo
Processos seqüênciais comunicantes
title_short Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
title_full Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
title_fullStr Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
title_full_unstemmed Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
title_sort Proposta e implementação de um sistema de processamento paralelo para dinâmica molecular.
author Travieso, Gonzalo
author_facet Travieso, Gonzalo
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Slaets, Jan Frans Willem
dc.contributor.author.fl_str_mv Travieso, Gonzalo
dc.subject.por.fl_str_mv Communicating sequential processes
Dinâmica molecular
Molecular dynamics
Parallel processing
Processamento paralelo
Processos seqüênciais comunicantes
topic Communicating sequential processes
Dinâmica molecular
Molecular dynamics
Parallel processing
Processamento paralelo
Processos seqüênciais comunicantes
description Neste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas.
publishDate 1993
dc.date.none.fl_str_mv 1993-05-25
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/54/54132/tde-18042007-143803/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/54/54132/tde-18042007-143803/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257064806547456

Registros relacionados