Caracterização do microbioma em úlcera de perna de pacientes com Doença Falciforme
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-29052023-163729/ |
Resumo: | INTRODUÇÃO: A Doença Falciforme (DF) é uma doença hematológica hereditária monogênica caracterizada pela produção anormal de hemoglobinas, sendo a mais comum a hemoglobina S (HbS), que se polimeriza sob condições de desoxigenação, deformando as hemácias, que assumem forma de foices e apresentam deficiência no transporte de oxigênio e gás carbônico. Essa deficiência leva a inúmeras complicações, inclusive úlceras de pernas. A microbiota humana é a soma de todos os micro-organismos que residem nos tecidos, composto principalmente por bactérias. Cada local anatômico (pele, boca, intestino, mucosas) possui sua microbiota específica e seu desequilíbrio pode estar associado à doenças crônicas. A microbiota das úlceras de perna na DF ainda é pouco conhecida. O presente trabalho teve por objetivo identificar e caracterizar a microbiota presente em úlceras de perna de pacientes portadores de DF em um hemocentro público de grande porte (Fundação Hemominas), localizado na Região Sudeste do Brasil. MÉTODOS: Trata-se de um estudo transversal que incluiu 30 pacientes com DF e úlcera ativa durante a coleta, 60 pacientes com DF sem histórico de úlcera de perna, ambos os grupos de genótipo SS da DF, e 30 participantes sem história de doenças crônicas. Todos os participantes foram entrevistados, as amostras e as características clínicas coletadas, após consentimento. Caracterizamos os táxons constituintes da microbiota dos participantes pelo sequenciamento do gene 16S rRNA e as sequências geradas foram analisadas através das ASVs (amplicon sequence variants), verificando a cobertura e profundidade necessárias para identificação e classificação de comunidades bacterianas. Foi avaliada a associação da diversidade alfa e beta da microbiota com a úlcera de perna. Os dados clínico/epidemiológicos, sociodemográficos e hábitos da população de pacientes com DF foram analisados para verificar sua associação com a presença da úlcera de perna na DF. RESULTADOS: As diversidades alfa e beta nas úlceras de perna em pacientes com DF foram menores comparadas aos grupos de pele íntegra. Os filos Firmicutes (51%) e Proteobacteria (41%) predominaram nas úlceras, embora sem diferenças estatísticas. O gênero Staphylococcus também predominou nas úlceras de perna com diferença estatística significativa quando comparada à pele íntegra adjacente (16,4% versus 6,8%, respectivamente; p = 0,02). No entanto, não houve diferenças estatísticas da presença do Staphylococcus nas úlceras quando comparado aos grupos controles. O gênero bacteriano de maior abundância na pele íntegra adjacente às úlceras e na pele do grupo controle com DF no geral foi Ralstonia ssp. (11,0% e 13,6%, respectivamente). Corynebacterium ssp. foi maior na pele íntegra adjacente (13,1% versus 0,2%; p = 0,003); dentre os controles as abundâncias foram similares (7,9%, 7,4% e 0,3%; p < 0,001). Houve menor abundância deste gênero nas úlceras. CONCLUSÃO: Nossos resultados evidenciaram menor diversidade significativa alfa e beta nas úlceras de perna da DF, maior abundância dos filos Firmicutes e Proteobacteria e maior abundância de Staphyloccocus ssp. nas úlceras em relação à pele adjacente, sugerindo relação de espécies desse gênero com as úlceras de perna da DF |
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Caracterização do microbioma em úlcera de perna de pacientes com Doença FalciformeCharacterization of the microbiome in leg ulcer of patients with sickle cell disease16S ribosomal RNADoença falciformeLeg ulcerMicrobiotaMicrobiotaRNA ribossômico 16SSequenciamentoSequencingSickle Cell DiseaseStaphylococcusStaphylococcusÚlcera de pernaINTRODUÇÃO: A Doença Falciforme (DF) é uma doença hematológica hereditária monogênica caracterizada pela produção anormal de hemoglobinas, sendo a mais comum a hemoglobina S (HbS), que se polimeriza sob condições de desoxigenação, deformando as hemácias, que assumem forma de foices e apresentam deficiência no transporte de oxigênio e gás carbônico. Essa deficiência leva a inúmeras complicações, inclusive úlceras de pernas. A microbiota humana é a soma de todos os micro-organismos que residem nos tecidos, composto principalmente por bactérias. Cada local anatômico (pele, boca, intestino, mucosas) possui sua microbiota específica e seu desequilíbrio pode estar associado à doenças crônicas. A microbiota das úlceras de perna na DF ainda é pouco conhecida. O presente trabalho teve por objetivo identificar e caracterizar a microbiota presente em úlceras de perna de pacientes portadores de DF em um hemocentro público de grande porte (Fundação Hemominas), localizado na Região Sudeste do Brasil. MÉTODOS: Trata-se de um estudo transversal que incluiu 30 pacientes com DF e úlcera ativa durante a coleta, 60 pacientes com DF sem histórico de úlcera de perna, ambos os grupos de genótipo SS da DF, e 30 participantes sem história de doenças crônicas. Todos os participantes foram entrevistados, as amostras e as características clínicas coletadas, após consentimento. Caracterizamos os táxons constituintes da microbiota dos participantes pelo sequenciamento do gene 16S rRNA e as sequências geradas foram analisadas através das ASVs (amplicon sequence variants), verificando a cobertura e profundidade necessárias para identificação e classificação de comunidades bacterianas. Foi avaliada a associação da diversidade alfa e beta da microbiota com a úlcera de perna. Os dados clínico/epidemiológicos, sociodemográficos e hábitos da população de pacientes com DF foram analisados para verificar sua associação com a presença da úlcera de perna na DF. RESULTADOS: As diversidades alfa e beta nas úlceras de perna em pacientes com DF foram menores comparadas aos grupos de pele íntegra. Os filos Firmicutes (51%) e Proteobacteria (41%) predominaram nas úlceras, embora sem diferenças estatísticas. O gênero Staphylococcus também predominou nas úlceras de perna com diferença estatística significativa quando comparada à pele íntegra adjacente (16,4% versus 6,8%, respectivamente; p = 0,02). No entanto, não houve diferenças estatísticas da presença do Staphylococcus nas úlceras quando comparado aos grupos controles. O gênero bacteriano de maior abundância na pele íntegra adjacente às úlceras e na pele do grupo controle com DF no geral foi Ralstonia ssp. (11,0% e 13,6%, respectivamente). Corynebacterium ssp. foi maior na pele íntegra adjacente (13,1% versus 0,2%; p = 0,003); dentre os controles as abundâncias foram similares (7,9%, 7,4% e 0,3%; p < 0,001). Houve menor abundância deste gênero nas úlceras. CONCLUSÃO: Nossos resultados evidenciaram menor diversidade significativa alfa e beta nas úlceras de perna da DF, maior abundância dos filos Firmicutes e Proteobacteria e maior abundância de Staphyloccocus ssp. nas úlceras em relação à pele adjacente, sugerindo relação de espécies desse gênero com as úlceras de perna da DFINTRODUCTION: Sickle Cell Disease (SCD) is a monogenic hereditary hematological disease characterized by the abnormal production of hemoglobin, the most common being hemoglobin S (HbS), which polymerizes under deoxygenation conditions, deforming the red blood cells, which assume the shape of sickles and are deficient in the transport of oxygen and carbon dioxide. This deficiency leads to many complications, including leg ulcers. The human microbiota is the sum of all microorganisms residing in tissues, composed mainly of bacteria. Each anatomical site (skin, mouth, intestine, mucous membranes) has its specific microbiota and its imbalance can be associated with chronic diseases. The microbiota of leg ulcers in SCD is still poorly understood. The present study aimed to identify and characterize the microbiota present in leg ulcers of patients with SCD in a large public blood center (Fundação Hemominas), located in the Southeast Region of Brazil. METHODS: The present is a cross-sectional study that included 30 patients with SCD and active ulcer during collection, 60 SCD patients with no history of leg ulcer, both SS SCD genotype groups, and 30 participants with no history of chronic diseases. All participants were interviewed, samples collected and clinical characteristics colected, after consent. We characterized the constituent taxa of the participants\' microbiota by sequencing the 16S rRNA gene and the sequences generated were analyzed using ASVs (amplicon sequence variants), verifying the coverage and depth necessary for the identification and classification of bacterial communities. The association of alpha and beta diversity of the microbiota with leg ulcers were evaluated. Clinical/epidemiological, sociodemographic and habits data of the SCD patient population were analyzed to verify their association with the presence of leg ulcers in SCD. RESULTS: The alpha and beta diversities in leg ulcers in patients with SCD were lower compared to the intact skin groups. The phyla Firmicutes (51%) and Proteobacteria (41%) predominated in ulcers, although without statistical differences. The Staphylococcus genus also predominated in leg ulcers, with a statistically significant difference when compared to adjacent intact skin (16.4% versus 6.8%, respectively; p = 0.02). However, there were no statistical differences in the presence of Staphylococcus in ulcers when compared to the control groups. The most abundant bacterial genus in the intact skin adjacent to the ulcers and in the skin of controls with SCD in general was Ralstonia ssp. (11.0% and 13.6%, respectively). Corynebacterium ssp. was higher in adjacent intact skin (13.1% versus 0.2%; p = 0.003); among the controls, the abundances were similar (7.9%, 7.4% and 0.3%; p < 0.001). There was less abundance of this genus in ulcers. CONCLUSION: Our results showed significant lower alpha and beta diversity in SCD leg ulcers, higher abundance of Firmicutes and Proteobacteria phyla, and higher abundance of Staphylococcus ssp. in ulcers when compared to the adjacent skin, suggesting a relationship between species of this genus and SCD leg ulcersBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSabino, Ester CerdeiraOliveira, Franciane Mendes de2023-02-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5134/tde-29052023-163729/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-06-01T19:13:42Zoai:teses.usp.br:tde-29052023-163729Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-06-01T19:13:42Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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