Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bis, Flávia Cristina
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-21022024-153824/
Resumo: A antecipação da puberdade em novilhas possui efeitos positivos na eficiência reprodutiva de bovinos. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito da estimulação hormonal sobre a expressão fenotípica da característica probabilidade de parição precoce antes dos 30 meses de idade (PP30), por meio da estimação de componentes de variância e habilidade de predição para PP30. Além disso, objetivou-se também verificar as características de crescimento, carcaça e reprodução que possuem relação com a PP30. Para esse estudo, foi utilizado dois bancos de dados. O primeiro contendo informações de animais da ANCP, com informações para PP30 de 31554 novilhas, sendo 22105 não genotipadas e 9449 genotipadas. Esses animais foram divididos por tipo de acasalamento (TA), com e sem estimulação hormonal. Para a estimação dos parâmetros genéticos e componentes de variância para o banco de dados completo, foram utilizados dois modelos, com e sem a inclusão TA. Foi usado um modelo animal limiar de passo único genômico BLUP (ssGBLUP). O método de validação LR foi usado para avaliar o desempenho do modelo. Nesse conjunto de dados, foram avaliadas 9440 novilhas genotipadas que também foram divididas por TA. O segundo banco de dados foi composto por 89 novilhas Nelore pertencentes a Fazenda Bacuri. As análises discriminantes foram realizadas para verificar a associação das características fenotípicas e das características genéticas com o diagnóstico de prenhez. A estimativa de herdabilidade (h2) para PP30 foi de baixa magnitude e semelhante para os dois modelos (0,175 sem TA e 0,18 com TA). Apenas o grupo das novilhas estimuladas com a inclusão do TA no modelo tiveram a DEP genômica parcial maior que a DEP genômica completa. Para os estimadores de LR, a correlação de Spearman não foi influenciada pela inclusão do TA no modelo. Nos animais com estimulação hormonal foi observado com correlação de 0,95 e sem a estimulação hormonal 0,96. A maior acurácia observada foi a dos animais que passaram por estimulação hormonal (0,38 sem e com TA), mas sem grandes alterações quando comparada entre modelos. O viés para animais estimulados (3,69% sem TA e 1,49% com TA) foi superior ao comparar com animais não estimulados (0,51% sem TA e 0,63% com TA). Nas análises discriminantes, foi possível observar que dentre as variáveis fenotípicas a EGP final foi a característica com maior poder em discriminar novilhas prenhes de vazias, e as DEPs genômicas com maior poder discriminaram foram as DEPs genômicas para PP30 e IPP. Com os resultados obtidos, é possível concluir que existe efeito do viés ao considerar a estimulação hormonal na predição genômica para a PP30, porém as vantagens produtivas que esses protocolos apresentam são superiores. Em nível prático, esses resultados das características fenotípicas e das DEPs genômicas, direcionam manejo e auxiliam nas tomadas de decisão para selecionar animais para precocidade sexual.
id USP_70d7d2fb948a129fdbfb6835ebf62a6f
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-21022024-153824
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça NeloreInfluence of hormonal protocols on the genetic evaluation of sexual precocity and the relationship between precocity and growth and carcass traits in precocious Nellore femalesEspessura de gordura na picanhaFTAIGenomic predictionHeifersIATFNovilhasPredição genômicaPuberdadePubertyRump fat thicknessA antecipação da puberdade em novilhas possui efeitos positivos na eficiência reprodutiva de bovinos. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito da estimulação hormonal sobre a expressão fenotípica da característica probabilidade de parição precoce antes dos 30 meses de idade (PP30), por meio da estimação de componentes de variância e habilidade de predição para PP30. Além disso, objetivou-se também verificar as características de crescimento, carcaça e reprodução que possuem relação com a PP30. Para esse estudo, foi utilizado dois bancos de dados. O primeiro contendo informações de animais da ANCP, com informações para PP30 de 31554 novilhas, sendo 22105 não genotipadas e 9449 genotipadas. Esses animais foram divididos por tipo de acasalamento (TA), com e sem estimulação hormonal. Para a estimação dos parâmetros genéticos e componentes de variância para o banco de dados completo, foram utilizados dois modelos, com e sem a inclusão TA. Foi usado um modelo animal limiar de passo único genômico BLUP (ssGBLUP). O método de validação LR foi usado para avaliar o desempenho do modelo. Nesse conjunto de dados, foram avaliadas 9440 novilhas genotipadas que também foram divididas por TA. O segundo banco de dados foi composto por 89 novilhas Nelore pertencentes a Fazenda Bacuri. As análises discriminantes foram realizadas para verificar a associação das características fenotípicas e das características genéticas com o diagnóstico de prenhez. A estimativa de herdabilidade (h2) para PP30 foi de baixa magnitude e semelhante para os dois modelos (0,175 sem TA e 0,18 com TA). Apenas o grupo das novilhas estimuladas com a inclusão do TA no modelo tiveram a DEP genômica parcial maior que a DEP genômica completa. Para os estimadores de LR, a correlação de Spearman não foi influenciada pela inclusão do TA no modelo. Nos animais com estimulação hormonal foi observado com correlação de 0,95 e sem a estimulação hormonal 0,96. A maior acurácia observada foi a dos animais que passaram por estimulação hormonal (0,38 sem e com TA), mas sem grandes alterações quando comparada entre modelos. O viés para animais estimulados (3,69% sem TA e 1,49% com TA) foi superior ao comparar com animais não estimulados (0,51% sem TA e 0,63% com TA). Nas análises discriminantes, foi possível observar que dentre as variáveis fenotípicas a EGP final foi a característica com maior poder em discriminar novilhas prenhes de vazias, e as DEPs genômicas com maior poder discriminaram foram as DEPs genômicas para PP30 e IPP. Com os resultados obtidos, é possível concluir que existe efeito do viés ao considerar a estimulação hormonal na predição genômica para a PP30, porém as vantagens produtivas que esses protocolos apresentam são superiores. Em nível prático, esses resultados das características fenotípicas e das DEPs genômicas, direcionam manejo e auxiliam nas tomadas de decisão para selecionar animais para precocidade sexual.The anticipation of puberty in heifers has positive effects on the reproductive efficiency of cattle. Thus, the objective of this study was to evaluate the effect of hormonal stimulation on the phenotypic expression of the trait probability of precocious calving at 30 months (PPC30), through the estimation of variance components and prediction ability for PPC30. Furthermore, the objective was also to verify the characteristics of growth, carcass and reproduction that are related to PPC30. For this study, two databases were used. The first containing information on ANCP animals, with information for PPC30 of 31554 heifers, 22105 of which were not genotyped and 9449 were genotyped. These animals were divided by type of mating (TM), with and without hormonal stimulation. To estimate genetic parameters and variance components for the complete database, two models were used, with and without TM inclusion. A threshold animal model assuming normal distribution was used. The method used was ssGBLUP. The LR validation method was used to evaluate the model\'s performance. The data set was divided into training subsets with 31554 animals with phenotype records and validation with 1184 genotyped animals with phenotype records but without progeny records and were divided by TM. The second database was composed of 89 Nellore heifers belonging to Farm Bacuri. Phenotypic traits and genetic traits was used to perform discriminant analysis. The heritability estimate (h2) for PPC30 was of low magnitude and similar for both models. Only the group of heifers stimulated with the inclusion of TM in the model had a partial GEBV greater than the complete GEBV. For the LR estimators, the Spearman correlation was not influenced by the inclusion of TM in the model. Animals with hormonal stimulation were observed with a correlation of 0.95 and without the hormonal stimulation 0.96. The highest accuracy observed was that of animals that underwent hormonal stimulation (0.38 without and with TM), but without major changes when compared between models. The bias for stimulated animals (3.69% without TM and 1.49% with TM) was superior when compared to non-stimulated animals (0.51% without TM and 0.63% with TM). In the discriminant analyses, it was possible to observe that among the phenotypic variables, the RFTfinal was the trait with the greatest power in discriminating pregnant from empty heifers, and the GEBV with the greatest discriminating power were the GEBV for PPC30 and AFC. With the results obtained, it is possible to conclude that there is an effect of bias when considering hormonal stimulation in the genomic prediction for PPC30, however the productive advantages that these protocols present are superior. On a practical level, these results of phenotypic traits and GEBV guide management and assist in decision-making to select animals for sexual precocity.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPRey, Fernando Sebastián BaldiBis, Flávia Cristina2023-09-26info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-21022024-153824/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-02-21T19:21:02Zoai:teses.usp.br:tde-21022024-153824Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-02-21T19:21:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
Influence of hormonal protocols on the genetic evaluation of sexual precocity and the relationship between precocity and growth and carcass traits in precocious Nellore females
title Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
spellingShingle Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
Bis, Flávia Cristina
Espessura de gordura na picanha
FTAI
Genomic prediction
Heifers
IATF
Novilhas
Predição genômica
Puberdade
Puberty
Rump fat thickness
title_short Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
title_full Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
title_fullStr Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
title_full_unstemmed Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
title_sort Influência dos protocolos hormonais na avaliação genética da precocidade sexual e relação entre a precocidade com características de crescimento e carcaça em fêmeas precoce da raça Nelore
author Bis, Flávia Cristina
author_facet Bis, Flávia Cristina
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Rey, Fernando Sebastián Baldi
dc.contributor.author.fl_str_mv Bis, Flávia Cristina
dc.subject.por.fl_str_mv Espessura de gordura na picanha
FTAI
Genomic prediction
Heifers
IATF
Novilhas
Predição genômica
Puberdade
Puberty
Rump fat thickness
topic Espessura de gordura na picanha
FTAI
Genomic prediction
Heifers
IATF
Novilhas
Predição genômica
Puberdade
Puberty
Rump fat thickness
description A antecipação da puberdade em novilhas possui efeitos positivos na eficiência reprodutiva de bovinos. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito da estimulação hormonal sobre a expressão fenotípica da característica probabilidade de parição precoce antes dos 30 meses de idade (PP30), por meio da estimação de componentes de variância e habilidade de predição para PP30. Além disso, objetivou-se também verificar as características de crescimento, carcaça e reprodução que possuem relação com a PP30. Para esse estudo, foi utilizado dois bancos de dados. O primeiro contendo informações de animais da ANCP, com informações para PP30 de 31554 novilhas, sendo 22105 não genotipadas e 9449 genotipadas. Esses animais foram divididos por tipo de acasalamento (TA), com e sem estimulação hormonal. Para a estimação dos parâmetros genéticos e componentes de variância para o banco de dados completo, foram utilizados dois modelos, com e sem a inclusão TA. Foi usado um modelo animal limiar de passo único genômico BLUP (ssGBLUP). O método de validação LR foi usado para avaliar o desempenho do modelo. Nesse conjunto de dados, foram avaliadas 9440 novilhas genotipadas que também foram divididas por TA. O segundo banco de dados foi composto por 89 novilhas Nelore pertencentes a Fazenda Bacuri. As análises discriminantes foram realizadas para verificar a associação das características fenotípicas e das características genéticas com o diagnóstico de prenhez. A estimativa de herdabilidade (h2) para PP30 foi de baixa magnitude e semelhante para os dois modelos (0,175 sem TA e 0,18 com TA). Apenas o grupo das novilhas estimuladas com a inclusão do TA no modelo tiveram a DEP genômica parcial maior que a DEP genômica completa. Para os estimadores de LR, a correlação de Spearman não foi influenciada pela inclusão do TA no modelo. Nos animais com estimulação hormonal foi observado com correlação de 0,95 e sem a estimulação hormonal 0,96. A maior acurácia observada foi a dos animais que passaram por estimulação hormonal (0,38 sem e com TA), mas sem grandes alterações quando comparada entre modelos. O viés para animais estimulados (3,69% sem TA e 1,49% com TA) foi superior ao comparar com animais não estimulados (0,51% sem TA e 0,63% com TA). Nas análises discriminantes, foi possível observar que dentre as variáveis fenotípicas a EGP final foi a característica com maior poder em discriminar novilhas prenhes de vazias, e as DEPs genômicas com maior poder discriminaram foram as DEPs genômicas para PP30 e IPP. Com os resultados obtidos, é possível concluir que existe efeito do viés ao considerar a estimulação hormonal na predição genômica para a PP30, porém as vantagens produtivas que esses protocolos apresentam são superiores. Em nível prático, esses resultados das características fenotípicas e das DEPs genômicas, direcionam manejo e auxiliam nas tomadas de decisão para selecionar animais para precocidade sexual.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-09-26
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-21022024-153824/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/74/74135/tde-21022024-153824/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257235532546048