Diversidade de metabólitos secundáriose e atividade biológica de Epicoccum spp.

• Autor(a) principal: Castaño, Diana Carolina Duque
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13122021-170339/
• topic: Chemotaxonomy; Endófito; Endophyte; Epicolactona; Epicolactone; PKS; PKS; Policetídeos; Polyketides; Quimiotaxonomia

Nesta dissertação foi avaliada a sistemática filogenética de linhagens de Epicoccum spp., incluindo algumas do complexo E. nigrum, à luz de avanços recentes na resolução da história evolutiva do gênero. Além disso, foi avaliada a presença de um gene de uma policetídeo sintase (PKS) potencialmente associada à produção da epicolactona, um composto bioativo de grande interesse pela sua estrutura química, identificado no sobrenadante da cultura E. nigrum P16. Para compreender melhor a relação entre interação e evolução das linhagens, foi testada a correlação entre distância genética e capacidade de inibição de micro-organismos. Foi usada inferência filogenética pelo método de máxima verossimilhança para avaliara abrangência filogenética das linhagens, dentro do gênero Epicoccum. Foram desenhados primers específicos para a KS do gene potencialmente associado à rota de biossíntese da epicolactona e testados em todas as linhagens. Foi realizado um teste de correlação entre as matrizes de distância genética e distância de padrão de inibição qual não demonstrou congruência entre os agrupamentos gerados por estas análises. Os resultados indicam prováveis mudanças na classificação de linhagens do complexo E. nigrum, para gêneros como E. italicum e E. layuense. Também foi observada a presença do gene potencialmente associado à rota de biossíntese da epicolactona em muitas das linhagens de Epicoccum independente da filogenia e do agrupamento gerado pelo padrão de inibição. Adicionalmente, foram obtidos extratos das linhagens para a avaliação de metabólitos secundários os quais estão sendo caracterizados e serão utilizados para gerar uma filogenia baseada em marcadores químicos.