Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ribeiro, Matheus Alberto de Oliveira
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14122021-203305/
Resumo: Imagens provenientes de exames de ressonância magnética cardíaca são reconhecidas como padrão-ouro para o diagnóstico de diversas doenças cardíacas. Biomarcadores estimados a partir da segmentação e análise do ventrículo esquerdo nessas imagens podem ser utilizados em diagnósticos. Entretanto, a segmentação manual do ventrículo esquerdo nas diversas imagens que compõem um exame de ressonância magnética demanda tempo e esforço repetitivo do especialista, o que pode aumentar a variabilidade da qualidade do diagnóstico. Nos últimos anos, diversas abordagens automáticas e semiautomáticas para segmentar o ventrículo esquerdo nessas imagens têm sido propostas na literatura. As principais estratégias envolvem o uso de métodos baseados em atlas, grafos, modelos deformáveis, inteligência artificial, técnicas clássicas de processamento de imagens e combinações híbridas desses, em conjunto com restrições anatômicas referentes à forma do ventrículo. Apesar de apresentarem bons resultados, nenhum método ainda alcançou a excelência do especialista devido à grande variação das estruturas representadas nas imagens de ressonância magnética. A partir de um mapeamento sistemático, foi constatado que a utilização de métodos híbridos que integram inteligência artificial e restrições de forma têm obtido resultados promissores e oferecem uma possível solução ao problema da segmentação, porém ainda sem alcançarem a excelência almejada. O presente trabalho tem como objetivo principal desenvolver um método híbrido que una aprendizado profundo e modelos deformáveis com restrições de forma para segmentar automaticamente o ventrículo esquerdo em imagens de ressonância magnética cardíaca. Os modelos deformáveis favorecem a produção de segmentações precisas e conseguem impor restrições de forma anatômicas, diminuindo a produção de segmentações com erros anatômicos, um dos problemas mais comuns dos métodos recentes. Os resultados indicam que o método produz resultados comparáveis à literatura e anatomicamente mais consistentes, além de demonstrar habilidade de generalização entre diferentes bases de imagens. Porém, o método ainda apresenta um desempenho inferior em fatias apicais e casos específicos de cardiopatias. Além de oferecer uma contribuição para a área de Processamento de Imagens Médicas, o método proposto contribui com a área de auxílio ao diagnóstico em Cardiologia
id USP_82d26026fb118f6bcbb80c18690425bd
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-14122021-203305
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de formaLeft ventricle segmentation in cardiac magnetic resonance imaging with deep learning and deformable models containing shape restrictionsAprendizado profundoCardiac Magnetic ResonanceDeep learningDeformable modelsLeft ventricleModelos deformáveisRessonância Magnética CardíacaSegmentaçãoSegmentationVentrículo esquerdoImagens provenientes de exames de ressonância magnética cardíaca são reconhecidas como padrão-ouro para o diagnóstico de diversas doenças cardíacas. Biomarcadores estimados a partir da segmentação e análise do ventrículo esquerdo nessas imagens podem ser utilizados em diagnósticos. Entretanto, a segmentação manual do ventrículo esquerdo nas diversas imagens que compõem um exame de ressonância magnética demanda tempo e esforço repetitivo do especialista, o que pode aumentar a variabilidade da qualidade do diagnóstico. Nos últimos anos, diversas abordagens automáticas e semiautomáticas para segmentar o ventrículo esquerdo nessas imagens têm sido propostas na literatura. As principais estratégias envolvem o uso de métodos baseados em atlas, grafos, modelos deformáveis, inteligência artificial, técnicas clássicas de processamento de imagens e combinações híbridas desses, em conjunto com restrições anatômicas referentes à forma do ventrículo. Apesar de apresentarem bons resultados, nenhum método ainda alcançou a excelência do especialista devido à grande variação das estruturas representadas nas imagens de ressonância magnética. A partir de um mapeamento sistemático, foi constatado que a utilização de métodos híbridos que integram inteligência artificial e restrições de forma têm obtido resultados promissores e oferecem uma possível solução ao problema da segmentação, porém ainda sem alcançarem a excelência almejada. O presente trabalho tem como objetivo principal desenvolver um método híbrido que una aprendizado profundo e modelos deformáveis com restrições de forma para segmentar automaticamente o ventrículo esquerdo em imagens de ressonância magnética cardíaca. Os modelos deformáveis favorecem a produção de segmentações precisas e conseguem impor restrições de forma anatômicas, diminuindo a produção de segmentações com erros anatômicos, um dos problemas mais comuns dos métodos recentes. Os resultados indicam que o método produz resultados comparáveis à literatura e anatomicamente mais consistentes, além de demonstrar habilidade de generalização entre diferentes bases de imagens. Porém, o método ainda apresenta um desempenho inferior em fatias apicais e casos específicos de cardiopatias. Além de oferecer uma contribuição para a área de Processamento de Imagens Médicas, o método proposto contribui com a área de auxílio ao diagnóstico em CardiologiaImages from cardiac magnetic resonance exams are recognized as the gold standard for diagnosing various heart diseases. Biomarkers estimated from the segmentation and analysis of the left ventricle in these images can be used in diagnosis. However, manual segmentation of the left ventricle in various images of magnetic resonance exams demands time and repetitive effort from the expert, which can increase quality variability of diagnosis. In recent years, several automatic and semiautomatic approaches for left ventricle segmentation in these images have been proposed in the literature. The main strategies involve the use of methods based on atlas, graphs, deformable models, artificial intelligence, classical image processing techniques and hybrid combinations of these, together with anatomical restrictions regarding the shape of the ventricle. Despite showing good results, no method has yet reached the excellence of the expert due to wide variations in structures represented in magnetic resonance images. From a systematic mapping, it was found that the use of hybrid methods integrating artificial intelligence and shape restrictions have obtained promising results and offer a possible solution to the segmentation problem, but still without reaching the desired excellence. The main objective of the present work is to develop a hybrid method that combines deep learning and deformable models with shape restrictions to automatically segment the left ventricle in cardiac magnetic resonance images. Deformable models favor the production of precise segmentations and are able to impose anatomical shape restrictions, reducing the production of segmentations with anatomical errors, one of the most common problems in recent methods. The results indicate that the method produces results comparable to the literature and is anatomically more consistent, while demonstrating generalization ability between different image databases. However, the method still performs poorly in apical slices and specific cases of heart disease. In addition to offering a contribution to the Medical Image Processing area, the proposed method contributes to the area of diagnosis in CardiologyBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMarques, Fátima de Lourdes dos Santos NunesRibeiro, Matheus Alberto de Oliveira2021-10-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14122021-203305/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2022-05-16T15:45:35Zoai:teses.usp.br:tde-14122021-203305Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212022-05-16T15:45:35Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
Left ventricle segmentation in cardiac magnetic resonance imaging with deep learning and deformable models containing shape restrictions
title Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
spellingShingle Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
Ribeiro, Matheus Alberto de Oliveira
Aprendizado profundo
Cardiac Magnetic Resonance
Deep learning
Deformable models
Left ventricle
Modelos deformáveis
Ressonância Magnética Cardíaca
Segmentação
Segmentation
Ventrículo esquerdo
title_short Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
title_full Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
title_fullStr Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
title_full_unstemmed Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
title_sort Segmentação do ventrículo esquerdo em exames de ressonância magnética cardíaca com aprendizado profundo e modelos deformáveis contendo restrições de forma
author Ribeiro, Matheus Alberto de Oliveira
author_facet Ribeiro, Matheus Alberto de Oliveira
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Marques, Fátima de Lourdes dos Santos Nunes
dc.contributor.author.fl_str_mv Ribeiro, Matheus Alberto de Oliveira
dc.subject.por.fl_str_mv Aprendizado profundo
Cardiac Magnetic Resonance
Deep learning
Deformable models
Left ventricle
Modelos deformáveis
Ressonância Magnética Cardíaca
Segmentação
Segmentation
Ventrículo esquerdo
topic Aprendizado profundo
Cardiac Magnetic Resonance
Deep learning
Deformable models
Left ventricle
Modelos deformáveis
Ressonância Magnética Cardíaca
Segmentação
Segmentation
Ventrículo esquerdo
description Imagens provenientes de exames de ressonância magnética cardíaca são reconhecidas como padrão-ouro para o diagnóstico de diversas doenças cardíacas. Biomarcadores estimados a partir da segmentação e análise do ventrículo esquerdo nessas imagens podem ser utilizados em diagnósticos. Entretanto, a segmentação manual do ventrículo esquerdo nas diversas imagens que compõem um exame de ressonância magnética demanda tempo e esforço repetitivo do especialista, o que pode aumentar a variabilidade da qualidade do diagnóstico. Nos últimos anos, diversas abordagens automáticas e semiautomáticas para segmentar o ventrículo esquerdo nessas imagens têm sido propostas na literatura. As principais estratégias envolvem o uso de métodos baseados em atlas, grafos, modelos deformáveis, inteligência artificial, técnicas clássicas de processamento de imagens e combinações híbridas desses, em conjunto com restrições anatômicas referentes à forma do ventrículo. Apesar de apresentarem bons resultados, nenhum método ainda alcançou a excelência do especialista devido à grande variação das estruturas representadas nas imagens de ressonância magnética. A partir de um mapeamento sistemático, foi constatado que a utilização de métodos híbridos que integram inteligência artificial e restrições de forma têm obtido resultados promissores e oferecem uma possível solução ao problema da segmentação, porém ainda sem alcançarem a excelência almejada. O presente trabalho tem como objetivo principal desenvolver um método híbrido que una aprendizado profundo e modelos deformáveis com restrições de forma para segmentar automaticamente o ventrículo esquerdo em imagens de ressonância magnética cardíaca. Os modelos deformáveis favorecem a produção de segmentações precisas e conseguem impor restrições de forma anatômicas, diminuindo a produção de segmentações com erros anatômicos, um dos problemas mais comuns dos métodos recentes. Os resultados indicam que o método produz resultados comparáveis à literatura e anatomicamente mais consistentes, além de demonstrar habilidade de generalização entre diferentes bases de imagens. Porém, o método ainda apresenta um desempenho inferior em fatias apicais e casos específicos de cardiopatias. Além de oferecer uma contribuição para a área de Processamento de Imagens Médicas, o método proposto contribui com a área de auxílio ao diagnóstico em Cardiologia
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-10-20
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14122021-203305/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14122021-203305/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809090727995506688