Estudo citogenético e molecular de síndromes mielodisplásicas / leucemia mieloide aguda familiar

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Marcela Cavalcante de Andrade Silva
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://doi.org/10.11606/T.5.2020.tde-05072020-152816
Resumo: Introdução: Em 2016, a Organização Mundial de Saúde reconheceu em sua classificação as neoplasias mieloides com predisposição germinativa (NMPG). A proporção de casos de síndromes mielodiplásicas/leucemia mielóide aguda (SMD/LMA) relacionados a uma maior predisposição familiar ainda é incerta, mas, tem impacto no seguimento e tratamento destes pacientes e seus familiares. Este estudo teve como objetivo identificar e caracterizar os pacientes com suspeita de NMPG do ambulatório de citopenias do Hospital das Clínicas da Universidade de São Paulo (HC-FMUSP) sob o ponto de vista clínico, hematológico e molecular e evolução clonal nos casos onde foi possível o diagnóstico de mutação germinativa. Métodos: Foram incluídos pacientes do ambulatório de citopenias do HC-FMUSP cadastrados entre 01/01/2010 e 31/12/2018 que apresentavam: 1) diagnóstico de LMA ou SMD com familiares de primeiro grau ou segundo grau também com diagnóstico de LMA, SMD, leucemia linfoide aguda ou trombocitopenia; 2) pacientes com história pessoal ou familiar de citopenias sem causa conhecida, histórico de sangramento, linfedema ou infecções por micobactérias atípicas. Foram excluídos pacientes com diagnóstico de síndromes de insuficiência medular clássica já diagnosticados como anemia de Fanconi. Após obtenção de histórico pessoal e familiar direcionado, sangue periférico, medula óssea e/ou swab de mucosa oral foram coletados para extração de DNA. O caráter germinativo da mutação foi inferido por sua presença em mais de um indivíduo na família. Para investigação de potenciais variantes responsáveis pelo fenótipos identificados, foram realizados sequenciamento de exoma completo (WES), sequenciamento direto por técnica de Sanger (identificação ou confirmação dos resultados de WES), além de Multiplex Ligation-dependent Probe amplification (MLPA) e CGH array para avaliar as variações de número de cópias (CNV) Resultados: De 322 pacientes cadastrados, 30(9,3%) apresentavam suspeita de NMPG, seis (20%) foram excluídos por diagnóstico de anemia de Fanconi. Foram analisados 17 pacientes de 14 famílias distintas e 24 familiares de primeiro e segundo graus. Entre os pacientes, houve predominância do sexo feminino (52,94%), mediana de idade ao diagnóstico de 29 anos. Gene potencialmente associado ao fenótipo foi identificado em sete famílias (50%). Mutação do RUNX1 em dois casos e mutação da ANKRD26 em um dos casos de plaquetopenia familiar com predisposição à neoplasia mieloide. Mutação do gene GATA2 estava presente em três casos e um caso apresentou deleção de porção do braço longo do cromossomo 22 que, em associação com atraso do desenvolvimento neuropsicomotor, plaquetopenia familiar, foi compatível com síndrome deleção 22q. Evolução clonal citogenética foi identificada em quatro indivíduos (três com suspeita de síndrome de deficiência do GATA2 e um com plaquetopenia familiar associada à mutação de ANKRD26). Evolução clonal molecular estava presente em cinco de seis dos pacientes testados (83%) e apenas um de 11 familiares (9%) de cinco famílias distintas. Conclusão: Suspeita de NMPG correspondeu a uma porção significativa dos pacientes em seguimento no ambulatório de citopenias. A confirmação foi possível em apenas metade dos casos. Evolução clonal molecular não foi identificada em todos os pacientes, sugerindo que hajam outros mecanismos de progressão para neoplasia mieloide.
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spelling info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis Estudo citogenético e molecular de síndromes mielodisplásicas / leucemia mieloide aguda familiar Molecular and cytogenetic study of familial myelodysplstic syndromes/acute myeloid leukemia 2020-01-31Elvira Deolinda Rodrigues Pereira VellosoMaria de Lourdes Lopes Ferrari ChauffailleEduardo Magalhães RegoMaria Claudia Nogueira ZerbiniMarcela Cavalcante de Andrade SilvaUniversidade de São PauloPatologiaUSPBR Acute myeloid leukemia Deficiência de GATA2 GATA2 deficiency Germ line mutation Leucemia mieloide aguda Mutação em linhagem germinativa Pre leukemia Pré-leucemia Introdução: Em 2016, a Organização Mundial de Saúde reconheceu em sua classificação as neoplasias mieloides com predisposição germinativa (NMPG). A proporção de casos de síndromes mielodiplásicas/leucemia mielóide aguda (SMD/LMA) relacionados a uma maior predisposição familiar ainda é incerta, mas, tem impacto no seguimento e tratamento destes pacientes e seus familiares. Este estudo teve como objetivo identificar e caracterizar os pacientes com suspeita de NMPG do ambulatório de citopenias do Hospital das Clínicas da Universidade de São Paulo (HC-FMUSP) sob o ponto de vista clínico, hematológico e molecular e evolução clonal nos casos onde foi possível o diagnóstico de mutação germinativa. Métodos: Foram incluídos pacientes do ambulatório de citopenias do HC-FMUSP cadastrados entre 01/01/2010 e 31/12/2018 que apresentavam: 1) diagnóstico de LMA ou SMD com familiares de primeiro grau ou segundo grau também com diagnóstico de LMA, SMD, leucemia linfoide aguda ou trombocitopenia; 2) pacientes com história pessoal ou familiar de citopenias sem causa conhecida, histórico de sangramento, linfedema ou infecções por micobactérias atípicas. Foram excluídos pacientes com diagnóstico de síndromes de insuficiência medular clássica já diagnosticados como anemia de Fanconi. Após obtenção de histórico pessoal e familiar direcionado, sangue periférico, medula óssea e/ou swab de mucosa oral foram coletados para extração de DNA. O caráter germinativo da mutação foi inferido por sua presença em mais de um indivíduo na família. Para investigação de potenciais variantes responsáveis pelo fenótipos identificados, foram realizados sequenciamento de exoma completo (WES), sequenciamento direto por técnica de Sanger (identificação ou confirmação dos resultados de WES), além de Multiplex Ligation-dependent Probe amplification (MLPA) e CGH array para avaliar as variações de número de cópias (CNV) Resultados: De 322 pacientes cadastrados, 30(9,3%) apresentavam suspeita de NMPG, seis (20%) foram excluídos por diagnóstico de anemia de Fanconi. Foram analisados 17 pacientes de 14 famílias distintas e 24 familiares de primeiro e segundo graus. Entre os pacientes, houve predominância do sexo feminino (52,94%), mediana de idade ao diagnóstico de 29 anos. Gene potencialmente associado ao fenótipo foi identificado em sete famílias (50%). Mutação do RUNX1 em dois casos e mutação da ANKRD26 em um dos casos de plaquetopenia familiar com predisposição à neoplasia mieloide. Mutação do gene GATA2 estava presente em três casos e um caso apresentou deleção de porção do braço longo do cromossomo 22 que, em associação com atraso do desenvolvimento neuropsicomotor, plaquetopenia familiar, foi compatível com síndrome deleção 22q. Evolução clonal citogenética foi identificada em quatro indivíduos (três com suspeita de síndrome de deficiência do GATA2 e um com plaquetopenia familiar associada à mutação de ANKRD26). Evolução clonal molecular estava presente em cinco de seis dos pacientes testados (83%) e apenas um de 11 familiares (9%) de cinco famílias distintas. Conclusão: Suspeita de NMPG correspondeu a uma porção significativa dos pacientes em seguimento no ambulatório de citopenias. A confirmação foi possível em apenas metade dos casos. Evolução clonal molecular não foi identificada em todos os pacientes, sugerindo que hajam outros mecanismos de progressão para neoplasia mieloide. Background: In 2016, the World Health Organization (WHO) recognized in its classification, myeloid neoplasms with germline predisposition (MNGP). The proportion of cases of myelodysplastic syndromes/acute myeloid leukemia (MDS/AML) associated with family predisposition is still uncertain but has an impact on the follow-up and treatment of these patients and their families. This study aims to identify and characterize patients with suspected MNGP from the cytopenias outpatient clinic of the University of São Paulo Hospital das Clinicas (HC-FMUSP) and clonal evolution in cases where the diagnosis of germline mutation was made. Methods: In this study, we included patients from the HC-FMUSP cytopenia outpatient clinic registered between 01/01/2010 and 31/12/2018. Criteria for inclusion were: 1) diagnosis of AML or MDS with first or second-degree relatives also diagnosed with AML, MDS, acute lymphoid leukemia or thrombocytopenia; 2) personal or family history of cytopenias with no known cause, history of bleeding, lymphedema or atypical bacterial infections. Patients previously diagnosed with classic bone marrow failure syndromes such as Fanconi Anemia were excluded. After obtaining a personal and family history, peripheral blood, bone marrow, and oral mucosa swab were collected for DNA extraction. Germline origin of mutations was inferred by its presence in more than one individual in the family. In order to investigate potential variants responsible for the identified phenotypes, whole-exome sequencing (WES), Sanger direct sequencing (identification or confirmation of WES results). MLPA and CGH array was performed to evaluate copy number variations (CNV). Results: Of 322 registered patients, 30 (9.3%) had suspected MNGP, 6 (20%) were excluded due to diagnosis of Fanconi anemia. Seventeen patients from 14 different families and 24 first and second-degree relatives were analyzed. Among the patients, there was a predominance of females (52.94%); the median age at diagnosis was 29 years. Seven families (50%) had a gene associated with the phenotype identified. RUNX1 mutation in 2 cases and ANKRD26 mutation in 1 of familial thrombocytopenia cases with predisposition to myeloid neoplasia. GATA2 mutation was present in 3 cases, and 1 case presented with a deletion of a portion of the long arm of chromosome 22, which in association with developmental delay and familial thrombocytopenia was compatible with 22q deletion syndrome. Cytogenetic clonal evolution was identified in 4 individuals (3 with suspected GATA2 deficiency syndrome and one with familial thrombocytopenia associated with ANKRD26 mutation.) Molecular clonal evolution was present in 5 of 6 of the patients tested (83%) and only 1 of 11 family members (9%) from 5 different families. Conclusion: Suspected MNGP represents a significant portion of patients at the cytopenia outpatient clinic. Confirmation was possible in only half of the cases. Molecular clonal evolution was not present in all patients suggesting that there may be other mechanisms of progression to myeloid neoplasm https://doi.org/10.11606/T.5.2020.tde-05072020-152816info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USP2023-12-21T18:16:06Zoai:teses.usp.br:tde-05072020-152816Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-12-22T12:10:19.557012Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
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