Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Braga, Bárbara Leitão
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5166/tde-09062022-124921/
Resumo: A hipospadia é um distúrbio congênito comum da formação genital masculina. Crianças nascidas pequenas para a idade gestacional (PIG) apresentam alta frequência de hipospadia de etiologia indeterminada. Nenhum estudo anterior investigou a etiologia molecular da hipospadia em meninos nascidos PIG usando sequenciamento paralelo em larga escala. Nosso objetivo é relatar os achados genéticos de uma coorte de pacientes nascidos PIG com hipospadia mediana ou proximal através de sequenciamento paralelo em larga escala e analisar o perfil molecular de pacientes PIG sem hipospadia. Dentro de uma coorte de indivíduos DDS 46,XY, foram selecionados 79 com este fenótipo, incluindo treze indivíduos com características sindrômicas. Os pacientes sindrômicos com três ou mais características clínicas principais da síndrome de Silver-Russell (SRS) foram estudados primeiramente por MLPA. As demais amostras de DNA foram estudadas por sequenciamento paralelo em larga escala. Entre os pacientes sindrômicos, a perda de metilação do DNA na região de controle de imprinting H19/IGF2 foi identificada em oito indivíduos com suspeita clínica de SRS e a dissomia uniparental do cromossomo 7 foi identificada em um paciente. Duas novas variantes patogênicas em heterozigose composta foram identificadas no gene CUL7 estabelecendo o diagnóstico de síndrome 3M em um paciente, e uma nova variante homozigótica no TRIM37 foi identificada em outro menino com fenótipo de nanismo de Mulibrey. Entre os indivíduos não sindrômicos, oito variantes heterozigotas raras foram identificadas em sete genes relacionados ao DDS. No entanto, nenhuma das variantes encontradas explica o fenótipo dos pacientes. Em conclusão, não foi encontrado defeito genético que esclareça a etiologia da hipospadia na maioria das crianças PIG não sindrômicas, corroborando a hipótese de que causas multifatoriais, novos genes e/ou defeitos epigenéticos não identificados podem influenciar nessa condição
id USP_86ee573a7e475664a5b015b2e17f7d2f
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-09062022-124921
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípicaAnalysis of the genetic profile of patients born small for gestational age with and without atypical genitaliaAmbiguidade genitalDiferenças do desenvolvimento sexualGenital ambiguityHighthroughput nucleotide sequencingHipospadiaHypospadiasInfant small for gestational ageMolecular diagnostic techniquesRecém-nascido pequeno para a idade gestacionalSequenciamento de nucleotídeos em larga escalaSilver-Russell syndrome, Disorders of sex developmentSíndrome de Silver-RussellTécnicas de diagnóstico molecularA hipospadia é um distúrbio congênito comum da formação genital masculina. Crianças nascidas pequenas para a idade gestacional (PIG) apresentam alta frequência de hipospadia de etiologia indeterminada. Nenhum estudo anterior investigou a etiologia molecular da hipospadia em meninos nascidos PIG usando sequenciamento paralelo em larga escala. Nosso objetivo é relatar os achados genéticos de uma coorte de pacientes nascidos PIG com hipospadia mediana ou proximal através de sequenciamento paralelo em larga escala e analisar o perfil molecular de pacientes PIG sem hipospadia. Dentro de uma coorte de indivíduos DDS 46,XY, foram selecionados 79 com este fenótipo, incluindo treze indivíduos com características sindrômicas. Os pacientes sindrômicos com três ou mais características clínicas principais da síndrome de Silver-Russell (SRS) foram estudados primeiramente por MLPA. As demais amostras de DNA foram estudadas por sequenciamento paralelo em larga escala. Entre os pacientes sindrômicos, a perda de metilação do DNA na região de controle de imprinting H19/IGF2 foi identificada em oito indivíduos com suspeita clínica de SRS e a dissomia uniparental do cromossomo 7 foi identificada em um paciente. Duas novas variantes patogênicas em heterozigose composta foram identificadas no gene CUL7 estabelecendo o diagnóstico de síndrome 3M em um paciente, e uma nova variante homozigótica no TRIM37 foi identificada em outro menino com fenótipo de nanismo de Mulibrey. Entre os indivíduos não sindrômicos, oito variantes heterozigotas raras foram identificadas em sete genes relacionados ao DDS. No entanto, nenhuma das variantes encontradas explica o fenótipo dos pacientes. Em conclusão, não foi encontrado defeito genético que esclareça a etiologia da hipospadia na maioria das crianças PIG não sindrômicas, corroborando a hipótese de que causas multifatoriais, novos genes e/ou defeitos epigenéticos não identificados podem influenciar nessa condiçãoHypospadias is a common congenital disorder of male genital formation. Children born small for gestational age (SGA) present a high frequency of hypospadias of undetermined etiology. No previous study investigated the molecular etiology of hypospadias in boys born SGA using massively parallel sequencing. Our objective is to report the genetic findings of a cohort of patients born SGA with medium or proximal hypospadias and the analyses of the molecular profile of patients born SGA without hypospadias. We identified 79 SGA individuals from a large cohort of 46,XY DSD patients, including 13 individuals with syndromic features. DNA samples from subjects were studied by either whole exome sequencing or target gene panel approach. The syndromic patients having three or more main clinical features of Silver-Russell syndrome (SRS) were first studied by MLPA. Among the syndromic patients, loss of DNA methylation at the imprinting control region H19/IGF2 was identified in 8 individuals with SRS clinical diagnosis and uniparental disomy (UPD) of chromosome 7 in one patient. Two novel pathogenic variants in compound heterozygous state were identified in the CUL7 gene establishing the diagnosis of 3M syndrome in one patient, and a novel homozygous variant in TRIM37 was identified in another boy with Mulibrey nanism phenotype. Among the nonsyndromic subjects, eight rare heterozygous variants were identified in seven DSD-related genes. However, none of the variants found can explain the phenotype by themselves. In conclusion, a genetic defect that clarifies the etiology of hypospadias was not found in most of the non-syndromic SGA children, supporting the hypothesis that multifactorial causes, new genes, and/or unidentified epigenetic defects may have an influence in this conditionBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPMendonça, Berenice Bilharinho deBraga, Bárbara Leitão2022-03-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5166/tde-09062022-124921/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2022-06-14T12:24:12Zoai:teses.usp.br:tde-09062022-124921Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212022-06-14T12:24:12Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
Analysis of the genetic profile of patients born small for gestational age with and without atypical genitalia
title Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
spellingShingle Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
Braga, Bárbara Leitão
Ambiguidade genital
Diferenças do desenvolvimento sexual
Genital ambiguity
Highthroughput nucleotide sequencing
Hipospadia
Hypospadias
Infant small for gestational age
Molecular diagnostic techniques
Recém-nascido pequeno para a idade gestacional
Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala
Silver-Russell syndrome, Disorders of sex development
Síndrome de Silver-Russell
Técnicas de diagnóstico molecular
title_short Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
title_full Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
title_fullStr Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
title_full_unstemmed Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
title_sort Comparação do perfil genético de pacientes nascidos pequenos para a idade gestacional com e sem genitália atípica
author Braga, Bárbara Leitão
author_facet Braga, Bárbara Leitão
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Mendonça, Berenice Bilharinho de
dc.contributor.author.fl_str_mv Braga, Bárbara Leitão
dc.subject.por.fl_str_mv Ambiguidade genital
Diferenças do desenvolvimento sexual
Genital ambiguity
Highthroughput nucleotide sequencing
Hipospadia
Hypospadias
Infant small for gestational age
Molecular diagnostic techniques
Recém-nascido pequeno para a idade gestacional
Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala
Silver-Russell syndrome, Disorders of sex development
Síndrome de Silver-Russell
Técnicas de diagnóstico molecular
topic Ambiguidade genital
Diferenças do desenvolvimento sexual
Genital ambiguity
Highthroughput nucleotide sequencing
Hipospadia
Hypospadias
Infant small for gestational age
Molecular diagnostic techniques
Recém-nascido pequeno para a idade gestacional
Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala
Silver-Russell syndrome, Disorders of sex development
Síndrome de Silver-Russell
Técnicas de diagnóstico molecular
description A hipospadia é um distúrbio congênito comum da formação genital masculina. Crianças nascidas pequenas para a idade gestacional (PIG) apresentam alta frequência de hipospadia de etiologia indeterminada. Nenhum estudo anterior investigou a etiologia molecular da hipospadia em meninos nascidos PIG usando sequenciamento paralelo em larga escala. Nosso objetivo é relatar os achados genéticos de uma coorte de pacientes nascidos PIG com hipospadia mediana ou proximal através de sequenciamento paralelo em larga escala e analisar o perfil molecular de pacientes PIG sem hipospadia. Dentro de uma coorte de indivíduos DDS 46,XY, foram selecionados 79 com este fenótipo, incluindo treze indivíduos com características sindrômicas. Os pacientes sindrômicos com três ou mais características clínicas principais da síndrome de Silver-Russell (SRS) foram estudados primeiramente por MLPA. As demais amostras de DNA foram estudadas por sequenciamento paralelo em larga escala. Entre os pacientes sindrômicos, a perda de metilação do DNA na região de controle de imprinting H19/IGF2 foi identificada em oito indivíduos com suspeita clínica de SRS e a dissomia uniparental do cromossomo 7 foi identificada em um paciente. Duas novas variantes patogênicas em heterozigose composta foram identificadas no gene CUL7 estabelecendo o diagnóstico de síndrome 3M em um paciente, e uma nova variante homozigótica no TRIM37 foi identificada em outro menino com fenótipo de nanismo de Mulibrey. Entre os indivíduos não sindrômicos, oito variantes heterozigotas raras foram identificadas em sete genes relacionados ao DDS. No entanto, nenhuma das variantes encontradas explica o fenótipo dos pacientes. Em conclusão, não foi encontrado defeito genético que esclareça a etiologia da hipospadia na maioria das crianças PIG não sindrômicas, corroborando a hipótese de que causas multifatoriais, novos genes e/ou defeitos epigenéticos não identificados podem influenciar nessa condição
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-03-28
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5166/tde-09062022-124921/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5166/tde-09062022-124921/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809090550339469312

Registros relacionados