Estudo teórico de propriedades espectroscópicas do complexo guanina-citosina

• Autor(a) principal: Ludwig, Valdemir Eneias
• Data de Publicação: 2001
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-28052021-153817/
• topic: ESPECTROSCOPIA; FÍSICA; PHYSICS; SPECTROSCOPY

Besta dissertação estudamos teoricamente as modificações estrturais e espectroscópicas decorrentes da interação guanina-citosina na estrutura de Watson-Crick com três ligações de hidrogênio. Utilizando métodos \"ab initio\" Hartree-Fock, teoria deperturbação de segunda ordem e teoria do funcional da densidade empregando os funcionais B3LYP, BP86 com diferentes funções base otimizamos a geometria da guanina, citosina e do complexo guanina-citosina. As modificações estruturais devido à complexação são analisadas e comparadas entre si e com os resultados experimentais existentes. A energia de ligação é obtida usando os mesmos métodos em que a molécula foi otimizada e corrigida devido ao erro de superposição de bases e as energias de ponto zero. Os nossos resultados obtém uma energia de ligação em boa concordância com os resultados experimentais, mas superestima este valor por 1-2 kcal/mol. O espectro infra-vermelho é calculado e uma análise detalhada é feita da mudança das freqüências vibracionais devido à formação do complexo. Analogamente o espectro UV-visível é calculado para a guanina citosina e para o complexo usando o método de até 1500 \'cm POT. -1\' devido à formação do complexo. Adicionalmente uma transição de baixa intensidade associada com a tranferência de carga da guanina para a citosina é identificada. Finalmente, os efeitos de solventes (água) são estimados usando-se o modelo de campo de reação auto-consistente