Expressão e estrutura da proteína ligante de lipídio 3 (lbp-3), e o efeito da suplementação de ácidos graxos na tolerância a dessecação do nematoide Panagrolaimus superbus

• Autor(a) principal: Moraes, Vitor Nolasco de
• Data de Publicação: 2023
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-29062023-134910/
• topic: Ácidos graxos; Alphafold; Alphafold; Anhydrobiosis; Anidrobiose; Fatty acids; LBPs; LBPs; Modelagem estrutural; Structural modeling

Anidrobiose é um estado de animação suspensa em que alguns organismos entram frente ao estresse hídrico, tendo sua atividade metabólica retomada quando reidratados. Lipídios possuem importantes funções energéticas, na sinalização, e composição de membranas em condições normais e durante dessecação. Pouco se sabe sobre a relação das moléculas estruturais dos lipídios, i.e., os ácidos graxos, e a anidrobiose. O presente trabalho focou em avaliar o efeito da suplementação com ácido mirístico e ácido linoleico na anidrobiose do nematoide P. superbus, a expressão de genes relacionados ao metabolismo de ácidos graxos, como também, caracterizar estruturalmente a proteína LBP-3. Para o desenvolvimento do estudo, os vermes foram cultivados em placas suplementadas com 0,8 mM e 4 mM de ácido mirístico e ácido linoleico durante três e dez dias, e então foram avaliados a viabilidade e crescimento populacional antes e após a indução da anidrobiose. A expressão gênica foi avaliada por RT-qPCR. A estrutura proteica de LBP-3 foi modelada utilizando o programa AlphaFold e analisada para a busca por diferenças estruturais com proteínas de organismos não anidrobiontes. Foi observado que o ácido linoleico prejudica a tolerância do P. superbus à dessecação extrema, e leva ao menor crescimento populacional. Sob estresse da dessecação, fat-5 e nhr-49 apresentaram redução significativa na expressão gênica, enquanto lbp-3 aumentou significativamente. Em relação às análises estruturais, foi observado que LBP-3 apresenta uma sequência sinal de exportação nuclear composta pelos 21 primeiros aminos ácidos na porção N-terminal, diferentes orientações nas a-hélices e uma composição de amino ácidos hidrofílicos na base de sua estrutura de barril-b. Os resultados sugerem que a composição de ácidos graxos no metabolismo é importante para a tolerância a anidrobiose, e que lbp-3 possivelmente é um novo gene relacionado a anidrobiose.