Avaliação genômica de linfonodos biopsiados por ecobroncoscopia como complementação ao estadiamento TNM de pacientes com adenocarcinoma de pulmão
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Data de Publicação: | 2024 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-12092024-145037/ |
Resumo: | O câncer de pulmão é o mais incidente no mundo, representando um importante problema de saúde pública nas últimas décadas, principalmente pelo aumento da expectativa de vida da população. O carcinoma de pulmão de células não pequenas (CPCNP) é o tipo histológico mais frequente (70 a 85%), e o subtipo adenocarcinoma (ADC), o mais prevalente. Esse subtipo se caracteriza pela baixa resposta ao tratamento convencional, 50% de metástases ao diagnóstico e sobrevida em cinco anos de aproximadamente 15% dos pacientes. Os linfonodos mediastinais (LM) no CPCNP são componentes chave para o estadiamento, escolha terapêutica e avaliação prognóstica. Com o desenvolvimento de técnicas minimamente invasivas, como a de aspiração transbrônquica com agulha guiada por ecobroncoscopia (EBUS-TBNA), é possível biopsiar e detectar alterações histológicas linfonodais com sensibilidade, especificidade e acurácia de 80 a 100%. Teorizamos que amostras de LM obtidas por EBUS-TBNA e submetidas a análises genômicas, com painel gênico de interesse, poderiam revelar variantes genômicas com relevância clínica e prognóstica, especialmente em linfonodos histologicamente negativos, complementando o estadiamento histológico. Objetivo: Investigar a presença dessas variantes somáticas em tumores primários (TP) e LM de pacientes portadores de ADC pulmonar avaliando sua relevância no prognóstico e sobrevida. O DNA genômico foi extraído de espécimes fixados em formalina e embebidos em parafina e de raspado de lâminas de uma coorte de 32 pacientes (pareados TP e LM). Cento e sete genes relacionados aos CPCNP e suas vias metastáticas foram analisados pela técnica de Sequenciamento de Nova Geração (NGS). Em 23 (72%) das amostras de TP e 25 (75%) de amostras de LM foram detectadas variantes com forte ou potencial significado clínico. Todos os LMs histologicamente positivos, apresentaram variantes e 13 (62%) dos casos de LM classificadas com histologicamente negativos também apresentaram. A concordância entre o perfil mutacional de TP e LM do mesmo paciente ocorreu em 6 (54,5%) dos casos com histologia linfonodal positiva. Os genes de maior frequência mutacional foram EGFR, TP53, ATM e KRAS, e todas as variantes encontradas estão relacionadas com vias de ação de terapias alvo. A presença de variantes em amostras de TP não teve impacto na sobrevida global (SG) dos pacientes. Notavelmente, pacientes com variantes em LM, independente do perfil histológico, apresentaram SG reduzida quando presentes nos TP53 e ATM, comparado aos pacientes com genes selvagem (p=0.001 e p=0.035, respectivamente). Concluímos que o achado de variantes genômicas identificadas em espécimes de LM obtidos pelo EBUS-TBNA podem ter impacto clínico na recorrência e metástases ocultas em pacientes diagnosticados com ADC. A incorporação de testes genômicos aplicados também a amostras de LM negativas pode aumentar a precisão do estadiamento TNM, fornecendo uma vantagem adicional na escolha da melhor opção terapêutica ao paciente, além de explicar casos observados de recorrência e curta sobrevida em pacientes com ADC em estadiamentos precoces |
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Avaliação genômica de linfonodos biopsiados por ecobroncoscopia como complementação ao estadiamento TNM de pacientes com adenocarcinoma de pulmãoGenomic evaluation of lymph nodes biopsied via echobronchoscopy as a complementary tool for TNM staging in patients with lung adenocarcinomaAdenocarcinoma de pulmãoCarcinoma pulmonar de células não pequenasDNA genômicoEBUS-TBNAEBUS-TBNAEchobronchoscopyEcobroncoscopiaGenomic DNALinfonodo mediastinalLung adenocarcinomaLung cancerLymph node metastasisMassive parallel sequencingMediastinal lymph nodeMetástase linfonodalNeoplasias pulmonaresNext generation sequencingNon-small cell lung carcinomaSequenciamento de nova geraçãoSequenciamento massivo em paraleloO câncer de pulmão é o mais incidente no mundo, representando um importante problema de saúde pública nas últimas décadas, principalmente pelo aumento da expectativa de vida da população. O carcinoma de pulmão de células não pequenas (CPCNP) é o tipo histológico mais frequente (70 a 85%), e o subtipo adenocarcinoma (ADC), o mais prevalente. Esse subtipo se caracteriza pela baixa resposta ao tratamento convencional, 50% de metástases ao diagnóstico e sobrevida em cinco anos de aproximadamente 15% dos pacientes. Os linfonodos mediastinais (LM) no CPCNP são componentes chave para o estadiamento, escolha terapêutica e avaliação prognóstica. Com o desenvolvimento de técnicas minimamente invasivas, como a de aspiração transbrônquica com agulha guiada por ecobroncoscopia (EBUS-TBNA), é possível biopsiar e detectar alterações histológicas linfonodais com sensibilidade, especificidade e acurácia de 80 a 100%. Teorizamos que amostras de LM obtidas por EBUS-TBNA e submetidas a análises genômicas, com painel gênico de interesse, poderiam revelar variantes genômicas com relevância clínica e prognóstica, especialmente em linfonodos histologicamente negativos, complementando o estadiamento histológico. Objetivo: Investigar a presença dessas variantes somáticas em tumores primários (TP) e LM de pacientes portadores de ADC pulmonar avaliando sua relevância no prognóstico e sobrevida. O DNA genômico foi extraído de espécimes fixados em formalina e embebidos em parafina e de raspado de lâminas de uma coorte de 32 pacientes (pareados TP e LM). Cento e sete genes relacionados aos CPCNP e suas vias metastáticas foram analisados pela técnica de Sequenciamento de Nova Geração (NGS). Em 23 (72%) das amostras de TP e 25 (75%) de amostras de LM foram detectadas variantes com forte ou potencial significado clínico. Todos os LMs histologicamente positivos, apresentaram variantes e 13 (62%) dos casos de LM classificadas com histologicamente negativos também apresentaram. A concordância entre o perfil mutacional de TP e LM do mesmo paciente ocorreu em 6 (54,5%) dos casos com histologia linfonodal positiva. Os genes de maior frequência mutacional foram EGFR, TP53, ATM e KRAS, e todas as variantes encontradas estão relacionadas com vias de ação de terapias alvo. A presença de variantes em amostras de TP não teve impacto na sobrevida global (SG) dos pacientes. Notavelmente, pacientes com variantes em LM, independente do perfil histológico, apresentaram SG reduzida quando presentes nos TP53 e ATM, comparado aos pacientes com genes selvagem (p=0.001 e p=0.035, respectivamente). Concluímos que o achado de variantes genômicas identificadas em espécimes de LM obtidos pelo EBUS-TBNA podem ter impacto clínico na recorrência e metástases ocultas em pacientes diagnosticados com ADC. A incorporação de testes genômicos aplicados também a amostras de LM negativas pode aumentar a precisão do estadiamento TNM, fornecendo uma vantagem adicional na escolha da melhor opção terapêutica ao paciente, além de explicar casos observados de recorrência e curta sobrevida em pacientes com ADC em estadiamentos precocesLung cancer ranks as the most prevalent form of cancer globally, representing a significant public health challenge in recent years, largely attributable to increased life expectancy. Nonsmall cell lung carcinoma (NSCLC), encompassing 70 to 85% of cases, with adenocarcinoma subtype (ADC) being the most common, reflects this trend. ADC is characterized by a poor response to conventional treatments, 50% of cases diagnosed with metastases, and a five-year survival rate of approximately 15%. Mediastinal lymph nodes (LM) play a pivotal role in NSCLC staging, treatment decisions, and prognostic evaluations. The advent of minimally invasive techniques, such as echobronchoscopy-guided transbronchial needle aspiration (EBUS-TBNA), enables the biopsy and histological analysis of LM with a sensitivity, specificity, and accuracy ranging from 80 to 100%. We hypothesize that LM samples obtained via EBUS-TBNA and subjected to genomic analysis, focusing on a targeted gene panel, could reveal clinically and prognostically relevant genomic variants, particularly in histologically negative lymph nodes, thus complementing histological staging. Our objective is to investigate the presence of these somatic variants in primary tumors (TP) and LM of patients with pulmonary ADC and assess their significance in prognosis and survival. Genomic DNA was extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded specimens and slide scrapings from a cohort of 32 patients (paired TP and LM). We analyzed 107 genes associated with NSCLC and its metastatic pathways using Next Generation Sequencing (NGS) technology. Variants with strong or potential clinical significance were detected in 23 (72%) of the TP samples and 25 (75%) of the LM samples. All histologically positive LMs exhibited variants, and 13 (62%) of the histologically negative LM cases also showed variants. Agreement in the mutational profile between TP and LM of the same patient was observed in 6 (54.5%) of the cases with positive lymph node histology. The most frequently mutated genes were EGFR, TP53, ATM, and KRAS, with identified variants linked to targeted therapy pathways. The presence of variants in TP samples did not significantly impact overall survival (OS). However, patients with variants in LM, irrespective of histological profile, demonstrated reduced OS when variants were present in TP53 and ATM compared to patients with wild-type genes (p=0.001 and p=0.035, respectively). In conclusion, identifying genomic variants in LM specimens obtained via EBUS-TBNA can have clinical implications for recurrence and occult metastases in ADCdiagnosed patients. Integrating genomic testing, including in negative LM samples, can enhance TNM staging accuracy, offering an added advantage in selecting optimal therapeutic strategies and elucidating cases of recurrence and shortened survival in early-stage ADC patientsBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPAntonangelo, LeilaFaria, Caroline Silverio2024-06-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5144/tde-12092024-145037/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-10-24T17:36:02Zoai:teses.usp.br:tde-12092024-145037Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-10-24T17:36:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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O câncer de pulmão é o mais incidente no mundo, representando um importante problema de saúde pública nas últimas décadas, principalmente pelo aumento da expectativa de vida da população. O carcinoma de pulmão de células não pequenas (CPCNP) é o tipo histológico mais frequente (70 a 85%), e o subtipo adenocarcinoma (ADC), o mais prevalente. Esse subtipo se caracteriza pela baixa resposta ao tratamento convencional, 50% de metástases ao diagnóstico e sobrevida em cinco anos de aproximadamente 15% dos pacientes. Os linfonodos mediastinais (LM) no CPCNP são componentes chave para o estadiamento, escolha terapêutica e avaliação prognóstica. Com o desenvolvimento de técnicas minimamente invasivas, como a de aspiração transbrônquica com agulha guiada por ecobroncoscopia (EBUS-TBNA), é possível biopsiar e detectar alterações histológicas linfonodais com sensibilidade, especificidade e acurácia de 80 a 100%. Teorizamos que amostras de LM obtidas por EBUS-TBNA e submetidas a análises genômicas, com painel gênico de interesse, poderiam revelar variantes genômicas com relevância clínica e prognóstica, especialmente em linfonodos histologicamente negativos, complementando o estadiamento histológico. Objetivo: Investigar a presença dessas variantes somáticas em tumores primários (TP) e LM de pacientes portadores de ADC pulmonar avaliando sua relevância no prognóstico e sobrevida. O DNA genômico foi extraído de espécimes fixados em formalina e embebidos em parafina e de raspado de lâminas de uma coorte de 32 pacientes (pareados TP e LM). Cento e sete genes relacionados aos CPCNP e suas vias metastáticas foram analisados pela técnica de Sequenciamento de Nova Geração (NGS). Em 23 (72%) das amostras de TP e 25 (75%) de amostras de LM foram detectadas variantes com forte ou potencial significado clínico. Todos os LMs histologicamente positivos, apresentaram variantes e 13 (62%) dos casos de LM classificadas com histologicamente negativos também apresentaram. A concordância entre o perfil mutacional de TP e LM do mesmo paciente ocorreu em 6 (54,5%) dos casos com histologia linfonodal positiva. Os genes de maior frequência mutacional foram EGFR, TP53, ATM e KRAS, e todas as variantes encontradas estão relacionadas com vias de ação de terapias alvo. A presença de variantes em amostras de TP não teve impacto na sobrevida global (SG) dos pacientes. Notavelmente, pacientes com variantes em LM, independente do perfil histológico, apresentaram SG reduzida quando presentes nos TP53 e ATM, comparado aos pacientes com genes selvagem (p=0.001 e p=0.035, respectivamente). Concluímos que o achado de variantes genômicas identificadas em espécimes de LM obtidos pelo EBUS-TBNA podem ter impacto clínico na recorrência e metástases ocultas em pacientes diagnosticados com ADC. A incorporação de testes genômicos aplicados também a amostras de LM negativas pode aumentar a precisão do estadiamento TNM, fornecendo uma vantagem adicional na escolha da melhor opção terapêutica ao paciente, além de explicar casos observados de recorrência e curta sobrevida em pacientes com ADC em estadiamentos precoces |
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