Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2003 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
Texto Completo: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-22022022-113227/ |
Resumo: | No presente estudo realizou-se a triagem para detecção de mutações nos genes katG, kasA, inhA, e região intergênica oxyR-ahpC pela PCR-SSCP e a confirmação por seqüenciamento semi-automático, em 97 isolados resistentes e 60 sensíveis a INH, de M. tuberculosis de origem brasileira. Foi também, investigado a freqüência destas mutações. A determinação da concentração inibitória mínima (CIM) para os isolados resistentes foi realizada pela técnica de Alamar Blue (MABA). A caracterização molecular dos isolados sensíveis e resistentes a INH, foi feita por \"Spoligotyping\" da região hipervariável locus DR. Foi obtido 40 diferentes padrões de \"Spoligotyping\" para os 97 isolados clínicos resistentes e um total de 30 para os 60 isolados sensíveis de M. tuberculosis. Nenhum isolado estudado apresentou o gene katG deletado na integra. No entanto, encontrou-se um isolado com deleção na região 3\' neste gene e uma alta porcentagem de mutação (85,6%); principalmente no codon 315 (61,9%). Foram detectadas 25 novas mutações ainda não descritas na literatura entre os isolados resistentes, no gene KatG, assim como 25,8% dos isolados resistentes apresentaram mutação na região promotora e 5,82% na região estrutural do gene inhA e 10,3% na região intergênica oxyR-ahpC sendo uma mutação (-48) ainda não descrita na literatura. No gene kasA, foram observadas mutações tanto em isolados sensíveis como em resistentes a INH. A mutação mais frequente observada nesse gene foi no codon 269 que causou a alteração G269S (23,7%). Algumas mutações silenciosas, em menor porcentagem, foram detectadas somente nos isolados sensíveis. A técnica de PCR-SSCP demonstrou boa sensibilidade, detectando 90, 7% das mutações analisando 5 regiões gênicas (região adjacente ao codon 315 do gene katG, região promotora e estrutural do gene inhA e região intergênica oxyR-ahpC). Concordância de 100% foi verificado entre as técnicas de PCR-SSCP e de seqüenciamento. Portanto pode-se concluir que a triagem por PCR-SSCP pode ser utilizada com segurança para essa finalidade. |
id |
USP_beced0e7c821f933a4f978d4f6cd65a2 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:teses.usp.br:tde-22022022-113227 |
network_acronym_str |
USP |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
repository_id_str |
2721 |
spelling |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileiraAnálise de mutações nos genes relacionados com resistências a isoniazida (INH) em isolados clínicos de Mycobacterium tuberculosis de origem brasileiraAntiparasitários (Resistência)Antiparasitários (Resistência)Mycobacterium Tuberculosis (Resistência)Mycobacterium Tuberculosis (Resistência)Quimioterápicos (Resistência)Quimioterápicos (Resistência)Técnicas Histológicas (Uso)Técnicas Histológicas (Uso)No presente estudo realizou-se a triagem para detecção de mutações nos genes katG, kasA, inhA, e região intergênica oxyR-ahpC pela PCR-SSCP e a confirmação por seqüenciamento semi-automático, em 97 isolados resistentes e 60 sensíveis a INH, de M. tuberculosis de origem brasileira. Foi também, investigado a freqüência destas mutações. A determinação da concentração inibitória mínima (CIM) para os isolados resistentes foi realizada pela técnica de Alamar Blue (MABA). A caracterização molecular dos isolados sensíveis e resistentes a INH, foi feita por \"Spoligotyping\" da região hipervariável locus DR. Foi obtido 40 diferentes padrões de \"Spoligotyping\" para os 97 isolados clínicos resistentes e um total de 30 para os 60 isolados sensíveis de M. tuberculosis. Nenhum isolado estudado apresentou o gene katG deletado na integra. No entanto, encontrou-se um isolado com deleção na região 3\' neste gene e uma alta porcentagem de mutação (85,6%); principalmente no codon 315 (61,9%). Foram detectadas 25 novas mutações ainda não descritas na literatura entre os isolados resistentes, no gene KatG, assim como 25,8% dos isolados resistentes apresentaram mutação na região promotora e 5,82% na região estrutural do gene inhA e 10,3% na região intergênica oxyR-ahpC sendo uma mutação (-48) ainda não descrita na literatura. No gene kasA, foram observadas mutações tanto em isolados sensíveis como em resistentes a INH. A mutação mais frequente observada nesse gene foi no codon 269 que causou a alteração G269S (23,7%). Algumas mutações silenciosas, em menor porcentagem, foram detectadas somente nos isolados sensíveis. A técnica de PCR-SSCP demonstrou boa sensibilidade, detectando 90, 7% das mutações analisando 5 regiões gênicas (região adjacente ao codon 315 do gene katG, região promotora e estrutural do gene inhA e região intergênica oxyR-ahpC). Concordância de 100% foi verificado entre as técnicas de PCR-SSCP e de seqüenciamento. Portanto pode-se concluir que a triagem por PCR-SSCP pode ser utilizada com segurança para essa finalidade.No presente estudo realizou-se a triagem para detecção de mutações nos genes katG, kasA, inhA, e região intergênica oxyR-ahpC pela PCR-SSCP e a confirmação por seqüenciamento semi-automático, em 97 isolados resistentes e 60 sensíveis a INH, de M. tuberculosis de origem brasileira. Foi também, investigado a freqüência destas mutações. A determinação da concentração inibitória mínima (CIM) para os isolados resistentes foi realizada pela técnica de Alamar Blue (MABA). A caracterização molecular dos isolados sensíveis e resistentes a INH, foi feita por \"Spoligotyping\" da região hipervariável locus DR. Foi obtido 40 diferentes padrões de \"Spoligotyping\" para os 97 isolados clínicos resistentes e um total de 30 para os 60 isolados sensíveis de M. tuberculosis. Nenhum isolado estudado apresentou o gene katG deletado na integra. No entanto, encontrou-se um isolado com deleção na região 3\' neste gene e uma alta porcentagem de mutação (85,6%); principalmente no codon 315 (61,9%). Foram detectadas 25 novas mutações ainda não descritas na literatura entre os isolados resistentes, no gene KatG, assim como 25,8% dos isolados resistentes apresentaram mutação na região promotora e 5,82% na região estrutural do gene inhA e 10,3% na região intergênica oxyR-ahpC sendo uma mutação (-48) ainda não descrita na literatura. No gene kasA, foram observadas mutações tanto em isolados sensíveis como em resistentes a INH. A mutação mais frequente observada nesse gene foi no codon 269 que causou a alteração G269S (23,7%). Algumas mutações silenciosas, em menor porcentagem, foram detectadas somente nos isolados sensíveis. A técnica de PCR-SSCP demonstrou boa sensibilidade, detectando 90, 7% das mutações analisando 5 regiões gênicas (região adjacente ao codon 315 do gene katG, região promotora e estrutural do gene inhA e região intergênica oxyR-ahpC). Concordância de 100% foi verificado entre as técnicas de PCR-SSCP e de seqüenciamento. Portanto pode-se concluir que a triagem por PCR-SSCP pode ser utilizada com segurança para essa finalidade.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPHirata, Mario HiroyukiCardoso, Rosilene Fressatti2003-02-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-22022022-113227/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2022-02-22T15:54:03Zoai:teses.usp.br:tde-22022022-113227Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212022-02-22T15:54:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira Análise de mutações nos genes relacionados com resistências a isoniazida (INH) em isolados clínicos de Mycobacterium tuberculosis de origem brasileira |
title |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira |
spellingShingle |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira Cardoso, Rosilene Fressatti Antiparasitários (Resistência) Antiparasitários (Resistência) Mycobacterium Tuberculosis (Resistência) Mycobacterium Tuberculosis (Resistência) Quimioterápicos (Resistência) Quimioterápicos (Resistência) Técnicas Histológicas (Uso) Técnicas Histológicas (Uso) |
title_short |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira |
title_full |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira |
title_fullStr |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira |
title_full_unstemmed |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira |
title_sort |
Análise de mutações nos genes relacionados com resistência a isoniazida (INH) em isolados clínicos de \'Mycobacterium tuberculosis\' de origem brasileira |
author |
Cardoso, Rosilene Fressatti |
author_facet |
Cardoso, Rosilene Fressatti |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Hirata, Mario Hiroyuki |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Cardoso, Rosilene Fressatti |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Antiparasitários (Resistência) Antiparasitários (Resistência) Mycobacterium Tuberculosis (Resistência) Mycobacterium Tuberculosis (Resistência) Quimioterápicos (Resistência) Quimioterápicos (Resistência) Técnicas Histológicas (Uso) Técnicas Histológicas (Uso) |
topic |
Antiparasitários (Resistência) Antiparasitários (Resistência) Mycobacterium Tuberculosis (Resistência) Mycobacterium Tuberculosis (Resistência) Quimioterápicos (Resistência) Quimioterápicos (Resistência) Técnicas Histológicas (Uso) Técnicas Histológicas (Uso) |
description |
No presente estudo realizou-se a triagem para detecção de mutações nos genes katG, kasA, inhA, e região intergênica oxyR-ahpC pela PCR-SSCP e a confirmação por seqüenciamento semi-automático, em 97 isolados resistentes e 60 sensíveis a INH, de M. tuberculosis de origem brasileira. Foi também, investigado a freqüência destas mutações. A determinação da concentração inibitória mínima (CIM) para os isolados resistentes foi realizada pela técnica de Alamar Blue (MABA). A caracterização molecular dos isolados sensíveis e resistentes a INH, foi feita por \"Spoligotyping\" da região hipervariável locus DR. Foi obtido 40 diferentes padrões de \"Spoligotyping\" para os 97 isolados clínicos resistentes e um total de 30 para os 60 isolados sensíveis de M. tuberculosis. Nenhum isolado estudado apresentou o gene katG deletado na integra. No entanto, encontrou-se um isolado com deleção na região 3\' neste gene e uma alta porcentagem de mutação (85,6%); principalmente no codon 315 (61,9%). Foram detectadas 25 novas mutações ainda não descritas na literatura entre os isolados resistentes, no gene KatG, assim como 25,8% dos isolados resistentes apresentaram mutação na região promotora e 5,82% na região estrutural do gene inhA e 10,3% na região intergênica oxyR-ahpC sendo uma mutação (-48) ainda não descrita na literatura. No gene kasA, foram observadas mutações tanto em isolados sensíveis como em resistentes a INH. A mutação mais frequente observada nesse gene foi no codon 269 que causou a alteração G269S (23,7%). Algumas mutações silenciosas, em menor porcentagem, foram detectadas somente nos isolados sensíveis. A técnica de PCR-SSCP demonstrou boa sensibilidade, detectando 90, 7% das mutações analisando 5 regiões gênicas (região adjacente ao codon 315 do gene katG, região promotora e estrutural do gene inhA e região intergênica oxyR-ahpC). Concordância de 100% foi verificado entre as técnicas de PCR-SSCP e de seqüenciamento. Portanto pode-se concluir que a triagem por PCR-SSCP pode ser utilizada com segurança para essa finalidade. |
publishDate |
2003 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2003-02-20 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-22022022-113227/ |
url |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-22022022-113227/ |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
|
dc.rights.driver.fl_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Liberar o conteúdo para acesso público. |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.coverage.none.fl_str_mv |
|
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
publisher.none.fl_str_mv |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
instacron_str |
USP |
institution |
USP |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP) |
repository.mail.fl_str_mv |
virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br |
_version_ |
1815257261887455232 |