Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Moraes, Flávia Masson de
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-06012017-112032/
Resumo: Os vírus dengue (DENV) são os principais arbovírus (vírus transmitidos por artrópodes) circulantes no Brasil e são transmitidos por mosquitos do gênero Aedes, causando a doença denominada dengue. Atualmente, a dengue é a arbovirose humana de maior significância em saúde pública, existindo quatro diferentes sorotipos: DENV- 1 a 4. Embora grande parte das infecções por dengue seja assintomática ou resultem em sintomas mais brandos, o número de pacientes com complicações ou com uma forma mais grave da doença tem aumentado significativamente a cada ano. Sabe-se que a presença de mutações no gene que codifica a endoprotease furina, produzida em uma grande diversidade de células humanas e essencial no processo de maturação dos vírus dengue nas células infectadas, levam à perda da atividade catalítica dessa proteína e, consequentemente, à deficiência na maturação viral. Esse trabalho teve como objetivo analisar a presença de mutações no domínio homo B da furina e verificar se a gravidade da doença está ou não relacionada a elas. Para isso, 245 amostras de DNA, incluindo amostras de pacientes com dengue, dengue grave e controles, foram submetidas à reação de PCR em Tempo Real, análise por High Resolution Melting (HRM) e aquelas que apresentaram mutação, segundo esse método, foram sequenciadas. Os resultados mostraram que todas as amostras classificadas, por HRM, como diferentes variantes não apresentavam qualquer mutação por sequenciamento, o que pode ser devido à qualidade das amostras e à concentração de sal, já que esses são fatores determinantes para a eficiência do HRM. Como as amostras dos grupos dengue e dengue grave também foram sequenciadas e verificou-se que também não há mutações nas sequências dessas amostras, concluímos que a gravidade da dengue não está relacionada com a presença de mutações no domínio homo B da endoprotease furina.
id USP_ca73df0b1016b3b39eb66ef5c9bc0ab0
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-06012017-112032
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furinaAnalysis of the presence of mutations in homo B nucleotide sequence of endoprotease furin geneDengueDengueFurinFurinaHRMHRMMutaçãoMutationOs vírus dengue (DENV) são os principais arbovírus (vírus transmitidos por artrópodes) circulantes no Brasil e são transmitidos por mosquitos do gênero Aedes, causando a doença denominada dengue. Atualmente, a dengue é a arbovirose humana de maior significância em saúde pública, existindo quatro diferentes sorotipos: DENV- 1 a 4. Embora grande parte das infecções por dengue seja assintomática ou resultem em sintomas mais brandos, o número de pacientes com complicações ou com uma forma mais grave da doença tem aumentado significativamente a cada ano. Sabe-se que a presença de mutações no gene que codifica a endoprotease furina, produzida em uma grande diversidade de células humanas e essencial no processo de maturação dos vírus dengue nas células infectadas, levam à perda da atividade catalítica dessa proteína e, consequentemente, à deficiência na maturação viral. Esse trabalho teve como objetivo analisar a presença de mutações no domínio homo B da furina e verificar se a gravidade da doença está ou não relacionada a elas. Para isso, 245 amostras de DNA, incluindo amostras de pacientes com dengue, dengue grave e controles, foram submetidas à reação de PCR em Tempo Real, análise por High Resolution Melting (HRM) e aquelas que apresentaram mutação, segundo esse método, foram sequenciadas. Os resultados mostraram que todas as amostras classificadas, por HRM, como diferentes variantes não apresentavam qualquer mutação por sequenciamento, o que pode ser devido à qualidade das amostras e à concentração de sal, já que esses são fatores determinantes para a eficiência do HRM. Como as amostras dos grupos dengue e dengue grave também foram sequenciadas e verificou-se que também não há mutações nas sequências dessas amostras, concluímos que a gravidade da dengue não está relacionada com a presença de mutações no domínio homo B da endoprotease furina.Dengue viruses (DENV) are the main arboviruses (virus transmitted by arthropods) that circulate in Brazil and are transmitted by Aedes mosquitoes, causing dengue disease. Nowadays, dengue is the most important arbovirosis that affects humans and it is an important disease to public health. There are four dengue serotypes (DENV- 1 a 4) and, although the majority of dengue infections remain asymptomatic or cause milder symptoms, the number of patients with complications has increased year by year. It is known that the presence of mutations in furin gene, which is an important endoprotease produced in a high diversity of human\'s cells and is essential for dengue virus maturation, cause the loss of its catalytic activity and, consequently, leads to virus maturation deficiency. This work aimed the analysis of the presence of mutations in furin homo B domain and the verification if dengue severity is related or not with them. Thus, 245 DNA samples, including patient\'s samples with dengue, severe dengue and control group, were amplified by Real Time PCR, analyzed by High Resolution Melting (HRM) and those with any mutation, using this method, were sequenced. The results have showed that all samples classified as different variants by HRM did not presented any mutation by sequencing, what might be due to samples quality and salt concentration, since these are determinant factors for HRM efficiency. Dengue and severe dengue samples were sequenced as well and no mutations were found. In conclusion, dengue severity is not related to the presence of mutations in homo B domain.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPFonseca, Benedito Antonio Lopes daMoraes, Flávia Masson de2016-07-21info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-06012017-112032/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2021-04-08T21:15:02Zoai:teses.usp.br:tde-06012017-112032Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212021-04-08T21:15:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
Analysis of the presence of mutations in homo B nucleotide sequence of endoprotease furin gene
title Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
spellingShingle Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
Moraes, Flávia Masson de
Dengue
Dengue
Furin
Furina
HRM
HRM
Mutação
Mutation
title_short Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
title_full Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
title_fullStr Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
title_full_unstemmed Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
title_sort Análise da presença de mutações na sequência de nucleotídeos do domínio homo B do gene da endoprotease furina
author Moraes, Flávia Masson de
author_facet Moraes, Flávia Masson de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Fonseca, Benedito Antonio Lopes da
dc.contributor.author.fl_str_mv Moraes, Flávia Masson de
dc.subject.por.fl_str_mv Dengue
Dengue
Furin
Furina
HRM
HRM
Mutação
Mutation
topic Dengue
Dengue
Furin
Furina
HRM
HRM
Mutação
Mutation
description Os vírus dengue (DENV) são os principais arbovírus (vírus transmitidos por artrópodes) circulantes no Brasil e são transmitidos por mosquitos do gênero Aedes, causando a doença denominada dengue. Atualmente, a dengue é a arbovirose humana de maior significância em saúde pública, existindo quatro diferentes sorotipos: DENV- 1 a 4. Embora grande parte das infecções por dengue seja assintomática ou resultem em sintomas mais brandos, o número de pacientes com complicações ou com uma forma mais grave da doença tem aumentado significativamente a cada ano. Sabe-se que a presença de mutações no gene que codifica a endoprotease furina, produzida em uma grande diversidade de células humanas e essencial no processo de maturação dos vírus dengue nas células infectadas, levam à perda da atividade catalítica dessa proteína e, consequentemente, à deficiência na maturação viral. Esse trabalho teve como objetivo analisar a presença de mutações no domínio homo B da furina e verificar se a gravidade da doença está ou não relacionada a elas. Para isso, 245 amostras de DNA, incluindo amostras de pacientes com dengue, dengue grave e controles, foram submetidas à reação de PCR em Tempo Real, análise por High Resolution Melting (HRM) e aquelas que apresentaram mutação, segundo esse método, foram sequenciadas. Os resultados mostraram que todas as amostras classificadas, por HRM, como diferentes variantes não apresentavam qualquer mutação por sequenciamento, o que pode ser devido à qualidade das amostras e à concentração de sal, já que esses são fatores determinantes para a eficiência do HRM. Como as amostras dos grupos dengue e dengue grave também foram sequenciadas e verificou-se que também não há mutações nas sequências dessas amostras, concluímos que a gravidade da dengue não está relacionada com a presença de mutações no domínio homo B da endoprotease furina.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016-07-21
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-06012017-112032/
url http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-06012017-112032/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1809090431551537152