Investigação do padrão de metilação em genes ou regiões candidatas à fissura labial com ou sem palato não-sindrômica (FL/P NS)

• Autor(a) principal: Silva, Camila Bassi Fernandes da
• Data de Publicação: 2020
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-22062020-092347/
• topic: CpG; CpG,TP63; DCHS2; DCHS2; Epigenética; Epigenetics; Fissura labial com ou sem fissura do palato não-sindrômica; FL/P NS; Methylation; Metilação; Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate; NSCL/P; ROR2; ROR2; TP63

As fissuras labiopalatinas não sindrômicas (FL/P NS) são malformações congênitas que afetam o lábio e/ou o palato. O padrão de herança sugerido para as FL/P NS é o de herança multifatorial. Um dos modelos genéticos mais testados é aquele em que os pacientes apresentam um acúmulo de variantes de baixo risco e frequentes na população. Entretanto, apenas essas variantes não explicam a alta herdabilidade da doença. Foi sugerido, então, que variantes raras de efeito médio e grande estejam atuando na predisposição à FL/P NS, entretanto, a identificação dessas variantes representam um grande desafio. Uma vez que apenas a contribuição genética não explica o fenótipo, tem-se sugerido que a alteração do padrão epigenético possa estar influenciando no quadro clínico dos pacientes. Alguns trabalhos observaram que há alteração de metilação no promotor de genes candidatos em pacientes com FL/P NS, dentre eles, o gene CDH1. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho foi verificar se os genes selecionados como possíveis causas para FL/P NS têm maior probabilidade de terem alteração no padrão de metilação nos afetados de famílias multiplex do que em não-afetados, o que poderia adicionar evidências de que os genes estejam contribuindo para o fenótipo. Foram estudados o padrão de metilação da região promotora (região global e por sítio) de 16 novos genes candidatos e de 4 genes já associados às FL/Ps (ARHGAP29, SHH, TP63 e ROR2) em uma casuística brasileira de 28 afetados e 71 controles. Foi observada hipermetilação no gene TP63 (p-valor=0.025 na análise por região) e hipometilação em ROR2 (p-valores=0.045, 0.008, 0.043 e 0,0015 em 4 sítios dentro da região CpG). Ambos os genes estão envolvidos na sinalização da via Wnt que, quando desregulada, pode ser um fator de risco para FL/P. Também foi encontrada no presente trabalho uma nova região de risco candidata para FL/P NS, baseado em estudo de ligação, genômica e análise epigenética. DCHS2, o melhor candidato dessa região, tem participação na via PCP, o que torna essa região ainda mais promissora. Tais resultados sugerem que a alteração do padrão epigenético nesses genes pode estar influenciando no quadro clínico nas FL/Ps; porém esse estudo não contribuiu para uma melhor classificação da maioria dos novos genes candidatos, o que pode ter sido por limitações do tamanho amostral e metodologia