Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Carvalho, Felipe Santos de
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-11042022-111537/
Resumo: Rickettsioses são zoonoses transmitidas por artrópodos, especialmente carrapatos, de distribuição ubíqua, sendo cada rickettsiose caracterizada por aspectos clínicos-epidemiológicos associados à espécie envolvida e a ecologia de seus vetores. A Febre Maculosa Brasileira (FMB), principal rickettsiose no País, causada por Rickettsia rickettsii é considerada uma doença emergente e reemergente, que possui alta letalidade, apesar de ter boa resposta a antibioticoterapia de baixo custo. Estabelecer o diagnóstico precocemente é um desafio, pois não estão disponíveis testes diagnósticos rápidos e de alta acurácia. O presente estudo pesquisou DNA rickettsial por PCR, em pacientes e carrapatos na região de Ribeirão Preto/SP. Ao todo, foram analisadas 482 amostras, sendo 90 obtidas de 35 pacientes participantes; 255 amostras de banco de soro pacientes com síndrome febril aguda; 89 amostras de carrapatos representando 1633 animais, dos quais 978 coletados para o estudo (ninfas e larvas distribuídas em pools e adultos analisados individualmente), 654 de 19 pools previamente armazenados e um espécime encontrado em um paciente; e ainda 48 amostras de soro estocados de vertebrados. Em todas as amostras, foram usadas PCR\'s convencional em tempo real para o gene gltA. Os casos positivos foram avaliados por PCR\'s convencionais para fragmento maior de gltA, ompB e por heminested para ompA. 4,1% das amostras foram positivas na PCR em tempo real, sendo duas amostras de pacientes participantes, duas de soroteca e 16 amostras de carrapatos capturados. Nenhuma amostra foi positiva com as técnicas convencionais para gltA e ompB. Uma amostra teve amplificação gênica no protocolo hemi-nested para ompA. O presente estudo confirmou a presença de rickettsia na região de Ribeirão Preto/SP por PCR. Técnicas moleculares podem ser úteis no diagnóstico e compreensão epidemiológica das rickettsioses.
id USP_d68dc1b9f07ee49961232d0b56a15fef
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-11042022-111537
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCRSurvey for Rickettsia sp. in ticks and patients attended in the region of Ribeirao Preto, using PCRDiagnosisDiagnósticoFebre maculosaPCRPCRRickettsiaRickettsiaSpotted feverRickettsioses são zoonoses transmitidas por artrópodos, especialmente carrapatos, de distribuição ubíqua, sendo cada rickettsiose caracterizada por aspectos clínicos-epidemiológicos associados à espécie envolvida e a ecologia de seus vetores. A Febre Maculosa Brasileira (FMB), principal rickettsiose no País, causada por Rickettsia rickettsii é considerada uma doença emergente e reemergente, que possui alta letalidade, apesar de ter boa resposta a antibioticoterapia de baixo custo. Estabelecer o diagnóstico precocemente é um desafio, pois não estão disponíveis testes diagnósticos rápidos e de alta acurácia. O presente estudo pesquisou DNA rickettsial por PCR, em pacientes e carrapatos na região de Ribeirão Preto/SP. Ao todo, foram analisadas 482 amostras, sendo 90 obtidas de 35 pacientes participantes; 255 amostras de banco de soro pacientes com síndrome febril aguda; 89 amostras de carrapatos representando 1633 animais, dos quais 978 coletados para o estudo (ninfas e larvas distribuídas em pools e adultos analisados individualmente), 654 de 19 pools previamente armazenados e um espécime encontrado em um paciente; e ainda 48 amostras de soro estocados de vertebrados. Em todas as amostras, foram usadas PCR\'s convencional em tempo real para o gene gltA. Os casos positivos foram avaliados por PCR\'s convencionais para fragmento maior de gltA, ompB e por heminested para ompA. 4,1% das amostras foram positivas na PCR em tempo real, sendo duas amostras de pacientes participantes, duas de soroteca e 16 amostras de carrapatos capturados. Nenhuma amostra foi positiva com as técnicas convencionais para gltA e ompB. Uma amostra teve amplificação gênica no protocolo hemi-nested para ompA. O presente estudo confirmou a presença de rickettsia na região de Ribeirão Preto/SP por PCR. Técnicas moleculares podem ser úteis no diagnóstico e compreensão epidemiológica das rickettsioses.Rickettsial diseases are zoonosis transmitted by arthropods, especially ticks. They have a ubiquitous distribution and each rickettsiosis has a characteristic clinical and epidemiological pattern associated with its own rickettsial species and the ecology of its specific vectors. Brazilian Spotted Fever (BSF), caused by Rickettsia rickettsii is the most important rickettsiosis in the country and is thought to be an emerging and reemerging disease. It is an acute febrile illness with high death rate, although it has a good response to low-cost antimicrobial therapy. One of the difficulties involving BSF is the lack of rapid diagnostic tests. A major challenge to physicians is to establish diagnosis as early as possible, allowing therapy to be started sooner, but fast and high accurate tests are not available. This study searched for rickettsial DNA using PCR in patients and ticks in the Ribeirão Preto region, state of São Paulo. 482 samples were analyzed: 90 samples from 35 patients enrolled in the study; 255 from sera bank of acute febrile patients; and 89 tick samples representing 1633 animals, of which 978 were collected for this study (nymphs and larvae in pools and adults individually), 654 from 19 pools previously stocked and one tick found feeding on a patient; and 48 serum samples previously obtained from wild vertebrate animals. Conventional and real time PCR targeting a gltA gene were performed in all samples. Positive cases were additionally analyzed by conventional PCRs for a long fragment of gltA, ompB and a hemi-nested protocol for ompA. 4.1% samples were positive by the real time PCR, two samples from enrolled patients, other two from sera bank and 16 samples from collected ticks. None of the samples were positive with conventional PCR for gltA or ompB genes. One sample were also positive with the hemi-nested PCR for ompA. This study has confirmed rickettsia in Ribeirão Preto region. Molecular methods can be useful for clinical diagnosis and epidemiological studies of rickettsiosis.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPFigueiredo, Luiz Tadeu MoraesCarvalho, Felipe Santos de2021-12-09info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-11042022-111537/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2022-04-13T19:45:03Zoai:teses.usp.br:tde-11042022-111537Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212022-04-13T19:45:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
Survey for Rickettsia sp. in ticks and patients attended in the region of Ribeirao Preto, using PCR
title Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
spellingShingle Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
Carvalho, Felipe Santos de
Diagnosis
Diagnóstico
Febre maculosa
PCR
PCR
Rickettsia
Rickettsia
Spotted fever
title_short Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
title_full Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
title_fullStr Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
title_full_unstemmed Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
title_sort Pesquisa de Rickettsia sp. em carrapatos e pacientes atendidos na região Ribeirão Preto, utilizando a PCR
author Carvalho, Felipe Santos de
author_facet Carvalho, Felipe Santos de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Figueiredo, Luiz Tadeu Moraes
dc.contributor.author.fl_str_mv Carvalho, Felipe Santos de
dc.subject.por.fl_str_mv Diagnosis
Diagnóstico
Febre maculosa
PCR
PCR
Rickettsia
Rickettsia
Spotted fever
topic Diagnosis
Diagnóstico
Febre maculosa
PCR
PCR
Rickettsia
Rickettsia
Spotted fever
description Rickettsioses são zoonoses transmitidas por artrópodos, especialmente carrapatos, de distribuição ubíqua, sendo cada rickettsiose caracterizada por aspectos clínicos-epidemiológicos associados à espécie envolvida e a ecologia de seus vetores. A Febre Maculosa Brasileira (FMB), principal rickettsiose no País, causada por Rickettsia rickettsii é considerada uma doença emergente e reemergente, que possui alta letalidade, apesar de ter boa resposta a antibioticoterapia de baixo custo. Estabelecer o diagnóstico precocemente é um desafio, pois não estão disponíveis testes diagnósticos rápidos e de alta acurácia. O presente estudo pesquisou DNA rickettsial por PCR, em pacientes e carrapatos na região de Ribeirão Preto/SP. Ao todo, foram analisadas 482 amostras, sendo 90 obtidas de 35 pacientes participantes; 255 amostras de banco de soro pacientes com síndrome febril aguda; 89 amostras de carrapatos representando 1633 animais, dos quais 978 coletados para o estudo (ninfas e larvas distribuídas em pools e adultos analisados individualmente), 654 de 19 pools previamente armazenados e um espécime encontrado em um paciente; e ainda 48 amostras de soro estocados de vertebrados. Em todas as amostras, foram usadas PCR\'s convencional em tempo real para o gene gltA. Os casos positivos foram avaliados por PCR\'s convencionais para fragmento maior de gltA, ompB e por heminested para ompA. 4,1% das amostras foram positivas na PCR em tempo real, sendo duas amostras de pacientes participantes, duas de soroteca e 16 amostras de carrapatos capturados. Nenhuma amostra foi positiva com as técnicas convencionais para gltA e ompB. Uma amostra teve amplificação gênica no protocolo hemi-nested para ompA. O presente estudo confirmou a presença de rickettsia na região de Ribeirão Preto/SP por PCR. Técnicas moleculares podem ser úteis no diagnóstico e compreensão epidemiológica das rickettsioses.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-12-09
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-11042022-111537/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-11042022-111537/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815256859476492288