Sequenciamento completo do exoma para a investigação das bases genéticas de imunodeficiências primárias com suscetibilidade genética a micobacterioses: avaliação de uma família

• Autor(a) principal: Pinichi, Paula
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
• Texto Completo: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5133/tde-14012020-102335/
• topic: Genética; Genetics; Immune system; Immunity; Imunidade; Infecções por micobactéria não tuberculosa; Mycobacterium bovis; Mycobacterium bovis; Non-Tuberculous mycobacterial infections; Sequenciamento completo do exoma; Sistema imunitário; Whole exome sequencing

INTRODUÇÃO: As imunodeficiências primárias compreendem um vasto conjunto de distúrbios da resposta imunológica de origem genética, usualmente monogênica. As primeiras imunodeficiências descritas apresentavam como característica principal a suscetibilidade a uma ampla gama de agentes patogênicos, permitindo a caracterização de distúrbios acometendo a imunidade inata - sistema complemento e fagócitos, e a imunidade adaptativa - linfócitos T e B. O conhecimento dos processos biológicos cresceu significativamente nas últimas décadas, permitindo a detecção de distúrbios da imunidade muito mais sutis que anteriormente, com grupos de distúrbios nos quais existe suscetibilidade a apenas um grupo (ou poucos grupos) de agentes patogênicos, como, por exemplo, as micobactérias, os herpes vírus, os papiloma vírus etc., em decorrência do acometimento de mecanismos específicos da imunidade. Atualmente são conhecidas mais de 300 doenças, com sobreposição de fenótipos clínicos entre distúrbios causados por mecanismos diferentes, muitas vezes permitindo tratamentos diversos que devem ser indicados especificamente para determinados distúrbios genéticos. Somente no contexto de suscetibilidade mendeliana a doenças micobacterianas temos mais de uma dúzia de genes com diferentes alterações (perda total e parcial de função, ou ganho de função) gerando mais de 20 fenótipos clínicos diversos. O sequenciamento em de grande número de indivíduos permitiu conhecer esses distúrbios, processo que se acelerou significativamente com o sequenciamento múltiplo paralelo (de nova geração). MÉTODOS: Os pacientes foram selecionados do ambulatório ADEE-3003 no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, cujo quadro clínico foi caracterizado por infecções graves associadas às micobactérias, em destaque a BCG. Para este estudo foi escolhida uma família com caso emblemático e com histórico familiar, com chance razoável de identificação de genes alterados associados ao quadro clínico apresentado pelos pacientes. Através do sequenciamento do exoma completo destes pacientes buscamos genes associados a sua condição clinica e em consequência o tratamento apropriado a sua condição. RESULTADO: A família estudada era composta pelos pais e criança (propósito), dos quais foram sequenciados seus exomas completos e analisados comparativamente em busca da transmissão de genes envolvidos na evolução do quadro clínico associado à BCG (IL12R Beta1), levando em consideração o histórico familiar de doença na família, além da busca de outros genes que pudessem ser associados às micobacterioses de repetição. CONCLUSÃO: Foi encontrada no propósito da família genes que explicaram sua condição clinica e sua susceptibilidade a micobactérias, contudo o nível de cobertura dos éxons nos sequenciamentos não foi suficientemente eficiente em relação à caracterização dos familiares, nos limitando a caracterização das variantes encontradas, necessitando de um novo sequenciamento com cobertura mais elevada destas regiões codificadoras