Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Beatriz Queiroz dos
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10133/tde-27072023-162152/
Resumo: O Brasil tem se destacado no cenário da avicultura mundial, mas no momento atual, existem alguns desafios em relação ao controle de doenças bacterianas, incluindo a colibacilose aviária. A colibacilose provoca redução de lucros por diminuição na produção, aumento de condenações, mortalidade e gastos terapêuticos. A virulência de Escherichia coli patogênica aviária (APEC) ainda não foi completamente elucidada e existem muitas lacunas sobre o tema no Brasil. Esse estudo teve como objetivo caracterizar E. coli patogênica para aves isoladas em quadros clínicos, por meio de análise molecular para fatores de virulência, classificação filogenética, sorotipagem molecular para os sorogrupos O1, O53 e O78, sorotipagem por soroaglutinação rápida para O2 e determinação da frequência de ST-23, ST-73, ST-95, ST-117, ST-131 e ST-355; além de avaliar o perfil de resistência a antimicrobianos. Um total de 80 isolados foi analisado e 79% (n=63/80) foram classificados como APEC. A maioria das estirpes pertence aos filogrupos G (17,46%; n=11/63) e B2 (11,11%; n=7/63). Dentre os STs pesquisados, no Paraná foram identificados ST-23, 11,11% (n=7/63), ST-95, 7,93% (n=5/63) e ST-117, 9,52% (n=6/63). No Rio Grande do Sul ST-73 e ST-131, com 1,59% (n=1/63) em ambos. O principal sorogrupo identificado foi o O2, 11,11% (n =7/63), seguido de O78, 4,76% (n=6/63). A multirresistência alcançou 55,55% (n=35/63), e os maiores índices de resistência observados foram para Amoxacilina, 71,43% (n=45/63), e Tetraciclina, 52,38% (n=33/63).
id USP_de0c11330e75fcdd5a8d64ec96121cf7
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-27072023-162152
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulênciaCharacterization of main serogroups and virulence profile of avian pathogenic Escherichia coliAPECAPECColibacillosisColibaciloseFilogrupoPhylogroupSerogroupSorogrupoSTsSTsO Brasil tem se destacado no cenário da avicultura mundial, mas no momento atual, existem alguns desafios em relação ao controle de doenças bacterianas, incluindo a colibacilose aviária. A colibacilose provoca redução de lucros por diminuição na produção, aumento de condenações, mortalidade e gastos terapêuticos. A virulência de Escherichia coli patogênica aviária (APEC) ainda não foi completamente elucidada e existem muitas lacunas sobre o tema no Brasil. Esse estudo teve como objetivo caracterizar E. coli patogênica para aves isoladas em quadros clínicos, por meio de análise molecular para fatores de virulência, classificação filogenética, sorotipagem molecular para os sorogrupos O1, O53 e O78, sorotipagem por soroaglutinação rápida para O2 e determinação da frequência de ST-23, ST-73, ST-95, ST-117, ST-131 e ST-355; além de avaliar o perfil de resistência a antimicrobianos. Um total de 80 isolados foi analisado e 79% (n=63/80) foram classificados como APEC. A maioria das estirpes pertence aos filogrupos G (17,46%; n=11/63) e B2 (11,11%; n=7/63). Dentre os STs pesquisados, no Paraná foram identificados ST-23, 11,11% (n=7/63), ST-95, 7,93% (n=5/63) e ST-117, 9,52% (n=6/63). No Rio Grande do Sul ST-73 e ST-131, com 1,59% (n=1/63) em ambos. O principal sorogrupo identificado foi o O2, 11,11% (n =7/63), seguido de O78, 4,76% (n=6/63). A multirresistência alcançou 55,55% (n=35/63), e os maiores índices de resistência observados foram para Amoxacilina, 71,43% (n=45/63), e Tetraciclina, 52,38% (n=33/63).Brazil has excelled in the world poultry scenario, but at the present time, there are some challenges in the relation to control of bacterial diseases, including avian colibacillosis. Colibacillosis causes a reduction in profits due to a decrease in production, an increase in condemnation of carcasses, mortality, and medical care expenses. The virulence of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) has not yet been fully elucidated and there are many gaps on the subject in Brazil. This study aimed to characterize pathogenic E. coli for birds in clinical settings, through molecular analysis for virulence factors, phylogenetic classification, molecular serotyping for serogroups O1, O58 and O78, serotyping by rapid seroagglutination for O2 and inheritance of frequency of ST-23, ST-73, ST-95, ST-117, ST-131 and ST-355; in addition to evaluating the antimicrobial resistance profile. A total of 80 isolates were analyzed and 79% (n=63/80) were classified as APEC. Most strains belong to phylogroups G (17,46%; n=11/63) and B2 (11,11%; n=7/63). Among the researched STs, in Paraná, ST-23, 11,11% (n=7/63), ST-95, 7,93% (n=5/63), and ST-117, 9,52% (n=6/63). In Rio Grande do Sul, ST-73 and ST-131, with 1,59% (n=1/63) in both. The main serogroup identified was O2, 11,11% (n=7/63), followed by O78, 4,76% (n=6/63). Multidrug resistance reached 55,55% (n=35/63), and two main antibiotics with resistance in the isolates were Amoxicilin, 71,43% (n=45/63) and Tetracycline, 52,38% (n=33/63).Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPKnöbl, TerezinhaSantos, Beatriz Queiroz dos2023-04-20info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10133/tde-27072023-162152/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2023-12-12T15:40:02Zoai:teses.usp.br:tde-27072023-162152Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212023-12-12T15:40:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
Characterization of main serogroups and virulence profile of avian pathogenic Escherichia coli
title Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
spellingShingle Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
Santos, Beatriz Queiroz dos
APEC
APEC
Colibacillosis
Colibacilose
Filogrupo
Phylogroup
Serogroup
Sorogrupo
STs
STs
title_short Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
title_full Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
title_fullStr Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
title_full_unstemmed Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
title_sort Caracterização de sorogrupos predominantes em Escherichia coli patogênica para aves e perfil de virulência
author Santos, Beatriz Queiroz dos
author_facet Santos, Beatriz Queiroz dos
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Knöbl, Terezinha
dc.contributor.author.fl_str_mv Santos, Beatriz Queiroz dos
dc.subject.por.fl_str_mv APEC
APEC
Colibacillosis
Colibacilose
Filogrupo
Phylogroup
Serogroup
Sorogrupo
STs
STs
topic APEC
APEC
Colibacillosis
Colibacilose
Filogrupo
Phylogroup
Serogroup
Sorogrupo
STs
STs
description O Brasil tem se destacado no cenário da avicultura mundial, mas no momento atual, existem alguns desafios em relação ao controle de doenças bacterianas, incluindo a colibacilose aviária. A colibacilose provoca redução de lucros por diminuição na produção, aumento de condenações, mortalidade e gastos terapêuticos. A virulência de Escherichia coli patogênica aviária (APEC) ainda não foi completamente elucidada e existem muitas lacunas sobre o tema no Brasil. Esse estudo teve como objetivo caracterizar E. coli patogênica para aves isoladas em quadros clínicos, por meio de análise molecular para fatores de virulência, classificação filogenética, sorotipagem molecular para os sorogrupos O1, O53 e O78, sorotipagem por soroaglutinação rápida para O2 e determinação da frequência de ST-23, ST-73, ST-95, ST-117, ST-131 e ST-355; além de avaliar o perfil de resistência a antimicrobianos. Um total de 80 isolados foi analisado e 79% (n=63/80) foram classificados como APEC. A maioria das estirpes pertence aos filogrupos G (17,46%; n=11/63) e B2 (11,11%; n=7/63). Dentre os STs pesquisados, no Paraná foram identificados ST-23, 11,11% (n=7/63), ST-95, 7,93% (n=5/63) e ST-117, 9,52% (n=6/63). No Rio Grande do Sul ST-73 e ST-131, com 1,59% (n=1/63) em ambos. O principal sorogrupo identificado foi o O2, 11,11% (n =7/63), seguido de O78, 4,76% (n=6/63). A multirresistência alcançou 55,55% (n=35/63), e os maiores índices de resistência observados foram para Amoxacilina, 71,43% (n=45/63), e Tetraciclina, 52,38% (n=33/63).
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-04-20
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10133/tde-27072023-162152/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10133/tde-27072023-162152/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815257415374864384