A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Taschner, Natalia Pasternak
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Texto Completo: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-03122021-150906/
Resumo: O fator &#963S associado à RNA polimerase de E. coli (E&#963S) é responsável pela transcrição da maioria dos genes relacionados à sobrevivência durante a fase estacionária e em períodos de estresse. Quando a célula entra em carência de fosfato inorgânico, um conjunto de genes e operons conhecidos como o regulon PHO é ativado. Os genes do regulon PHO são transcritos preferencialmente pela RNA polimerase associada ao fator &#963D. A inativação do gene rpoS, que codifica para o fator &#963S, causou um aumento significativo na expressão da maioria dos genes de PHO. O efeito repressor de &#963S foi atribuído à competição entre este fator sigma e o fator &#963D pelo cerne da RNA polimerase. Diferentemente dos demais genes de PHO, a expressão de pstS, o primeiro gene do operon pst, foi moderadamente estimulada na presença do fator &#963S. A região promotora de pstS contém uma citosina na posição -13 e um sítio de ligação para a proteína IHF. Estes elementos, encontrados em genes dependentes do fator &#963S, podem estar contribuindo para a transcrição de pstS pela holoenzima E&#963S. Um estudo do polimorfismo do gene rpoS em diversas cepas de E. coli K-12 detectou a presença de uma mutação âmbar no códon 33 deste gene. Bactérias supressoras da mutação âmbar produzem uma proteína de tamanho normal (38 KDa), ao passo que bactérias não-supressoras produzem um fator &#963S truncado, que apesar de possuir 55 aminoácidos a menos, foi capaz de transcrever seus genes dependentes ainda que com menor eficiência. Cepas que carregam o códon 33 âmbar apresentaram um fenótipo diferenciado em relação à expressão dos genes de PHO.
id USP_e6843752e083fd99a3cb46c076fcea86
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-03122021-150906
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.Alkaline phosphatase regulation by the &#963S factor of RNA polymerase in Escherichia coli.pst operonalkaline phosphatasefator sigmafosfatase alcalinaoperon pstPHO regulonregulon PHORNA polimeraseRNA polymerasesigma factorO fator &#963S associado à RNA polimerase de E. coli (E&#963S) é responsável pela transcrição da maioria dos genes relacionados à sobrevivência durante a fase estacionária e em períodos de estresse. Quando a célula entra em carência de fosfato inorgânico, um conjunto de genes e operons conhecidos como o regulon PHO é ativado. Os genes do regulon PHO são transcritos preferencialmente pela RNA polimerase associada ao fator &#963D. A inativação do gene rpoS, que codifica para o fator &#963S, causou um aumento significativo na expressão da maioria dos genes de PHO. O efeito repressor de &#963S foi atribuído à competição entre este fator sigma e o fator &#963D pelo cerne da RNA polimerase. Diferentemente dos demais genes de PHO, a expressão de pstS, o primeiro gene do operon pst, foi moderadamente estimulada na presença do fator &#963S. A região promotora de pstS contém uma citosina na posição -13 e um sítio de ligação para a proteína IHF. Estes elementos, encontrados em genes dependentes do fator &#963S, podem estar contribuindo para a transcrição de pstS pela holoenzima E&#963S. Um estudo do polimorfismo do gene rpoS em diversas cepas de E. coli K-12 detectou a presença de uma mutação âmbar no códon 33 deste gene. Bactérias supressoras da mutação âmbar produzem uma proteína de tamanho normal (38 KDa), ao passo que bactérias não-supressoras produzem um fator &#963S truncado, que apesar de possuir 55 aminoácidos a menos, foi capaz de transcrever seus genes dependentes ainda que com menor eficiência. Cepas que carregam o códon 33 âmbar apresentaram um fenótipo diferenciado em relação à expressão dos genes de PHO.In E. coli, the RNA polymerase associated with &#963S (E&#963S) is responsible for the transcription of the majority of the genes related to survival during stress periods or during the stationary phase of growth. When cells enter a phase of phosphate starvation, the transcription of several genes and operons, known as the PHO regulon, is activated. Knock-out of rpoS, which encodes &#963S, increases the expression of most PHO genes. The negative effect of &#963S on PHO expression is probably due to the competition between &#963S and &#963D for the core RNA polymerase. Unlike all other PHO genes, pstS, the first gene of the pst operon, was mildly stimulated by &#963S. The promoter region of pstS contains a cytosine residue at position -13, and an IHF binding site. These elements are known to be important for the transcription of &#963S-dependent genes, and may contribute for the transcription of pstS by E&#963S . The polymorphism of rpoS in several E. coli K-12 strains was evaluated. An amber mutation in codon 33 of this gene was found in 2 out of 7 strains. These strains were found to suppress the amber mutation and to produce a normal 38 KDa &#963S protein. Non-suppressor strains carrying this amber mutation produced a &#963S variant, lacking 55 amino acids. The truncated &#963S protein was still able to drive the transcription of its dependent genes, albeit in a smaller proportion. Strains carrying the rpoS amber mutation presented a distinct phenotype regarding the expression of the PHO regulon genes.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPSpira, BenyTaschner, Natalia Pasternak2006-05-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-03122021-150906/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2021-12-06T12:44:02Zoai:teses.usp.br:tde-03122021-150906Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212021-12-06T12:44:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
Alkaline phosphatase regulation by the &#963S factor of RNA polymerase in Escherichia coli.
title A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
spellingShingle A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
Taschner, Natalia Pasternak
pst operon
alkaline phosphatase
fator sigma
fosfatase alcalina
operon pst
PHO regulon
regulon PHO
RNA polimerase
RNA polymerase
sigma factor
title_short A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
title_full A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
title_fullStr A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
title_full_unstemmed A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
title_sort A regulação da fosfatase alcalina pelo fator &#963S da RNA polimerase de Escherichia coli.
author Taschner, Natalia Pasternak
author_facet Taschner, Natalia Pasternak
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Spira, Beny
dc.contributor.author.fl_str_mv Taschner, Natalia Pasternak
dc.subject.por.fl_str_mv pst operon
alkaline phosphatase
fator sigma
fosfatase alcalina
operon pst
PHO regulon
regulon PHO
RNA polimerase
RNA polymerase
sigma factor
topic pst operon
alkaline phosphatase
fator sigma
fosfatase alcalina
operon pst
PHO regulon
regulon PHO
RNA polimerase
RNA polymerase
sigma factor
description O fator &#963S associado à RNA polimerase de E. coli (E&#963S) é responsável pela transcrição da maioria dos genes relacionados à sobrevivência durante a fase estacionária e em períodos de estresse. Quando a célula entra em carência de fosfato inorgânico, um conjunto de genes e operons conhecidos como o regulon PHO é ativado. Os genes do regulon PHO são transcritos preferencialmente pela RNA polimerase associada ao fator &#963D. A inativação do gene rpoS, que codifica para o fator &#963S, causou um aumento significativo na expressão da maioria dos genes de PHO. O efeito repressor de &#963S foi atribuído à competição entre este fator sigma e o fator &#963D pelo cerne da RNA polimerase. Diferentemente dos demais genes de PHO, a expressão de pstS, o primeiro gene do operon pst, foi moderadamente estimulada na presença do fator &#963S. A região promotora de pstS contém uma citosina na posição -13 e um sítio de ligação para a proteína IHF. Estes elementos, encontrados em genes dependentes do fator &#963S, podem estar contribuindo para a transcrição de pstS pela holoenzima E&#963S. Um estudo do polimorfismo do gene rpoS em diversas cepas de E. coli K-12 detectou a presença de uma mutação âmbar no códon 33 deste gene. Bactérias supressoras da mutação âmbar produzem uma proteína de tamanho normal (38 KDa), ao passo que bactérias não-supressoras produzem um fator &#963S truncado, que apesar de possuir 55 aminoácidos a menos, foi capaz de transcrever seus genes dependentes ainda que com menor eficiência. Cepas que carregam o códon 33 âmbar apresentaram um fenótipo diferenciado em relação à expressão dos genes de PHO.
publishDate 2006
dc.date.none.fl_str_mv 2006-05-31
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-03122021-150906/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-03122021-150906/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1815256707756982272