Integração do HCF-web a herbários virtuais brasileiros

• Autor(a) principal: Kajihara, Alexandre Yuji
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
• Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/6018
• topic: CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO; Herbários; JavaScript (Linguagem de programação de computador); Computação de alto desempenho; Herbaria; JavaScript (Computer program language); High performance computing

O Herbário da Universidade Tecnológica Federal do Paraná, do Campus Campo Mourão, também conhecido como HCF, compartilha sua coleção, por meio de seu sistema web (HCFWeb), com o Herbário Virtual Reflora e o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia Herbário Virtual da Flora e dos Fungos (INCT-HVFF). Os dois herbários virtuais aceitam sugestõesdereidentificaçãodeamostra,elaboradasporespecialistas. Noentanto,assugestões não são atualizadas automaticamente, no sistema HCF-Web e, portanto, esses dados são comparados manualmente, com equivalentes, nos herbários virtuais. Como o HCF tem mais de 28 mil exsicatas, a identificação de inconsistências exige muito tempo e é passível de erros. Este trabalho apresenta o desenvolvimento de uma extensão web para o HCF-Web, que compara dados aos seus equivalentes nos herbários virtuais, para que divergências possam ser destacadas. Para implementar essa solução, foi utilizada: (i) a API do Reflora, para atualização imediata ou programada; (ii) e um arquivo CSV, criado pelo sistema speciesLink, do INCT-HVFF. Para testar essa abordagem, nove amostras do HCF, variando de 5 mil a 25 mil espécimes, foram selecionadas, aleatoriamente, para validar as funções. Cada amostra foi testadatrêsvezespara: (i)calcularamédiadotempodeexecução, emminutos; (ii)everificar o número de divergências. Também foi coletado o número de falhas, durante a execução da API do Reflora. Como esperado, o tempo para a identificação da divergência variou linearmente, de acordo com o tamanho das amostras. Em relação ao INCT-HVFF, a conexão com a Internet não é necessária para comparar os dados do HCF com os do speciesLink. Portanto, a identificação de divergências é mais rápida que no processo do Reflora. Por fim, as contribuições desta pesquisa são: (i) uma solução para problemas de inconsistência de dados entre o HCF e os herbários virtuais; (ii) aumento da precisão quanto à identificação de divergências; (iii) aprimoramento do fluxo de trabalho do pessoal do HCF, uma vez que a comparação manual de dados, que normalmente leva semanas para ser executada, pode agora ser feita automaticamente, em menor tempo.