Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) |
Texto Completo: | http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/28999 |
Resumo: | O Refúgio Biológico de Santa Helena (RBSH) é uma Área de Relevante Interesse Biológico (ARIE) que faz parte das unidades de conservação (UC) municipais do estado do Paraná, sendo componente da Área de Preservação Permanente do Lago de Itaipu. Possui uma área total de 1.482,05 ha, estando localizado na Bacia Hidrográfica Paraná III no município de Santa Helena, extremo oeste do estado. A área da UC abrange apenas o ambiente terrestre, segundo o plano de manejo, o ambiente aquático é considerado como Zona de Amortecimento (ZA). Considerando que falta monitoramentos na ZA, a criação de novas áreas de proteção efetiva na parte aquática, mais especificamente no entorno do RBSH, se torna imprescindível. Muitas dessas áreas são utilizadas como local de desova e berçário de diferentes espécies de peixes residentes e migratórias, tornando-se importantes áreas para a ictiofauna. As abordagens conservacionistas envolvendo os estudos dos estágios iniciais da vida dos peixes têm se tornado cada vez mais comuns e importantes para a implantação de medidas de orientação e proteção dessas áreas. Tradicionalmente a identificação de ictioplâncton utiliza taxonomia clássica, entretanto, há uma extrema dificuldade em obter uma identificação precisa, visto a similaridade dos espécimes nessa fase. Com o advento da Biologia Molecular, a utilização de marcadores específicos possibilitou uma maior precisão nessas identificações. Por meio da técnica DNA metabarcoding, foram identificadas quais espécies estão desovando no entorno do RBSH, e através desses dados, espera-se que haja subsídios suficientes para a ampliação da área de preservação do RBSH. As amostragens de ictioplâncton foram realizadas ao longo de um ciclo reprodutivo (2020/2021), distribuídas em dez pontos localizados em regiões estratégicas do RBSH, na área de influência do Lago de Itaipu, pertencente à bacia do Alto rio Paraná. Neste período, foram realizadas sete amostragens por ponto, totalizando 70 amostras. O material coletado foi submetido a um sequenciamento massivo, utilizando a técnica de DNA metabarcoding com dois conjuntos de seis primers. Os 6.068 ovos / larvas coletados resultaram em 1.848 sequências viáveis, possibilitando a identificação de 82 táxons, pertencentes a sete ordens, 26 famílias e oito subfamílias. Este trabalho contribui com o registro de 25 identificações a nível de gênero e 57 a nível de espécie, identificamos também a presença de duas espécies introduzidas do continente africano e cinco espécies e quatro gêneros de peixes migradores de longa distância. |
id |
UTFPR-12_3b7087033b197ae2ef43c5a8127d6f5a |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.utfpr.edu.br:1/28999 |
network_acronym_str |
UTFPR-12 |
network_name_str |
Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) |
repository_id_str |
|
spelling |
2022-07-05T17:14:35Z2022-07-05T17:14:35Z2022-05-30LIRA, Natalia Lima. Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR. 2022. Dissertação (Mestrado em Recursos Naturais e Sustentabilidade) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Santa Helena, 2022.http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/28999O Refúgio Biológico de Santa Helena (RBSH) é uma Área de Relevante Interesse Biológico (ARIE) que faz parte das unidades de conservação (UC) municipais do estado do Paraná, sendo componente da Área de Preservação Permanente do Lago de Itaipu. Possui uma área total de 1.482,05 ha, estando localizado na Bacia Hidrográfica Paraná III no município de Santa Helena, extremo oeste do estado. A área da UC abrange apenas o ambiente terrestre, segundo o plano de manejo, o ambiente aquático é considerado como Zona de Amortecimento (ZA). Considerando que falta monitoramentos na ZA, a criação de novas áreas de proteção efetiva na parte aquática, mais especificamente no entorno do RBSH, se torna imprescindível. Muitas dessas áreas são utilizadas como local de desova e berçário de diferentes espécies de peixes residentes e migratórias, tornando-se importantes áreas para a ictiofauna. As abordagens conservacionistas envolvendo os estudos dos estágios iniciais da vida dos peixes têm se tornado cada vez mais comuns e importantes para a implantação de medidas de orientação e proteção dessas áreas. Tradicionalmente a identificação de ictioplâncton utiliza taxonomia clássica, entretanto, há uma extrema dificuldade em obter uma identificação precisa, visto a similaridade dos espécimes nessa fase. Com o advento da Biologia Molecular, a utilização de marcadores específicos possibilitou uma maior precisão nessas identificações. Por meio da técnica DNA metabarcoding, foram identificadas quais espécies estão desovando no entorno do RBSH, e através desses dados, espera-se que haja subsídios suficientes para a ampliação da área de preservação do RBSH. As amostragens de ictioplâncton foram realizadas ao longo de um ciclo reprodutivo (2020/2021), distribuídas em dez pontos localizados em regiões estratégicas do RBSH, na área de influência do Lago de Itaipu, pertencente à bacia do Alto rio Paraná. Neste período, foram realizadas sete amostragens por ponto, totalizando 70 amostras. O material coletado foi submetido a um sequenciamento massivo, utilizando a técnica de DNA metabarcoding com dois conjuntos de seis primers. Os 6.068 ovos / larvas coletados resultaram em 1.848 sequências viáveis, possibilitando a identificação de 82 táxons, pertencentes a sete ordens, 26 famílias e oito subfamílias. Este trabalho contribui com o registro de 25 identificações a nível de gênero e 57 a nível de espécie, identificamos também a presença de duas espécies introduzidas do continente africano e cinco espécies e quatro gêneros de peixes migradores de longa distância.The Santa Helena Biological Refuge (RBSH) is an Area of Relevant Biological Interest (ARIE) that is part of the municipal conservation units (UC) in the state of Paraná, being a component of the Permanent Preservation Area of Lake Itaipu. It has a total area of 1,482.05 ha, located in the Paraná III Hydrographic Basin in the municipality of Santa Helena, in the extreme west of the state. The UC area covers only the terrestrial environment, the protection of the aquatic environment is only the responsibility of the Buffer Zone area (ZA). Considering that the ZA lacks monitoring, the creation of new restriction areas in the aquatic part around the RBSH becomes essential. Many of these areas are used as a spawning groundf or local and migratory fish species, making them important nursery areas for the ichthyofauna. Conservation approaches involving studies of the early stages of fish life have become increasingly common and important for the implementation of measures to guide and protect these areas. Traditionally, the identification of ichthyoplankton uses classical taxonomy, however, it is extremely difficult to obtain a precise identification, given the imilarity of the specimens at this stage. With the advent of Molecular Biology, the use of specific markers made these identifications more accurate. It is expected that through the DNA metabarcoding technique, it is possible to identify which species are spawning around the RBSH, so that through these data there are subsidies for the expansion of the RBSH preservation area. In this scenario, the ichthyoplankton samples were carried out over a reproductive cycle (2020/2021), distributed in ten essential points in strategic regions of ARIE-SH, in the area of influence of Lake Itaipu, belonging to the Upper Rio basin Paraná. During this period, seven samplings were performed per point, totaling 70 samples. The collected material was subjected to massive sequencing, using the DNA metabarcoding technique with two sets of six primers. The 6,068 eggs / larvae collected resulted in 1,848 viable sequences, allowing the identification of 82 taxa, belonging to seven orders, 26 families and eight subfamilies. This work contributes with the record of 25 identifications at the genus level and 57 at the species level, we also identified the presence of two species introduced from the African continent and five species and four genera of long-distance migratory fish.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)porUniversidade Tecnológica Federal do ParanáSanta HelenaPrograma de Pós-Graduação em Recursos Naturais e SustentabilidadeUTFPRBrasilhttps://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASCiências AmbientaisPeixes - OvosGenética animalDNAFishes - EggsAnimal geneticsComposição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PRComposition of ichthyoplankton by DNA metabarcoding as a tool for evaluating potential conservation areas around the Santa Helena Biological Refuge - Lake Itaipu - PR.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisSanta HelenaBlanco, Daniel Rodrigueshttps://orcid.org/0000-0003-1619-2417http://lattes.cnpq.br/8998670968329882Oliveira, Claudio dehttps://orcid.org/0000-0002-7010-8880http://lattes.cnpq.br/0297419882161114Blanco, Daniel Rodrigueshttps://orcid.org/0000-0003-1619-2417http://lattes.cnpq.br/8998670968329882Almeida, Fernanda Simões dehttps://orcid.org/0000-0002-0130-5047http://lattes.cnpq.br/9757690361734368Brandão, Helenohttps://orcid.org/ 0000-0002-7246-0212http://lattes.cnpq.br/7041466036665884https://orcid.org/0000-0003-1423-1603http://lattes.cnpq.br/1168302051992090Lira, Natália Limareponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPRORIGINALictioplanctondnametabarcoding.pdfapplication/pdf7337302http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/28999/1/ictioplanctondnametabarcoding.pdfd673e3f4912ecad18d908eeeaac6c8d9MD51TEXTictioplanctondnametabarcoding.pdf.txtictioplanctondnametabarcoding.pdf.txtExtracted texttext/plain317770http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/28999/2/ictioplanctondnametabarcoding.pdf.txt9c88bd96a12f04b35c62880e4f10bbbcMD52THUMBNAILictioplanctondnametabarcoding.pdf.jpgictioplanctondnametabarcoding.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1235http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/28999/3/ictioplanctondnametabarcoding.pdf.jpg22471568811e0e0e6e033cbb7031a582MD531/289992022-07-06 03:06:03.761oai:repositorio.utfpr.edu.br:1/28999Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.utfpr.edu.br:8080/oai/requestopendoar:2022-07-06T06:06:03Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR |
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv |
Composition of ichthyoplankton by DNA metabarcoding as a tool for evaluating potential conservation areas around the Santa Helena Biological Refuge - Lake Itaipu - PR. |
title |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR |
spellingShingle |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR Lira, Natália Lima CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS Peixes - Ovos Genética animal DNA Fishes - Eggs Animal genetics Ciências Ambientais |
title_short |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR |
title_full |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR |
title_fullStr |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR |
title_full_unstemmed |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR |
title_sort |
Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR |
author |
Lira, Natália Lima |
author_facet |
Lira, Natália Lima |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Blanco, Daniel Rodrigues |
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0003-1619-2417 |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/8998670968329882 |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Oliveira, Claudio de |
dc.contributor.advisor-co1ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0002-7010-8880 |
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/0297419882161114 |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Blanco, Daniel Rodrigues |
dc.contributor.referee1ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0003-1619-2417 |
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/8998670968329882 |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Almeida, Fernanda Simões de |
dc.contributor.referee2ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0002-0130-5047 |
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/9757690361734368 |
dc.contributor.referee3.fl_str_mv |
Brandão, Heleno |
dc.contributor.referee3ID.fl_str_mv |
https://orcid.org/ 0000-0002-7246-0212 |
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/7041466036665884 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
https://orcid.org/0000-0003-1423-1603 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/1168302051992090 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Lira, Natália Lima |
contributor_str_mv |
Blanco, Daniel Rodrigues Oliveira, Claudio de Blanco, Daniel Rodrigues Almeida, Fernanda Simões de Brandão, Heleno |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS |
topic |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS Peixes - Ovos Genética animal DNA Fishes - Eggs Animal genetics Ciências Ambientais |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Peixes - Ovos Genética animal DNA Fishes - Eggs Animal genetics |
dc.subject.capes.pt_BR.fl_str_mv |
Ciências Ambientais |
description |
O Refúgio Biológico de Santa Helena (RBSH) é uma Área de Relevante Interesse Biológico (ARIE) que faz parte das unidades de conservação (UC) municipais do estado do Paraná, sendo componente da Área de Preservação Permanente do Lago de Itaipu. Possui uma área total de 1.482,05 ha, estando localizado na Bacia Hidrográfica Paraná III no município de Santa Helena, extremo oeste do estado. A área da UC abrange apenas o ambiente terrestre, segundo o plano de manejo, o ambiente aquático é considerado como Zona de Amortecimento (ZA). Considerando que falta monitoramentos na ZA, a criação de novas áreas de proteção efetiva na parte aquática, mais especificamente no entorno do RBSH, se torna imprescindível. Muitas dessas áreas são utilizadas como local de desova e berçário de diferentes espécies de peixes residentes e migratórias, tornando-se importantes áreas para a ictiofauna. As abordagens conservacionistas envolvendo os estudos dos estágios iniciais da vida dos peixes têm se tornado cada vez mais comuns e importantes para a implantação de medidas de orientação e proteção dessas áreas. Tradicionalmente a identificação de ictioplâncton utiliza taxonomia clássica, entretanto, há uma extrema dificuldade em obter uma identificação precisa, visto a similaridade dos espécimes nessa fase. Com o advento da Biologia Molecular, a utilização de marcadores específicos possibilitou uma maior precisão nessas identificações. Por meio da técnica DNA metabarcoding, foram identificadas quais espécies estão desovando no entorno do RBSH, e através desses dados, espera-se que haja subsídios suficientes para a ampliação da área de preservação do RBSH. As amostragens de ictioplâncton foram realizadas ao longo de um ciclo reprodutivo (2020/2021), distribuídas em dez pontos localizados em regiões estratégicas do RBSH, na área de influência do Lago de Itaipu, pertencente à bacia do Alto rio Paraná. Neste período, foram realizadas sete amostragens por ponto, totalizando 70 amostras. O material coletado foi submetido a um sequenciamento massivo, utilizando a técnica de DNA metabarcoding com dois conjuntos de seis primers. Os 6.068 ovos / larvas coletados resultaram em 1.848 sequências viáveis, possibilitando a identificação de 82 táxons, pertencentes a sete ordens, 26 famílias e oito subfamílias. Este trabalho contribui com o registro de 25 identificações a nível de gênero e 57 a nível de espécie, identificamos também a presença de duas espécies introduzidas do continente africano e cinco espécies e quatro gêneros de peixes migradores de longa distância. |
publishDate |
2022 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2022-07-05T17:14:35Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2022-07-05T17:14:35Z |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2022-05-30 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
LIRA, Natalia Lima. Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR. 2022. Dissertação (Mestrado em Recursos Naturais e Sustentabilidade) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Santa Helena, 2022. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/28999 |
identifier_str_mv |
LIRA, Natalia Lima. Composição do ictioplâncton por DNA metabarcoding como ferramenta de avaliação de potenciais áreas de preservação no entorno do Refúgio Biológico de Santa Helena - Lago de Itaipu - PR. 2022. Dissertação (Mestrado em Recursos Naturais e Sustentabilidade) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Santa Helena, 2022. |
url |
http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/28999 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0 info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Tecnológica Federal do Paraná Santa Helena |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Recursos Naturais e Sustentabilidade |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UTFPR |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Tecnológica Federal do Paraná Santa Helena |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR) instacron:UTFPR |
instname_str |
Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR) |
instacron_str |
UTFPR |
institution |
UTFPR |
reponame_str |
Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) |
collection |
Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/28999/1/ictioplanctondnametabarcoding.pdf http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/28999/2/ictioplanctondnametabarcoding.pdf.txt http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/28999/3/ictioplanctondnametabarcoding.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
d673e3f4912ecad18d908eeeaac6c8d9 9c88bd96a12f04b35c62880e4f10bbbc 22471568811e0e0e6e033cbb7031a582 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1805923137347387392 |