Aprimoramento na captura de imagens de vasos sanguíneos da membrana corioalantóica (CAM) de embriões de galinha para processamento e cálculo de sua densidade

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Marcelo Klos da
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/26570
Resumo: Este trabalho apresenta o estudo do desenvolvimento de um método para melhorar as condições de observação e aprimorar resultados em experimentos de laboratório, a partir de um microscópio estereoscópico (lupa), da membrana corioalantoica de embrião (CAM) em ovos de galinha. Nesses experimentos foram implantados diferentes tipos de compostos que alteram os fatores de crescimento de vasos sanguíneos tanto para mais quanto para menos, ou seja, provocam uma alteração na densidade de vasos sanguíneos na região afetada. Essas pesquisas requerem a quantificação da vascularização para comparação dos efeitos estimuladores ou inibidores provocados por diversos agentes. Essa quantificação deve ser acurada, objetiva e consistente, por isso as imagens devem ter uma maior clareza nos aspectos observáveis e fatores que degradam a qualidade de uma imagem como: áreas de sombra, a falta de brilho e profundidade na visualização entre outros fatores devem ser minimizados. Para isso, primeiramente, foram observadas as principais limitações do sistema de iluminação da lupa na aquisição de imagens de CAMs e a partir do estudo das características das fontes de iluminação originais do microscópio e de fontes de iluminação alternativas e somando a utilização de recursos disponíveis, foi desenvolvido um aparato para melhorar a qualidade e o controle da iluminação. Para comparação dos resultados obtidos pelos dois métodos, foram utilizados nas imagens obtidas um método de contagem por grade e também um método de processamento digital, o B-COSFIRE para segmentar e possibilitar a medição das variações de densidade de vasos captados através do uso de fractais. Devido às características do método de iluminação proposto e desenvolvido para o estudo das membranas corioalantoicas, analisou-se um ganho nos resultados à medida que mais detalhes das imagens foram observados, isso tudo em comparação às imagens obtidas com a iluminação original do microscópio utilizado. Tornou-se nítido que, com uma melhor iluminação, destacam-se os vasos mais sutis, garantindo assim resultados melhores para uma posterior análise das imagens e medição da densidade dos vasos dentro do campo de visão.
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Essas pesquisas requerem a quantificação da vascularização para comparação dos efeitos estimuladores ou inibidores provocados por diversos agentes. Essa quantificação deve ser acurada, objetiva e consistente, por isso as imagens devem ter uma maior clareza nos aspectos observáveis e fatores que degradam a qualidade de uma imagem como: áreas de sombra, a falta de brilho e profundidade na visualização entre outros fatores devem ser minimizados. Para isso, primeiramente, foram observadas as principais limitações do sistema de iluminação da lupa na aquisição de imagens de CAMs e a partir do estudo das características das fontes de iluminação originais do microscópio e de fontes de iluminação alternativas e somando a utilização de recursos disponíveis, foi desenvolvido um aparato para melhorar a qualidade e o controle da iluminação. Para comparação dos resultados obtidos pelos dois métodos, foram utilizados nas imagens obtidas um método de contagem por grade e também um método de processamento digital, o B-COSFIRE para segmentar e possibilitar a medição das variações de densidade de vasos captados através do uso de fractais. Devido às características do método de iluminação proposto e desenvolvido para o estudo das membranas corioalantoicas, analisou-se um ganho nos resultados à medida que mais detalhes das imagens foram observados, isso tudo em comparação às imagens obtidas com a iluminação original do microscópio utilizado. Tornou-se nítido que, com uma melhor iluminação, destacam-se os vasos mais sutis, garantindo assim resultados melhores para uma posterior análise das imagens e medição da densidade dos vasos dentro do campo de visão.This work presents the study of the development of a method to improve the observation conditions and improve results in laboratory experiments, from a stereoscopic microscope (magnifying glass), of the embryo chorioallantoic membrane (CAM) in hen eggs. In these experiments, different types of compounds were implanted that alter blood vessel growth factors for both more and less, that is, they cause a change in the density of blood vessels in the affected region. These studies require the quantification of vascularization to compare the stimulatory or inhibitory effects caused by different agents. This quantification must be accurate, objective and consistent, só the images must have greater clarity in the observable aspects and factors that degrade the quality of an image such as: shadow areas, lack of brightness and depth in the visualization, among other factors, must be minimized. For this, first, the main limitations of the magnifying glass lighting system in the acquisition of images from CAMs and from the study of the characteristics of the original light sources of the microscope and alternative light sources, and adding the use of available resources, were observed, an apparatus was developed to improve the quality and control of lighting. To compare the results obtained by the two methods, a grid counting method and a digital processing method, the B-COSFIRE were used in the images obtained to segment and enable the measurement of density variations of captured vessels through the use of fractals. Due to the characteristics of the illumination method proposed and developed for the study of chorioallantoic membranes, a gain in the results was analyzed as more details of the images were observed, all this compared to the images obtained with the original illumination of the microscope used. It became clear that, with better lighting, more subtle vessels stand out, thus ensuring better results for further image analysis and measurement of vessel density within the field of view.porUniversidade Tecnológica Federal do ParanáCuritibaPrograma de Pós-Graduação em Engenharia BiomédicaUTFPRBrasilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA::BIOENGENHARIAEngenharia BiomédicaNeovascularizaçãoAngiogêneseCorioalantóideVasos sanguíneos - ImagemIluminação - ControleProcessamento de imagens - Técnicas digitaisNeovascularizationAngiogenesisChorioallantoicBlood-vessels - ImagingLighting- ControleImage processing - Digital techniquesAprimoramento na captura de imagens de vasos sanguíneos da membrana corioalantóica (CAM) de embriões de galinha para processamento e cálculo de sua densidadeImprovement in the image capture of blood vessels from the chorioallanthoic membrane (CAM) of chicken embryos for processing and calculation of their densityinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisCuritibaBorba, Gustavo Benvenuttihttps://orcid.org/ 0000-0001-7412-2412http://lattes.cnpq.br/2591233508037006Pereira, Luiz FernandoRepeke, Carlos Eduardo Palanchhttps://orcid.org/0000-0001-7933-0114http://lattes.cnpq.br/0500205133818118Borba, Gustavo Benvenuttihttps://orcid.org/ 0000-0001-7412-2412http://lattes.cnpq.br/2591233508037006Stebel, Sergio Leandrohttps://orcid.org/ 0000-0001-9215-811Xhttp://lattes.cnpq.br/8340523025399467https://orcid.org/0000-0003-0970-1199http://lattes.cnpq.br/4638660941640090Silva, Marcelo Klos dareponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPRCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26570/2/license_rdf4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81290http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26570/3/license.txtb9d82215ab23456fa2d8b49c5df1b95bMD53ORIGINALcapturaimagensmembranacorioalantoica.pdfapplication/pdf4363697http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26570/1/capturaimagensmembranacorioalantoica.pdf5c241108f7bbcbbae6fc767fd89c9788MD51TEXTcapturaimagensmembranacorioalantoica.pdf.txtcapturaimagensmembranacorioalantoica.pdf.txtExtracted texttext/plain161518http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26570/4/capturaimagensmembranacorioalantoica.pdf.txt14932b8eec8f0628a64ec536d9c2a250MD54THUMBNAILcapturaimagensmembranacorioalantoica.pdf.jpgcapturaimagensmembranacorioalantoica.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1298http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/26570/5/capturaimagensmembranacorioalantoica.pdf.jpgbdfbd763f9cceda6e4060d0ec9e160a9MD551/265702021-12-03 04:06:23.28oai:repositorio.utfpr.edu.br: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ório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.utfpr.edu.br:8080/oai/requestopendoar:2021-12-03T06:06:23Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)false
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