Inferência de rede de regulação da expressão de genes relacionados ao biofilme de Candida albicans influenciados pelo ácido lático

• Autor(a) principal: Morey, Alexandre Tadachi
• Data de Publicação: 2016
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
• Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/23543
• topic: CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO::METODOLOGIA E TECNICAS DA COMPUTACAO::SISTEMAS DE INFORMACAO; Regulação de expressão gênica; Biologia - Processamento de dados; Biofilme; Cândida albicans; Genetic regulation; Biology - Data processing; Biofims; Candida albicans

Candida albicans é uma levedura comensal de diferentes sítios anatômicos do homem, porém, em casos de imunodebilidades do hospedeiro tornam-se patogênicas, acometendo principalmente mucosas orofaríngeas e do trato urogenital. Um dos principais problemas enfrentados atualmente em relação às infecções causadas por este fungo é a formação do biofilme, uma comunidade microbiana composta por células de uma ou mais espécies protegida por uma matriz extracelular e que apresenta fenótipo diferente em relação às células planctônicas. No caso de mulheres, além de C. albicans, a bactéria Streptococcus agalactiae, produtora de ácido lático, podem causar infecções na mucosa vulvovaginal e estudos iniciais indicam que estes dois micro-organismos podem formar biofilmes mistos. Assim, o presente estudo utilizou dados de transcriptoma de C. albicans cultivada na presença de ácido lático e inferiu, utilizando o software DimReduction, redes de regulação da expressão de genes relacionados à formação de biofilme nesta levedura a partir 3 genes alvos: GPD2 (orf19.691), ACH1 (orf19.3171) e GCN4 (orf19.1358). Após a análise das 3 redes de regulação foi possível afirmar que a inferência estatística que apresentou maior correlação com a inferência biológica da formação do biofilme em C. albicans foi a que continha os genes GCN4 (orf19.1358), SEC6 (orf19.5463), GPX2 (orf19.85), orf19.7490, CTP1 (Orf19.5870) e Orf19.6668. Estes genes estão relacionados, principalmente, à adesão, formação de hifas, produção da matriz extracelular, via metabólica de carboidratos e ciclo celular, necessários para a formação e maturação do biofilme. Estes dados abrem perspectivas para o entendimento molecular da influência do ácido lático na formação do biofilme em C. albicans.