Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Reis, Leandro Vasconcelos dos
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/4184
Resumo: Atualmente os laboratórios clínicos estão ofertando exames nos quais eles não possuem condições de realizá-los, devido a falta de equipamentos ou mesmo por falta de mão de obra especializada, com isso é feita a coleta dos exames em um laboratório e enviado para um segundo laboratório que fará toda a análise. O problema dessa prática é que torna o exame vulnerável a erros nos procedimentos e com demora na resposta ao paciente. A partir desse entendimento, o projeto desenvolvido tem como objetivo o construir um protótipo para coletar lâminas citológicas, fazendo a conversão em imagens digitais e disponibilização em tempo real através de uma plataforma na nuvem, para laboratórios de análises. Dessa forma, os laboratórios podem eliminar o processo de transporte, diminuindo o tempo levado entre a coleta e o acesso das lâminas, visando melhorar o tempo de retorno dos resultados dos exames aos pacientes e diminuir os erros nos procedimentos dos exames. O módulo coletor foi desenvolvido totalmente autônomo; em seu interior há um computador embarcado (Raspberry PI) que funciona como um microcomputador normal. Possui uma câmera digital de 5 Megapixels, especial para a Raspberry PI, fazendo a função de coletar as lâminas físicas, transformando-as em imagens digitais através de um sistema local. O sistema local de imagens foi desenvolvido com Javascript e HTML5, e roda sobre o servidor local Node.JS com CLI do Firebase no navegador da Raspberry. A plataforma que recebe as imagens e os dados dos exames, fica online 24 horas por 7 dias da semana. Fica hospedada em um servidor na nuvem que mantém o acesso ao serviço e conecta-se ao Google Firebase. Este por sua vez, armazena e gerencia todos os dados e imagens do sistema.
id UTFPR-12_dde5295b775c8d5f328cced2cefbbe20
oai_identifier_str oai:repositorio.utfpr.edu.br:1/4184
network_acronym_str UTFPR-12
network_name_str Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
repository_id_str
spelling 2019-07-18T17:23:52Z2019-07-18T17:23:52Z2019-02-07REIS, Leandro Vasconcelos dos. Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises. 2019. 87 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Biomédica) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, 2019.http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/4184Atualmente os laboratórios clínicos estão ofertando exames nos quais eles não possuem condições de realizá-los, devido a falta de equipamentos ou mesmo por falta de mão de obra especializada, com isso é feita a coleta dos exames em um laboratório e enviado para um segundo laboratório que fará toda a análise. O problema dessa prática é que torna o exame vulnerável a erros nos procedimentos e com demora na resposta ao paciente. A partir desse entendimento, o projeto desenvolvido tem como objetivo o construir um protótipo para coletar lâminas citológicas, fazendo a conversão em imagens digitais e disponibilização em tempo real através de uma plataforma na nuvem, para laboratórios de análises. Dessa forma, os laboratórios podem eliminar o processo de transporte, diminuindo o tempo levado entre a coleta e o acesso das lâminas, visando melhorar o tempo de retorno dos resultados dos exames aos pacientes e diminuir os erros nos procedimentos dos exames. O módulo coletor foi desenvolvido totalmente autônomo; em seu interior há um computador embarcado (Raspberry PI) que funciona como um microcomputador normal. Possui uma câmera digital de 5 Megapixels, especial para a Raspberry PI, fazendo a função de coletar as lâminas físicas, transformando-as em imagens digitais através de um sistema local. O sistema local de imagens foi desenvolvido com Javascript e HTML5, e roda sobre o servidor local Node.JS com CLI do Firebase no navegador da Raspberry. A plataforma que recebe as imagens e os dados dos exames, fica online 24 horas por 7 dias da semana. Fica hospedada em um servidor na nuvem que mantém o acesso ao serviço e conecta-se ao Google Firebase. Este por sua vez, armazena e gerencia todos os dados e imagens do sistema.At present the clinical laboratories are offering exams in which they are not able to perform them, due to the lack of equipment or even lack of specialized manpower, with which the exams are collected in a laboratory and sent to a second laboratory which will do the whole analysis. The problem with this practice is that it makes the examination vulnerable to procedural errors and delays in patient response. Based on this understanding, the project aims to build a prototype to collect cytological slides, converting them into digital images and making them available in real time through a cloud platform for analysis laboratories. In this way, the laboratories can eliminate the transport process, reducing the time taken between collection and access of the slides, aiming to improve the time of return of the results of the exams to the patients and to reduce errors in the procedures of the exams. The collector module was developed completely autonomous; Inside there is an embedded computer (Raspberry PI) that works like a normal microcomputer. It has a 5 Megapixel digital camera, especially for the Raspberry PI, which collects the physical slides, transforming them into digital images through a local system. The local image system was developed with Javascript and HTML5, and runs on the local Node.JS server with Firebase CLI in the Raspberry browser. The platform that receives the images and the data of the exams, goes online 24 hours by 7 days of the week. It is hosted on a server in the cloud that maintains access to the service and connects to Google Firebase. This in turn stores and manages all data and system images.porUniversidade Tecnológica Federal do ParanáCuritibaPrograma de Pós-Graduação em Engenharia BiomédicaUTFPRBrasilCNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA::ENGENHARIA MEDICA::INSTRUMENTACAO ODONTOLOGICA E MEDICO-HOSPITALAREngenharia BiomédicaProcessamento de imagens - Técnicas digitaisLaboratórios de patologia clínica - ExamesCitodiagnósticoEngenharia de protótiposProcessamento eletrônico de dados em tempo realComputação em nuvemImagens digitaisBanco de dados em linhaEngenharia biomédicaImage processing - Digital techniquesValidaçãoPathological laboratories - ExaminationsCytodiagnosisPrototypes, EngineeringReal-time data processingCloud computingDigital imagesOnline databasesBiomedical engineeringLeitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análisesOptical reader of cytological blades wiht bank storage of online images to agilize the process of visualization in analytical laboratoriesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisCuritibaJakubiak, Rosangela Requihttp://lattes.cnpq.br/9416396245605040Jakubiak, Rosangela RequiMiquelin, Charlie AntoniKuretzki, Carlos Henriquehttp://lattes.cnpq.br/6538320925343571Reis, Leandro Vasconcelos dosinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)instacron:UTFPRORIGINALCT_PPGEB_M_Reis, Leandro Vasconcelos dos_2019.pdfCT_PPGEB_M_Reis, Leandro Vasconcelos dos_2019.pdfapplication/pdf1895960http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/1/CT_PPGEB_M_Reis%2c%20Leandro%20Vasconcelos%20dos_2019.pdf498b75e275de9b2c54c179c9456fcb19MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81290http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/2/license.txtb9d82215ab23456fa2d8b49c5df1b95bMD52TEXTCT_PPGEB_M_Reis, Leandro Vasconcelos dos_2019.pdf.txtCT_PPGEB_M_Reis, Leandro Vasconcelos dos_2019.pdf.txtExtracted texttext/plain135479http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/3/CT_PPGEB_M_Reis%2c%20Leandro%20Vasconcelos%20dos_2019.pdf.txte86eb854d3c5f70f3a289ba8f71ccba6MD53THUMBNAILCT_PPGEB_M_Reis, Leandro Vasconcelos dos_2019.pdf.jpgCT_PPGEB_M_Reis, Leandro Vasconcelos dos_2019.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1252http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/4/CT_PPGEB_M_Reis%2c%20Leandro%20Vasconcelos%20dos_2019.pdf.jpg36909cd17ce170eb87cb34d2d191ceb0MD541/41842019-07-19 03:00:50.934oai:repositorio.utfpr.edu.br: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ório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.utfpr.edu.br:8080/oai/requestopendoar:2019-07-19T06:00:50Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Optical reader of cytological blades wiht bank storage of online images to agilize the process of visualization in analytical laboratories
title Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
spellingShingle Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
Reis, Leandro Vasconcelos dos
CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA::ENGENHARIA MEDICA::INSTRUMENTACAO ODONTOLOGICA E MEDICO-HOSPITALAR
Processamento de imagens - Técnicas digitais
Laboratórios de patologia clínica - Exames
Citodiagnóstico
Engenharia de protótipos
Processamento eletrônico de dados em tempo real
Computação em nuvem
Imagens digitais
Banco de dados em linha
Engenharia biomédica
Image processing - Digital techniquesValidação
Pathological laboratories - Examinations
Cytodiagnosis
Prototypes, Engineering
Real-time data processing
Cloud computing
Digital images
Online databases
Biomedical engineering
Engenharia Biomédica
title_short Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
title_full Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
title_fullStr Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
title_full_unstemmed Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
title_sort Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises
author Reis, Leandro Vasconcelos dos
author_facet Reis, Leandro Vasconcelos dos
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Jakubiak, Rosangela Requi
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9416396245605040
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Jakubiak, Rosangela Requi
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Miquelin, Charlie Antoni
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Kuretzki, Carlos Henrique
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6538320925343571
dc.contributor.author.fl_str_mv Reis, Leandro Vasconcelos dos
contributor_str_mv Jakubiak, Rosangela Requi
Jakubiak, Rosangela Requi
Miquelin, Charlie Antoni
Kuretzki, Carlos Henrique
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA::ENGENHARIA MEDICA::INSTRUMENTACAO ODONTOLOGICA E MEDICO-HOSPITALAR
topic CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA::ENGENHARIA MEDICA::INSTRUMENTACAO ODONTOLOGICA E MEDICO-HOSPITALAR
Processamento de imagens - Técnicas digitais
Laboratórios de patologia clínica - Exames
Citodiagnóstico
Engenharia de protótipos
Processamento eletrônico de dados em tempo real
Computação em nuvem
Imagens digitais
Banco de dados em linha
Engenharia biomédica
Image processing - Digital techniquesValidação
Pathological laboratories - Examinations
Cytodiagnosis
Prototypes, Engineering
Real-time data processing
Cloud computing
Digital images
Online databases
Biomedical engineering
Engenharia Biomédica
dc.subject.por.fl_str_mv Processamento de imagens - Técnicas digitais
Laboratórios de patologia clínica - Exames
Citodiagnóstico
Engenharia de protótipos
Processamento eletrônico de dados em tempo real
Computação em nuvem
Imagens digitais
Banco de dados em linha
Engenharia biomédica
Image processing - Digital techniquesValidação
Pathological laboratories - Examinations
Cytodiagnosis
Prototypes, Engineering
Real-time data processing
Cloud computing
Digital images
Online databases
Biomedical engineering
dc.subject.capes.pt_BR.fl_str_mv Engenharia Biomédica
description Atualmente os laboratórios clínicos estão ofertando exames nos quais eles não possuem condições de realizá-los, devido a falta de equipamentos ou mesmo por falta de mão de obra especializada, com isso é feita a coleta dos exames em um laboratório e enviado para um segundo laboratório que fará toda a análise. O problema dessa prática é que torna o exame vulnerável a erros nos procedimentos e com demora na resposta ao paciente. A partir desse entendimento, o projeto desenvolvido tem como objetivo o construir um protótipo para coletar lâminas citológicas, fazendo a conversão em imagens digitais e disponibilização em tempo real através de uma plataforma na nuvem, para laboratórios de análises. Dessa forma, os laboratórios podem eliminar o processo de transporte, diminuindo o tempo levado entre a coleta e o acesso das lâminas, visando melhorar o tempo de retorno dos resultados dos exames aos pacientes e diminuir os erros nos procedimentos dos exames. O módulo coletor foi desenvolvido totalmente autônomo; em seu interior há um computador embarcado (Raspberry PI) que funciona como um microcomputador normal. Possui uma câmera digital de 5 Megapixels, especial para a Raspberry PI, fazendo a função de coletar as lâminas físicas, transformando-as em imagens digitais através de um sistema local. O sistema local de imagens foi desenvolvido com Javascript e HTML5, e roda sobre o servidor local Node.JS com CLI do Firebase no navegador da Raspberry. A plataforma que recebe as imagens e os dados dos exames, fica online 24 horas por 7 dias da semana. Fica hospedada em um servidor na nuvem que mantém o acesso ao serviço e conecta-se ao Google Firebase. Este por sua vez, armazena e gerencia todos os dados e imagens do sistema.
publishDate 2019
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-07-18T17:23:52Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-07-18T17:23:52Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2019-02-07
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv REIS, Leandro Vasconcelos dos. Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises. 2019. 87 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Biomédica) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, 2019.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/4184
identifier_str_mv REIS, Leandro Vasconcelos dos. Leitor óptico de lâminas citológicas com armazenamento em banco de imagens online para agilizar o processo de visualização em laboratório de análises. 2019. 87 f. Dissertação (Mestrado em Engenharia Biomédica) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, 2019.
url http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/4184
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Curitiba
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Engenharia Biomédica
dc.publisher.initials.fl_str_mv UTFPR
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Tecnológica Federal do Paraná
Curitiba
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
instname:Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)
instacron:UTFPR
instname_str Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)
instacron_str UTFPR
institution UTFPR
reponame_str Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
collection Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
bitstream.url.fl_str_mv http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/1/CT_PPGEB_M_Reis%2c%20Leandro%20Vasconcelos%20dos_2019.pdf
http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/2/license.txt
http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/3/CT_PPGEB_M_Reis%2c%20Leandro%20Vasconcelos%20dos_2019.pdf.txt
http://repositorio.utfpr.edu.br:8080/jspui/bitstream/1/4184/4/CT_PPGEB_M_Reis%2c%20Leandro%20Vasconcelos%20dos_2019.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 498b75e275de9b2c54c179c9456fcb19
b9d82215ab23456fa2d8b49c5df1b95b
e86eb854d3c5f70f3a289ba8f71ccba6
36909cd17ce170eb87cb34d2d191ceb0
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT)) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná (UTFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1805923161078759424