Simulações da agregação da amilina e causas da diabetes tipo II

• Autor(a) principal: Santos, Joelmir dos
• Data de Publicação: 2013
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UTFPR (da Universidade Tecnológica Federal do Paraná (RIUT))
• Texto Completo: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/15893
• topic: Tecnologia em Processos Químicos; Diabetes; Termodinâmica; Thermodynamics

A Amilina ou IAPP (Islet amyloid polypeptide) é potencialmente responsável pelo desenvolvimento de formas agregadas que atuam no desenvolvimento da diabetes. Com uma abordagem microcanônica, objetivou-se investigar as causas da diabetes mellitus tipo II através de simulações de Monte Carlo, técnica oriunda da Física-estatística. Tais simulações foram estruturadas tendo -se como base de dados a hidrofobicidade conforme escala ‘Roseman’ de cada aminoácido constituinte da cadeia peptídica, sendo realizadas análises termodinâmicas com enfoque na entropia (S) e avaliando as possíveis configurações favoráveis a tal agregação para as variantes mutantes rIAPP (rato comum), cIAPP (gato‘domestico’) e hIAPP (homem). Foi usado o algoritmo multicanônico (MUCA)implementado em Fortran 90 e executado em Linux. Como ferramenta de visualização utilizou-se o RasMol, para comparação com o PDB e verificação dos estados agregados que induzem a doença, já para análises dos dados numéricos empregou-se o QtiPlot e xMGrace.