Modelo em Excel para auxiliar na identificação de enterobacterales para usuários de provas bioquímicas manuais

• Autor(a) principal: Bonetti, Alessandra Fagundes
• Data de Publicação: 2023
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/271537
• topic: Excel; Espectrometria de massas por ionização e dessorção a laser assistida por matriz; Enterobacter; Enterobacteriales; Biochemical tests; Excel; MALDI -TOF MS

Os laboratórios de pequeno e de médio porte que não contam com métodos automatizados fazem a identificação de Enterobacterales através de testes bioquímicos manuais. O presente trabalho desenvolveu um modelo em planilha Excel para auxiliar na leitura da identificação bacteriana aos usuários deste perfil de metodologia. A planilha foi também organizada para fornecer as identificações em ordem de probabilidade. Sua validação foi feita através da comparação dos resultados obtidos com os métodos referência e MALDI-TOF MS, tendo como base um total de 38 amostras, das quais 34 (89,5%) apresentaram concordância de resultados com alto índice de probabilidade (superior a 90%). Dos isolados restantes, 04 apresentaram duas possibilidades de identificação bacteriana, o que foi verificado tanto no método clássico como na planilha Excel. Dentre tais amostras, 01 não apresentou o resultado dos testes esperado para sua espécie, enquanto as outras 03 apresentaram resultados de bioquimismo esperados para sua espécie, mas com percentuais abaixo de 90% no índice de probabilidade, possivelmente pelo baixo poder discriminatório dos próprios testes bioquímicos utilizados na rotina para a identificação de alguns gêneros de Enterobacterales. Em tais situações, a utilização da planilha Excel proporciona a vantagem de obter os percentuais de ocorrência de cada bactéria e, caso inconclusivos, recomendar a realização de mais testes ou a liberação do resultado apenas por gênero bacteriano. No conjunto de 34 amostras que apresentaram identidade com alto índice de probabilidade, 02 amostras de Escherichia coli (amostras 21 e 22) tiveram resultados pouco frequentes para a fermentação da lactose (negativa) e não foram identificadas pela metodologia referência, mas o foram corretamente pela planilha Excel. Em resumo, quando preenchida com os resultados esperados pela literatura, a planilha Excel apontou o microorganismo correto, o que demonstra que eventuais limitações verificadas decorrem de fatores externos a ela. Quando comparados os resultados da planilha Excel com aqueles identificados pelo MALDI-TOFMS, apenas 04 amostras (todas bactérias do mesmo gênero) apresentaram divergência, sendo identificadas pela tabela como Klebsiella oxytoca, enquanto por MALDI-TOF MS foi identificada como Klebsiella variicola, microorganismo este isolado recentemente somente pelos métodos genómicos, proteônicos ou moleculares.