Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582 |
Resumo: | Aeromonas spp. são bactérias ubíquas que vem recebendo crescente atenção como patógenos humanos, devido sua ocorrência generalizada em alimentos, em processos infecciosos humanos e em ambientes aquáticos. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade taxonômica de Aeromonas spp. e a distribuição de genes associados a virulência nas águas da lagoa Rodrigo de Freitas, Rio de Janeiro, Brasil. Do total de 87 isolados identificados fenotipicamente como Aeromonas spp., 87% (76/87) foram confirmados como pertencentes a esse gênero pela PCR do gene rrs do 16S rRNA. A análise filogenética das sequencias dos genes rpoB/gyrB revelaram a presença de 3 grandes grupos, sendo grupo A (n=42), grupo B (n= 12) e grupo C (n=18). Os isolados dos três grupos alinharam com 98% a 100% com sequencias de referência de Aeromonas punctata/caviae, A. hydrofila e A. dahkensis, respectivamente. Foi identificada também uma cepa de A. jandaei e três de A. enteropelogenes. A pesquisa dos genes de virulência (atc, aerA, hlyA, asp e amp) resultou em 19 perfis de virulência com distribuição heterogênea entre os isolados, 14% (11/76) apresentaram os perfis XIV, XV, XVI, XVII e XVIII com 4 genes de virulência e 8% (6/76) apresentaram o perfil XIX que contém todos os genes investigados. Oitenta e seis por cento (65/76) e 94% (71/76) dos isolados também apresentaram atividade enzimática hemolítica e proteolítica, respectivamente. Nossos resultados indicaram que as espécies de Aeromonas na lagoa Rodrigo de Freitas são diversas e possuem um considerável potencial de virulência. Assim, a adoção de abordagem molecular na sua identificação faz-se necessária não só para o tratamento de pacientes, mas também para estudos ambientais como, o rastreamento de fontes e a associação com perfis de virulência e resistência aos antibióticos. Além disso, estes dados nos permitem sugerir a necessidade de investigações epidemiológicas mais aprofundadas desses patógenos em ambientes aquáticos no Rio de Janeiro. |
id |
CRUZ_1f26238856be0d6079f38b3fa6b318a1 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.arca.fiocruz.br:icict/35582 |
network_acronym_str |
CRUZ |
network_name_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
repository_id_str |
2135 |
spelling |
Sobral, Mariana de Melo RodriguesCapasso, Ivano Rafaelle Victorio de FilippisFreitas-Almeida, Angela Corrêa deSilva, Ana Cristina Rivas daClementino, Maysa Beatriz Mandetta2019-09-13T17:49:00Z2019-09-13T17:49:00Z2018SOBRAL, M. M. R. Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas. 2018. 65 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Vigilância Sanitária) – Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582Aeromonas spp. são bactérias ubíquas que vem recebendo crescente atenção como patógenos humanos, devido sua ocorrência generalizada em alimentos, em processos infecciosos humanos e em ambientes aquáticos. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade taxonômica de Aeromonas spp. e a distribuição de genes associados a virulência nas águas da lagoa Rodrigo de Freitas, Rio de Janeiro, Brasil. Do total de 87 isolados identificados fenotipicamente como Aeromonas spp., 87% (76/87) foram confirmados como pertencentes a esse gênero pela PCR do gene rrs do 16S rRNA. A análise filogenética das sequencias dos genes rpoB/gyrB revelaram a presença de 3 grandes grupos, sendo grupo A (n=42), grupo B (n= 12) e grupo C (n=18). Os isolados dos três grupos alinharam com 98% a 100% com sequencias de referência de Aeromonas punctata/caviae, A. hydrofila e A. dahkensis, respectivamente. Foi identificada também uma cepa de A. jandaei e três de A. enteropelogenes. A pesquisa dos genes de virulência (atc, aerA, hlyA, asp e amp) resultou em 19 perfis de virulência com distribuição heterogênea entre os isolados, 14% (11/76) apresentaram os perfis XIV, XV, XVI, XVII e XVIII com 4 genes de virulência e 8% (6/76) apresentaram o perfil XIX que contém todos os genes investigados. Oitenta e seis por cento (65/76) e 94% (71/76) dos isolados também apresentaram atividade enzimática hemolítica e proteolítica, respectivamente. Nossos resultados indicaram que as espécies de Aeromonas na lagoa Rodrigo de Freitas são diversas e possuem um considerável potencial de virulência. Assim, a adoção de abordagem molecular na sua identificação faz-se necessária não só para o tratamento de pacientes, mas também para estudos ambientais como, o rastreamento de fontes e a associação com perfis de virulência e resistência aos antibióticos. Além disso, estes dados nos permitem sugerir a necessidade de investigações epidemiológicas mais aprofundadas desses patógenos em ambientes aquáticos no Rio de Janeiro.Aeromonas spp. are ubiquitous bacteria that have been receiving increasing attention as human pathogens due to their widespread occurrence in food, human infectious and aquatic environments. The objective of this study was to evaluate the taxonomic diversity of Aeromonas spp. and the distribution of virulence associated genes in the waters of the Rodrigo de Freitas lagoon, Rio de Janeiro, Brazil. Out of the 87 isolates phenotypically identified as Aeromonas spp., 87% (76/87) were confirmed as belonging to this genus by PCR of the rrs gene of 16S rRNA. Phylogenetic analysis of rpoB/gyrB gene sequences revealed the presence of three main groups, group A (n = 42), group B (n = 12) and group C (n = 18). Isolates from the three groups showed 98% to 100% identity with reference sequences of Aeromonas punctata / caviae, A. hydrofila and A. dahkensis, respectively. Besides, one strain of A. jandaei and three of A. enteropelogenes were also identified. The virulence genes (atc, aerA, hlyA, asp and amp) resulted in 19 virulence profiles with heterogeneous distribution among the isolates, 14% (11/76) presented profiles XIV, XV, XVI, XVII and XVIII with 4 virulence genes and 8% (6/76) presented the XIX profile that contains all the genes investigated. Eighty-six percent (65/76) and 94% (71/76) of the isolates also presented hemolytic and proteolytic enzymatic activity, respectively. Our results indicated that the species of Aeromonas in the lagoon Rodrigo de Freitas are diverse and have a considerable virulence potential. Thus, the implementation of molecular approach in its identification is necessary not only for the patients treatments, but also for environmental studies such as the tracing of sources, association with virulence profiles and resistance to antibiotics. In addition, these data allow us to suggest the necessity of further epidemiological investigations of these pathogens in aquatic environments in Rio de Janeiro.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porAeromonas sppGenes de VirulênciaAnálise filogenéticaLagoa Rodrigo de FreitasAeromonas spp.Virulence GenesPhylogenetic AnalysisRodrigo de Freitas LagoonAeromonasGenesFilogeniaAnáliseDiversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2018Coordenação de Pós GraduaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em SaúdeMestrado AcadêmicoRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Vigilância Sanitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdfDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdfapplication/pdf1151034https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf0ea511108c079829d3d6bc222ae2d546MD52TEXTDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txtDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txtExtracted texttext/plain106418https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txt9bda4b20595f1c474a3b3d458ac9b1b7MD53icict/355822019-09-14 02:06:56.988oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-09-14T05:06:56Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas |
title |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas |
spellingShingle |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas Sobral, Mariana de Melo Rodrigues Aeromonas spp Genes de Virulência Análise filogenética Lagoa Rodrigo de Freitas Aeromonas spp. Virulence Genes Phylogenetic Analysis Rodrigo de Freitas Lagoon Aeromonas Genes Filogenia Análise |
title_short |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas |
title_full |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas |
title_fullStr |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas |
title_full_unstemmed |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas |
title_sort |
Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas |
author |
Sobral, Mariana de Melo Rodrigues |
author_facet |
Sobral, Mariana de Melo Rodrigues |
author_role |
author |
dc.contributor.member.none.fl_str_mv |
Capasso, Ivano Rafaelle Victorio de Filippis Freitas-Almeida, Angela Corrêa de Silva, Ana Cristina Rivas da |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Sobral, Mariana de Melo Rodrigues |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Clementino, Maysa Beatriz Mandetta |
contributor_str_mv |
Clementino, Maysa Beatriz Mandetta |
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv |
Aeromonas spp Genes de Virulência Análise filogenética Lagoa Rodrigo de Freitas |
topic |
Aeromonas spp Genes de Virulência Análise filogenética Lagoa Rodrigo de Freitas Aeromonas spp. Virulence Genes Phylogenetic Analysis Rodrigo de Freitas Lagoon Aeromonas Genes Filogenia Análise |
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv |
Aeromonas spp. Virulence Genes Phylogenetic Analysis Rodrigo de Freitas Lagoon |
dc.subject.decs.pt_BR.fl_str_mv |
Aeromonas Genes Filogenia Análise |
description |
Aeromonas spp. são bactérias ubíquas que vem recebendo crescente atenção como patógenos humanos, devido sua ocorrência generalizada em alimentos, em processos infecciosos humanos e em ambientes aquáticos. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade taxonômica de Aeromonas spp. e a distribuição de genes associados a virulência nas águas da lagoa Rodrigo de Freitas, Rio de Janeiro, Brasil. Do total de 87 isolados identificados fenotipicamente como Aeromonas spp., 87% (76/87) foram confirmados como pertencentes a esse gênero pela PCR do gene rrs do 16S rRNA. A análise filogenética das sequencias dos genes rpoB/gyrB revelaram a presença de 3 grandes grupos, sendo grupo A (n=42), grupo B (n= 12) e grupo C (n=18). Os isolados dos três grupos alinharam com 98% a 100% com sequencias de referência de Aeromonas punctata/caviae, A. hydrofila e A. dahkensis, respectivamente. Foi identificada também uma cepa de A. jandaei e três de A. enteropelogenes. A pesquisa dos genes de virulência (atc, aerA, hlyA, asp e amp) resultou em 19 perfis de virulência com distribuição heterogênea entre os isolados, 14% (11/76) apresentaram os perfis XIV, XV, XVI, XVII e XVIII com 4 genes de virulência e 8% (6/76) apresentaram o perfil XIX que contém todos os genes investigados. Oitenta e seis por cento (65/76) e 94% (71/76) dos isolados também apresentaram atividade enzimática hemolítica e proteolítica, respectivamente. Nossos resultados indicaram que as espécies de Aeromonas na lagoa Rodrigo de Freitas são diversas e possuem um considerável potencial de virulência. Assim, a adoção de abordagem molecular na sua identificação faz-se necessária não só para o tratamento de pacientes, mas também para estudos ambientais como, o rastreamento de fontes e a associação com perfis de virulência e resistência aos antibióticos. Além disso, estes dados nos permitem sugerir a necessidade de investigações epidemiológicas mais aprofundadas desses patógenos em ambientes aquáticos no Rio de Janeiro. |
publishDate |
2018 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2018 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2019-09-13T17:49:00Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2019-09-13T17:49:00Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
SOBRAL, M. M. R. Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas. 2018. 65 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Vigilância Sanitária) – Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582 |
identifier_str_mv |
SOBRAL, M. M. R. Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas. 2018. 65 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Vigilância Sanitária) – Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018. |
url |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) instacron:FIOCRUZ |
instname_str |
Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
instacron_str |
FIOCRUZ |
institution |
FIOCRUZ |
reponame_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
collection |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/1/license.txt https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 0ea511108c079829d3d6bc222ae2d546 9bda4b20595f1c474a3b3d458ac9b1b7 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.arca@fiocruz.br |
_version_ |
1822791516648636416 |