Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sobral, Mariana de Melo Rodrigues
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582
Resumo: Aeromonas spp. são bactérias ubíquas que vem recebendo crescente atenção como patógenos humanos, devido sua ocorrência generalizada em alimentos, em processos infecciosos humanos e em ambientes aquáticos. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade taxonômica de Aeromonas spp. e a distribuição de genes associados a virulência nas águas da lagoa Rodrigo de Freitas, Rio de Janeiro, Brasil. Do total de 87 isolados identificados fenotipicamente como Aeromonas spp., 87% (76/87) foram confirmados como pertencentes a esse gênero pela PCR do gene rrs do 16S rRNA. A análise filogenética das sequencias dos genes rpoB/gyrB revelaram a presença de 3 grandes grupos, sendo grupo A (n=42), grupo B (n= 12) e grupo C (n=18). Os isolados dos três grupos alinharam com 98% a 100% com sequencias de referência de Aeromonas punctata/caviae, A. hydrofila e A. dahkensis, respectivamente. Foi identificada também uma cepa de A. jandaei e três de A. enteropelogenes. A pesquisa dos genes de virulência (atc, aerA, hlyA, asp e amp) resultou em 19 perfis de virulência com distribuição heterogênea entre os isolados, 14% (11/76) apresentaram os perfis XIV, XV, XVI, XVII e XVIII com 4 genes de virulência e 8% (6/76) apresentaram o perfil XIX que contém todos os genes investigados. Oitenta e seis por cento (65/76) e 94% (71/76) dos isolados também apresentaram atividade enzimática hemolítica e proteolítica, respectivamente. Nossos resultados indicaram que as espécies de Aeromonas na lagoa Rodrigo de Freitas são diversas e possuem um considerável potencial de virulência. Assim, a adoção de abordagem molecular na sua identificação faz-se necessária não só para o tratamento de pacientes, mas também para estudos ambientais como, o rastreamento de fontes e a associação com perfis de virulência e resistência aos antibióticos. Além disso, estes dados nos permitem sugerir a necessidade de investigações epidemiológicas mais aprofundadas desses patógenos em ambientes aquáticos no Rio de Janeiro.
id CRUZ_1f26238856be0d6079f38b3fa6b318a1
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/35582
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Sobral, Mariana de Melo RodriguesCapasso, Ivano Rafaelle Victorio de FilippisFreitas-Almeida, Angela Corrêa deSilva, Ana Cristina Rivas daClementino, Maysa Beatriz Mandetta2019-09-13T17:49:00Z2019-09-13T17:49:00Z2018SOBRAL, M. M. R. Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas. 2018. 65 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Vigilância Sanitária) – Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582Aeromonas spp. são bactérias ubíquas que vem recebendo crescente atenção como patógenos humanos, devido sua ocorrência generalizada em alimentos, em processos infecciosos humanos e em ambientes aquáticos. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade taxonômica de Aeromonas spp. e a distribuição de genes associados a virulência nas águas da lagoa Rodrigo de Freitas, Rio de Janeiro, Brasil. Do total de 87 isolados identificados fenotipicamente como Aeromonas spp., 87% (76/87) foram confirmados como pertencentes a esse gênero pela PCR do gene rrs do 16S rRNA. A análise filogenética das sequencias dos genes rpoB/gyrB revelaram a presença de 3 grandes grupos, sendo grupo A (n=42), grupo B (n= 12) e grupo C (n=18). Os isolados dos três grupos alinharam com 98% a 100% com sequencias de referência de Aeromonas punctata/caviae, A. hydrofila e A. dahkensis, respectivamente. Foi identificada também uma cepa de A. jandaei e três de A. enteropelogenes. A pesquisa dos genes de virulência (atc, aerA, hlyA, asp e amp) resultou em 19 perfis de virulência com distribuição heterogênea entre os isolados, 14% (11/76) apresentaram os perfis XIV, XV, XVI, XVII e XVIII com 4 genes de virulência e 8% (6/76) apresentaram o perfil XIX que contém todos os genes investigados. Oitenta e seis por cento (65/76) e 94% (71/76) dos isolados também apresentaram atividade enzimática hemolítica e proteolítica, respectivamente. Nossos resultados indicaram que as espécies de Aeromonas na lagoa Rodrigo de Freitas são diversas e possuem um considerável potencial de virulência. Assim, a adoção de abordagem molecular na sua identificação faz-se necessária não só para o tratamento de pacientes, mas também para estudos ambientais como, o rastreamento de fontes e a associação com perfis de virulência e resistência aos antibióticos. Além disso, estes dados nos permitem sugerir a necessidade de investigações epidemiológicas mais aprofundadas desses patógenos em ambientes aquáticos no Rio de Janeiro.Aeromonas spp. are ubiquitous bacteria that have been receiving increasing attention as human pathogens due to their widespread occurrence in food, human infectious and aquatic environments. The objective of this study was to evaluate the taxonomic diversity of Aeromonas spp. and the distribution of virulence associated genes in the waters of the Rodrigo de Freitas lagoon, Rio de Janeiro, Brazil. Out of the 87 isolates phenotypically identified as Aeromonas spp., 87% (76/87) were confirmed as belonging to this genus by PCR of the rrs gene of 16S rRNA. Phylogenetic analysis of rpoB/gyrB gene sequences revealed the presence of three main groups, group A (n = 42), group B (n = 12) and group C (n = 18). Isolates from the three groups showed 98% to 100% identity with reference sequences of Aeromonas punctata / caviae, A. hydrofila and A. dahkensis, respectively. Besides, one strain of A. jandaei and three of A. enteropelogenes were also identified. The virulence genes (atc, aerA, hlyA, asp and amp) resulted in 19 virulence profiles with heterogeneous distribution among the isolates, 14% (11/76) presented profiles XIV, XV, XVI, XVII and XVIII with 4 virulence genes and 8% (6/76) presented the XIX profile that contains all the genes investigated. Eighty-six percent (65/76) and 94% (71/76) of the isolates also presented hemolytic and proteolytic enzymatic activity, respectively. Our results indicated that the species of Aeromonas in the lagoon Rodrigo de Freitas are diverse and have a considerable virulence potential. Thus, the implementation of molecular approach in its identification is necessary not only for the patients treatments, but also for environmental studies such as the tracing of sources, association with virulence profiles and resistance to antibiotics. In addition, these data allow us to suggest the necessity of further epidemiological investigations of these pathogens in aquatic environments in Rio de Janeiro.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porAeromonas sppGenes de VirulênciaAnálise filogenéticaLagoa Rodrigo de FreitasAeromonas spp.Virulence GenesPhylogenetic AnalysisRodrigo de Freitas LagoonAeromonasGenesFilogeniaAnáliseDiversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2018Coordenação de Pós GraduaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em SaúdeMestrado AcadêmicoRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Vigilância Sanitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdfDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdfapplication/pdf1151034https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf0ea511108c079829d3d6bc222ae2d546MD52TEXTDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txtDissertação_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txtExtracted texttext/plain106418https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txt9bda4b20595f1c474a3b3d458ac9b1b7MD53icict/355822019-09-14 02:06:56.988oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-09-14T05:06:56Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
title Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
spellingShingle Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
Sobral, Mariana de Melo Rodrigues
Aeromonas spp
Genes de Virulência
Análise filogenética
Lagoa Rodrigo de Freitas
Aeromonas spp.
Virulence Genes
Phylogenetic Analysis
Rodrigo de Freitas Lagoon
Aeromonas
Genes
Filogenia
Análise
title_short Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
title_full Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
title_fullStr Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
title_full_unstemmed Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
title_sort Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas
author Sobral, Mariana de Melo Rodrigues
author_facet Sobral, Mariana de Melo Rodrigues
author_role author
dc.contributor.member.none.fl_str_mv Capasso, Ivano Rafaelle Victorio de Filippis
Freitas-Almeida, Angela Corrêa de
Silva, Ana Cristina Rivas da
dc.contributor.author.fl_str_mv Sobral, Mariana de Melo Rodrigues
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Clementino, Maysa Beatriz Mandetta
contributor_str_mv Clementino, Maysa Beatriz Mandetta
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Aeromonas spp
Genes de Virulência
Análise filogenética
Lagoa Rodrigo de Freitas
topic Aeromonas spp
Genes de Virulência
Análise filogenética
Lagoa Rodrigo de Freitas
Aeromonas spp.
Virulence Genes
Phylogenetic Analysis
Rodrigo de Freitas Lagoon
Aeromonas
Genes
Filogenia
Análise
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv Aeromonas spp.
Virulence Genes
Phylogenetic Analysis
Rodrigo de Freitas Lagoon
dc.subject.decs.pt_BR.fl_str_mv Aeromonas
Genes
Filogenia
Análise
description Aeromonas spp. são bactérias ubíquas que vem recebendo crescente atenção como patógenos humanos, devido sua ocorrência generalizada em alimentos, em processos infecciosos humanos e em ambientes aquáticos. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade taxonômica de Aeromonas spp. e a distribuição de genes associados a virulência nas águas da lagoa Rodrigo de Freitas, Rio de Janeiro, Brasil. Do total de 87 isolados identificados fenotipicamente como Aeromonas spp., 87% (76/87) foram confirmados como pertencentes a esse gênero pela PCR do gene rrs do 16S rRNA. A análise filogenética das sequencias dos genes rpoB/gyrB revelaram a presença de 3 grandes grupos, sendo grupo A (n=42), grupo B (n= 12) e grupo C (n=18). Os isolados dos três grupos alinharam com 98% a 100% com sequencias de referência de Aeromonas punctata/caviae, A. hydrofila e A. dahkensis, respectivamente. Foi identificada também uma cepa de A. jandaei e três de A. enteropelogenes. A pesquisa dos genes de virulência (atc, aerA, hlyA, asp e amp) resultou em 19 perfis de virulência com distribuição heterogênea entre os isolados, 14% (11/76) apresentaram os perfis XIV, XV, XVI, XVII e XVIII com 4 genes de virulência e 8% (6/76) apresentaram o perfil XIX que contém todos os genes investigados. Oitenta e seis por cento (65/76) e 94% (71/76) dos isolados também apresentaram atividade enzimática hemolítica e proteolítica, respectivamente. Nossos resultados indicaram que as espécies de Aeromonas na lagoa Rodrigo de Freitas são diversas e possuem um considerável potencial de virulência. Assim, a adoção de abordagem molecular na sua identificação faz-se necessária não só para o tratamento de pacientes, mas também para estudos ambientais como, o rastreamento de fontes e a associação com perfis de virulência e resistência aos antibióticos. Além disso, estes dados nos permitem sugerir a necessidade de investigações epidemiológicas mais aprofundadas desses patógenos em ambientes aquáticos no Rio de Janeiro.
publishDate 2018
dc.date.issued.fl_str_mv 2018
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-09-13T17:49:00Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-09-13T17:49:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SOBRAL, M. M. R. Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas. 2018. 65 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Vigilância Sanitária) – Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582
identifier_str_mv SOBRAL, M. M. R. Diversidade de Aeromonas spp. associadas a perfis de virulência nas águas da Lagoa Rodrigo de Freitas. 2018. 65 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Vigilância Sanitária) – Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35582
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/2/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35582/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Mariana_Melo_Rodrigues_Sobral.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
0ea511108c079829d3d6bc222ae2d546
9bda4b20595f1c474a3b3d458ac9b1b7
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1798324674366537728