Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Chilaúle, Jorfélia José
Data de Publicação: 2012
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/30991
Resumo: As gastroenterites virais estão entre as mais importantes causas de morbidade e mortalidade em crianças com menos de cinco anos de idade, principalmente nos países em desenvolvimento. Este estudo teve como objetivos i) descrever a frequência de detecção de rotavírus do grupo A (RV-A), norovírus (NoV) e astrovírus humanos (HAstV); ii) caracterizar molecularmente os RV-A. Para tal, foram coletadas 123 amostras fecais de crianças no Hospital Geral de Mavalane, cidade de Maputo, Moçambique, entre novembro 2011 e fevereiro de 2012. Os testes laboratoriais foram realizados no Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental (LVCA). O RV-A foi detectada por electroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) e ensaio imunoenzimático (EIE), enquanto NoV e HAstV foram detectadas por RT-PCR. A caracterização molecular de G-tipo dos RV-A foi realizado pelo sequenciamento da VP7 e P-tipo através de semi-nested PCR multiplex Todas crianças foram hospitalizadas com diarréia, entretanto, a maioria também apresentava outros quadros infecciosos (comorbidades), como a malária (23,6%), infecções respiratórias agudas (21,1%), HIV / SIDA (13,8%) e desnutrição protéico-calórica (30,1%). Os agentes virais foram detectados em 27 (22%) das crianças estudadas. RV-A, NoV e HAstV foram detectadas em 4 (3,3%), 13 (10,6%), e 10 (8,1%) crianças, respectivamente. Das treze amostras positivas para NoV, oito foram classificadas como sendo do genogrupo II (GII) e uma do genogrupo I (GI). Três amostras positivas para RV-A foram genotipadas, duas foram caracterizadas como G12P[6] e outra como G12P[8]. A alta frequência de comorbidades pode explicar a detecção relativamente baixa de agentes virais, especialmente RV-A. A presença de RV-A G12 em Moçambique ilustra a emergência deste genótipo, como observado em outros países. Este é o primeiro estudo que aborda a caracterização molecular de RV-A e a descrição da ocorrência de NoV e HAstV em Moçambique. Os resultados encontrados neste estudo demonstram a importância de se estabelecer uma vigilância ativa da síndrome diarréica no país.
id CRUZ_24e3fdc4f67915f842a2344918e47212
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/30991
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Chilaúle, Jorfélia JoséCarvalho-Costa, Filipe AnibalJani, Ileshi Vinodrai2019-01-11T17:01:26Z2019-01-11T17:01:26Z2012CHILAÚLE, Jorfélia José. Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique. 2012. 107 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2012.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/30991As gastroenterites virais estão entre as mais importantes causas de morbidade e mortalidade em crianças com menos de cinco anos de idade, principalmente nos países em desenvolvimento. Este estudo teve como objetivos i) descrever a frequência de detecção de rotavírus do grupo A (RV-A), norovírus (NoV) e astrovírus humanos (HAstV); ii) caracterizar molecularmente os RV-A. Para tal, foram coletadas 123 amostras fecais de crianças no Hospital Geral de Mavalane, cidade de Maputo, Moçambique, entre novembro 2011 e fevereiro de 2012. Os testes laboratoriais foram realizados no Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental (LVCA). O RV-A foi detectada por electroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) e ensaio imunoenzimático (EIE), enquanto NoV e HAstV foram detectadas por RT-PCR. A caracterização molecular de G-tipo dos RV-A foi realizado pelo sequenciamento da VP7 e P-tipo através de semi-nested PCR multiplex Todas crianças foram hospitalizadas com diarréia, entretanto, a maioria também apresentava outros quadros infecciosos (comorbidades), como a malária (23,6%), infecções respiratórias agudas (21,1%), HIV / SIDA (13,8%) e desnutrição protéico-calórica (30,1%). Os agentes virais foram detectados em 27 (22%) das crianças estudadas. RV-A, NoV e HAstV foram detectadas em 4 (3,3%), 13 (10,6%), e 10 (8,1%) crianças, respectivamente. Das treze amostras positivas para NoV, oito foram classificadas como sendo do genogrupo II (GII) e uma do genogrupo I (GI). Três amostras positivas para RV-A foram genotipadas, duas foram caracterizadas como G12P[6] e outra como G12P[8]. A alta frequência de comorbidades pode explicar a detecção relativamente baixa de agentes virais, especialmente RV-A. A presença de RV-A G12 em Moçambique ilustra a emergência deste genótipo, como observado em outros países. Este é o primeiro estudo que aborda a caracterização molecular de RV-A e a descrição da ocorrência de NoV e HAstV em Moçambique. Os resultados encontrados neste estudo demonstram a importância de se estabelecer uma vigilância ativa da síndrome diarréica no país.Viral gastroenteritis is considered one of the most important causes of morbidity and mortality in children under five years old, mainly in developing countries. This study aims to describe i) the frequency of rotavirus (RV-A), norovirus (NoV) and human astrovirus (AstV) and ii) molecular characterization of RV-A. Among 123 fecal samples of children hospitalized with diarrheal disease were collected at the Mavalane General Hospital, City of Maputo, Mozambique, between November 2011 and February 2012. Laboratory tests were performed at the Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental (LVCA). RV-A was detected by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and EIE while NoV and HAstV were detected by RT-PCR. The molecular characterization of G-type RV-A was performed by sequencing the VP7 and p-type through semi-nested nultiplex PCR Most of the children also had other infectious condictions (comorbidities) such as malaria (23.6%), acute respitratory infection (21.1%), HIV (13.8%) and protein-caloric malnutrition (30.1%). Viral agents were detected in 27 (22%) of children. RV-A, NoV and HAstV were detected in 4 (3.3%), 13 (10.6%), and 10 (8.2%) children, respectively. Of the thirteen samples positive for norovirus, eight belonged to genogroup II (GII) and one genogroup I (GI). Three RV-A-positive samples could be genotyped, two were characterized as G12P[6] and one as G12P[8]. The high frequency of comorbid conditions may explain the relatively low detection rate of viral agents, especially RV-A. In this context, in the studied setting, hospitalization for diarrheal disease seems to be part of a more complex clinical picture, with the primary diagnosis of acute gastroenteritis being less common. The presence of RV-A G12 in Mozambique illustrates the emergence of this genotype, as observed in other countries. This is the first study of RV-A molecular characterization and description of occurrence of norovirus and astrovirus in Mozambique. The results found in this study demonstrate the importance of active surveillance in this country.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porGastroenteriteInfecções por RotavirusComorbidadeCriança HospitalizadaDetecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambiqueinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2012Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Medicina Tropicalinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/30991/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALjorfelia_chilaule_ioc_mest_2012.pdfapplication/pdf1501999https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/30991/2/jorfelia_chilaule_ioc_mest_2012.pdf3281653d33837defdd8995c83180c323MD52TEXTjorfelia_chilaule_ioc_mest_2012.pdf.txtjorfelia_chilaule_ioc_mest_2012.pdf.txtExtracted texttext/plain194163https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/30991/3/jorfelia_chilaule_ioc_mest_2012.pdf.txt82234bc76e34677972f51fcddbcb87b6MD53icict/309912022-06-24 13:02:48.181oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-06-24T16:02:48Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
title Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
spellingShingle Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
Chilaúle, Jorfélia José
Gastroenterite
Infecções por Rotavirus
Comorbidade
Criança Hospitalizada
title_short Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
title_full Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
title_fullStr Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
title_full_unstemmed Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
title_sort Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique
author Chilaúle, Jorfélia José
author_facet Chilaúle, Jorfélia José
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Chilaúle, Jorfélia José
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Carvalho-Costa, Filipe Anibal
Jani, Ileshi Vinodrai
contributor_str_mv Carvalho-Costa, Filipe Anibal
Jani, Ileshi Vinodrai
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Gastroenterite
Infecções por Rotavirus
Comorbidade
Criança Hospitalizada
topic Gastroenterite
Infecções por Rotavirus
Comorbidade
Criança Hospitalizada
description As gastroenterites virais estão entre as mais importantes causas de morbidade e mortalidade em crianças com menos de cinco anos de idade, principalmente nos países em desenvolvimento. Este estudo teve como objetivos i) descrever a frequência de detecção de rotavírus do grupo A (RV-A), norovírus (NoV) e astrovírus humanos (HAstV); ii) caracterizar molecularmente os RV-A. Para tal, foram coletadas 123 amostras fecais de crianças no Hospital Geral de Mavalane, cidade de Maputo, Moçambique, entre novembro 2011 e fevereiro de 2012. Os testes laboratoriais foram realizados no Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental (LVCA). O RV-A foi detectada por electroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) e ensaio imunoenzimático (EIE), enquanto NoV e HAstV foram detectadas por RT-PCR. A caracterização molecular de G-tipo dos RV-A foi realizado pelo sequenciamento da VP7 e P-tipo através de semi-nested PCR multiplex Todas crianças foram hospitalizadas com diarréia, entretanto, a maioria também apresentava outros quadros infecciosos (comorbidades), como a malária (23,6%), infecções respiratórias agudas (21,1%), HIV / SIDA (13,8%) e desnutrição protéico-calórica (30,1%). Os agentes virais foram detectados em 27 (22%) das crianças estudadas. RV-A, NoV e HAstV foram detectadas em 4 (3,3%), 13 (10,6%), e 10 (8,1%) crianças, respectivamente. Das treze amostras positivas para NoV, oito foram classificadas como sendo do genogrupo II (GII) e uma do genogrupo I (GI). Três amostras positivas para RV-A foram genotipadas, duas foram caracterizadas como G12P[6] e outra como G12P[8]. A alta frequência de comorbidades pode explicar a detecção relativamente baixa de agentes virais, especialmente RV-A. A presença de RV-A G12 em Moçambique ilustra a emergência deste genótipo, como observado em outros países. Este é o primeiro estudo que aborda a caracterização molecular de RV-A e a descrição da ocorrência de NoV e HAstV em Moçambique. Os resultados encontrados neste estudo demonstram a importância de se estabelecer uma vigilância ativa da síndrome diarréica no país.
publishDate 2012
dc.date.issued.fl_str_mv 2012
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-01-11T17:01:26Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-01-11T17:01:26Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv CHILAÚLE, Jorfélia José. Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique. 2012. 107 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2012.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/30991
identifier_str_mv CHILAÚLE, Jorfélia José. Detecção de vírus gastroentéricos e caracterização molecular dos rotavírus em crianças hospitalizadas com diarreia aguda e comorbidades na cidade de Maputo, Moçambique. 2012. 107 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2012.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/30991
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/30991/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/30991/2/jorfelia_chilaule_ioc_mest_2012.pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/30991/3/jorfelia_chilaule_ioc_mest_2012.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
3281653d33837defdd8995c83180c323
82234bc76e34677972f51fcddbcb87b6
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1798324933704548352