Aspectos metodológicos no reuso de ontologias: um estudo a partir das anotações genômicas no domínio dos tripanosomatídeos
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Data de Publicação: | 2009 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/17459 |
Resumo: | Nos últimos anos tem havido um impulso no número de ontologias produzidas, refletindo um contínuo amadurecimento dos esforços de desenvolvimento de vocabulários, em especial na área de Biomedicina, caracterizada como um domínio inter e multidisciplinar e de temática complexa. Entretanto, apesar de haver propostas metodológicas e de melhores práticas sobre como organizar a estrutura terminológica de ontologias e de suas relações, pouco se explica sobre os métodos adotados para o levantamento terminológico do seu domínio e da delimitação de seu escopo, especialmente considerando o reuso de ontologias. O objetivo desse trabalho é apresentar as bases da Ciência da Informação e da Computação para atividades de reuso em ontologias, como um passo metodológico para a aquisição de conhecimento, visando possibilitar mecanismos para o mapeamento e alinhamento de termos em ontologias no domínio dos Tripanosomatídeos. |
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Entretanto, apesar de haver propostas metodológicas e de melhores práticas sobre como organizar a estrutura terminológica de ontologias e de suas relações, pouco se explica sobre os métodos adotados para o levantamento terminológico do seu domínio e da delimitação de seu escopo, especialmente considerando o reuso de ontologias. O objetivo desse trabalho é apresentar as bases da Ciência da Informação e da Computação para atividades de reuso em ontologias, como um passo metodológico para a aquisição de conhecimento, visando possibilitar mecanismos para o mapeamento e alinhamento de termos em ontologias no domínio dos Tripanosomatídeos.In the last years ontology development has grown considerably, suggesting the maturing of the efforts towards the development of standard vocabularies, specially in Biomedicine, which can be considered as a complex inter and multidisciplinary domain. However, despite the existence of many methodological approaches and best practices to guide the structuring of the ontology hierarchy and its relations, not much is explained about the methods and techniques used to analyze the domain in order to obtain a list of its relevant concepts and to establish its scope, specially if ontology reuse is desired. In this sense, our goal is to present the contributions of Information Science and Computer Science that can be applied to ontology reuse, as a methodological step towards knowledge acquisition. On doing so, we hope to contribute to the enhancement of ontology aligning and mapping mechanisms in the domain of Trypanosomatids.Universidade Federal Fluminense. Instituto de Artes e Comunicação Social. Niterói, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Matemática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal Fluminense. Niterói, RJ, Brasil.Universidade Federal Fluminense. Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Niterói, RJ, Brasil.Universidade Federal Fluminense. Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Niterói, RJ, Brasil.porFundação Oswaldo Cruz. Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde.Reuso de OntologiaAlinhamento de OntologiaCompatibilização de LinguagemTripanosomatídeosAquisição de ConhecimentoOntology ReuseOntology AlignmentLanguage CompatibilityTrypanosomatidsKnowledge AcquisitionAspectos metodológicos no reuso de ontologias: um estudo a partir das anotações genômicas no domínio dos tripanosomatídeosMethodological aspects concerning the reuse of ontologies: a study based on genomic annotations in the domain of trypanosomatidesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/17459/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINAL6.pdfVersão Portuguêsapplication/pdf273511https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/17459/2/6.pdfb93e7740865bf48ad1621c97fd93cd47MD52ve_Maria_Luiza_de_Almeida_Campos_etal_2009_en.pdfve_Maria_Luiza_de_Almeida_Campos_etal_2009_en.pdfVersão Inglêsapplication/pdf268671https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/17459/4/ve_Maria_Luiza_de_Almeida_Campos_etal_2009_en.pdfac4ae661c4e5b877d36604eb97b78409MD54TEXT6.pdf.txt6.pdf.txtExtracted texttext/plain61219https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/17459/3/6.pdf.txtfebd11758f01b9c2cf1dbac9e9d26ab8MD53ve_Maria_Luiza_de_Almeida_Campos_etal_2009_en.pdf.txtve_Maria_Luiza_de_Almeida_Campos_etal_2009_en.pdf.txtExtracted texttext/plain59593https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/17459/5/ve_Maria_Luiza_de_Almeida_Campos_etal_2009_en.pdf.txta7992cb42fda0b03881936b7f9f87befMD55icict/174592022-06-24 12:59:53.851oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-06-24T15:59:53Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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