Methodological aspects concerning the reuse of ontologies: a study based on genomic annotations in the domain of trypanosomatides
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Data de Publicação: | 2009 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por eng |
Título da fonte: | RECIIS (Online) |
Texto Completo: | https://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/820 |
Resumo: | In the last years ontology development has grown considerably, suggesting the maturing of the efforts towards the development of standard vocabularies, specially in Biomedicine, which can be considered as a complex inter and multidisciplinary domain. However, despite the existence of many methodological approaches and best practices to guide the structuring of the ontology hierarchy and its relations, not much is explained about the methods and techniques used to analyze the domain in order to obtain a list of its relevant concepts and to establish its scope, specially if ontology reuse is desired. In this sense, our goal is to present the contributions of Information Science and Computer Science that can be applied to ontology reuse, as a methodological step towards knowledge acquisition. On doing so, we hope to contribute to the enhancement of ontology aligning and mapping mechanisms in the domain of Trypanosomatids. |
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Methodological aspects concerning the reuse of ontologies: a study based on genomic annotations in the domain of trypanosomatidesAspectos metodológicos no reuso de ontologias: um estudo a partir das anotações genômicas no domínio dos tripanosomatídeosOntology reuseontology alignmentlanguage compatibilityTrypanosomatidsknowledge acquisitionreuso de ontologiaalinhamento de ontologiacompatibilização de linguagemtripanosomatídeosaquisição de conhecimentoIn the last years ontology development has grown considerably, suggesting the maturing of the efforts towards the development of standard vocabularies, specially in Biomedicine, which can be considered as a complex inter and multidisciplinary domain. However, despite the existence of many methodological approaches and best practices to guide the structuring of the ontology hierarchy and its relations, not much is explained about the methods and techniques used to analyze the domain in order to obtain a list of its relevant concepts and to establish its scope, specially if ontology reuse is desired. In this sense, our goal is to present the contributions of Information Science and Computer Science that can be applied to ontology reuse, as a methodological step towards knowledge acquisition. On doing so, we hope to contribute to the enhancement of ontology aligning and mapping mechanisms in the domain of Trypanosomatids.Nos últimos anos tem havido um impulso no número de ontologias produzidas, refletindo um contínuo amadurecimento dos esforços de desenvolvimento de vocabulários, em especial na área de Biomedicina, caracterizada como um domínio inter e multidisciplinar e de temática complexa. Entretanto, apesar de haver propostas metodológicas e de melhores práticas sobre como organizar a estrutura terminológica de ontologias e de suas relações, pouco se explica sobre os métodos adotados para o levantamento terminológico do seu domínio e da delimitação de seu escopo, especialmente considerando o reuso de ontologias. O objetivo desse trabalho é apresentar as bases da Ciência da Informação e da Computação para atividades de reuso em ontologias, como um passo metodológico para a aquisição de conhecimento, visando possibilitar mecanismos para o mapeamento e alinhamento de termos em ontologias no domínio dos Tripanosomatídeos.Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde (Icict/Fiocruz)2009-03-30info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionAvaliado pelos paresapplication/pdfapplication/pdfhttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/82010.3395/reciis.v3i1.820Revista Eletrônica de Comunicação, Informação & Inovação em Saúde; Vol. 3 No. 1 (2009): Temático | Ontologias, web semântica e saúdeRevista Eletrônica de Comunicação, Informação e Inovação em Saúde; Vol. 3 Núm. 1 (2009): Temático | Ontologias, web semântica e saúdeRevue de la Communication, de l'Information et de l'Innovation en santé; Vol. 3 No 1 (2009): Temático | Ontologias, web semântica e saúdeRevista Eletrônica de Comunicação, Informação & Inovação em Saúde; v. 3 n. 1 (2009): Temático | Ontologias, web semântica e saúde1981-6278reponame:RECIIS (Online)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZporenghttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/820/1462https://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/820/1696Campos, Maria Luiza de AlmeidaCampos, Maria Luiza MachadoDávila, Alberto M. R.Gomes, Hagar EspanhaCampos, Linair MariaLira, Laurainfo:eu-repo/semantics/openAccess2022-08-11T14:24:54Zoai:www.reciis.icict.fiocruz.br:article/820Revistahttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciishttps://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/oaireciis@icict.fiocruz.br1981-62781981-6278opendoar:2022-08-11T14:24:54RECIIS (Online) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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