Avaliação influência do tratamento diretamente observado (DOT) com e sem profilaxia na transmissão da tuberculose em centros médicos de saúde do município do Rio de Janeiro, utilizando técnicas de tipagem molecular em cepas de M. tuberculosis

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Baptista, Ida Maria Foschiani Dias
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35567
Resumo: Tuberculose (TB) é a principal causa de morbidade e de mortalidade em todo o mundo, particularmente em países em desenvolvimento. Na cidade de Rio de Janeiro, 7.000 casos novos de TB são relatados anualmente, para uma incidência de 105 por 100.000 habitantes. Em três centros de saúde comunitários (CHCs) da área de planejamento 1 (AP-1.0) do município do Rio de Janeiro (área da cidade com taxa a mais elevada de TB), uma avaliação da influência do tratamento diretamente observado (DOT) sem ou com profilaxia (DOT-A) para contatos de risco foi realizada; os contatos do último grupo foram avaliados também ativamente para TB ativa ou latente. Para esta finalidade, quatro comunidades receberam o tratamento DOT enquanto outras quatro comunidades receberam DOT-A. Um estudo nessas comunidades foi realizado durante o período 2001 2004 e recebemos os isolados de 353 pacientes, distribuídos igualmente entre as vizinhanças com os dois grupos de tratamento (DOT e DOT-A) Os dados bacteriológicos, clínicos e epidemiológicos foram coletados e os genótipos de Mycobacterium tuberculosis definidos com MIRU-VNTR, \201Cspoligotyping\201D e RFLP-IS6110. Também, o uso da sonda do lado direito e esquerdo do sítio de restrição da PvuII na IS6110 foi avaliado. Todas as amostras foram genotipadas por ambos os métodos de PCR, enquanto uma grande fração das amostras de 2001 foi submetida a RFLP-IS6110. Os resultados dos agrupamentos entre os três métodos foram comparados e as taxas de \201Ccluster\201D foram, respectivamente, 20%, 29% e 72% para RFLP-IS6110, MIRU-VNTR e \201Cspoligotyping\201D. A combinação de MIRU-VNTR e \201Cspoligotyping\201D para a definição dos genótipos reduziu o número de \201Cclusters\201D para 7.8% e os dados iniciais obtidos que sugerem que os \201Cclusters\201D formados por RFLP-IS6110 foram respeitados por MIRU-VNTR. Entretanto, a tipagem por RFLP-IS6110 deve ser realizada em todos os isolados para se ter uma comparação mais sólida desta técnica com MIRU-VNTR e \201Cspoligotyping\201D. O maior \201Ccluster\201D obtido por MIRU-VNTR foi observado somente nas amostras de 2001 e podemos sugerir uma epidemia local temporária A determinação dos fatores de risco para TB foi avaliada pela associação da formação de \201Cclusters\201D dos isolados com transmissão recente da TB entre os pacientes. Isto foi realizado para os três métodos de genotipagem e para MIRU-VNTR e \201Cspoligotyping\201D combinado. O único fator de risco que foi relacionado consistentemente com transmissão recente foi estar infectado com um isolado resistente ou multidroga resistente. Nenhuma diferença nas taxas de agrupamento foi observada entre os dois grupos de tratamento DOT que sugerem a ausência de associação entre genótipos em \201Ccluster\201D e a transmissão recente de TB ou a falta da influência dos procedimentos adicionais inerentes a DOT-A com relação ao DOT na transmissão de TB na população investigada. Abordagens adicionais da análise de dados devem, entretanto ser realizadas e estão em andamento.
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spelling Baptista, Ida Maria Foschiani DiasSuffys, Philip Noel2019-09-12T19:22:23Z2019-09-12T19:22:23Z2006BAPTISTA, Ida Maria Foschiani Dias. Avaliação influência do tratamento diretamente observado (DOT) com e sem profilaxia na transmissão da tuberculose em centros médicos de saúde do município do Rio de Janeiro, utilizando técnicas de tipagem molecular em cepas de M. tuberculosis. 2006. 202 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular)-Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2006.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35567Tuberculose (TB) é a principal causa de morbidade e de mortalidade em todo o mundo, particularmente em países em desenvolvimento. Na cidade de Rio de Janeiro, 7.000 casos novos de TB são relatados anualmente, para uma incidência de 105 por 100.000 habitantes. Em três centros de saúde comunitários (CHCs) da área de planejamento 1 (AP-1.0) do município do Rio de Janeiro (área da cidade com taxa a mais elevada de TB), uma avaliação da influência do tratamento diretamente observado (DOT) sem ou com profilaxia (DOT-A) para contatos de risco foi realizada; os contatos do último grupo foram avaliados também ativamente para TB ativa ou latente. Para esta finalidade, quatro comunidades receberam o tratamento DOT enquanto outras quatro comunidades receberam DOT-A. Um estudo nessas comunidades foi realizado durante o período 2001 2004 e recebemos os isolados de 353 pacientes, distribuídos igualmente entre as vizinhanças com os dois grupos de tratamento (DOT e DOT-A) Os dados bacteriológicos, clínicos e epidemiológicos foram coletados e os genótipos de Mycobacterium tuberculosis definidos com MIRU-VNTR, \201Cspoligotyping\201D e RFLP-IS6110. Também, o uso da sonda do lado direito e esquerdo do sítio de restrição da PvuII na IS6110 foi avaliado. 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Abordagens adicionais da análise de dados devem, entretanto ser realizadas e estão em andamento.The Tuberculosis (TB) is a serious problem of world-wide public health, particularly in the developing countries. In the city of Rio de Janeiro, 7,000 new TB cases are reported annually, for an incidence de 105 per 100,000 inhabitants. In three Community Health Centers (CHCs) of Planning Area 1 (AP-1.0) of Rio de Janeiro, the section of the city with the highest case rate of TB, an evaluation of the influence of directly observed treatment (DOT) without or with (DOT-A) prophylaxis of risk contacts was performed; contacts of the latter group were also actively evaluated for active or latent TB. For this purpose, four communities received the DOT regimen while other four communities received DOT-A. A prospective community-based study was performed during the period 2001 to 2004 and we received strains of 353 patients, equally distributed among the neighborhoods with the two DOT schemes. Bacteriological, clinical and epidemiological data were collected and Mycobacterium tuberculosis genotypes defined through MIRU-VNTR (mycobacterial interspersed repetitive units - variable number tandem repeats) typing, spoligotyping and IS6110 restriction fragment length polymorphism (IS6110-RFLP). Also, the use of the left-hand side probe and a right-hand side probe of the PvuII site in the IS6110 was evaluated. All samples were typed by both PCR typing methods while a large fraction of the 2001 samples was submitted to IS6110-RFLP. Clustering results between the three methods were compared and cluster rates were, respectively, 20%, 29% and 72 % for IS6110-RFLP, MIRU-VNTR typing and spoligotyping. The combination of MIRU-VNTR and spoligotyping techniques for the definition of genotypes reduced the number of clusters to 7.8% and initial data were obtained suggesting that clusters formed by IS6110-RFLP are respected by MIRU-VNTR. However, IS6110-RFLP typing should be performed of all isolates to have a more solid comparison of this technique with MIRU-VNTR and spoligotyping. The biggest cluster obtained with MIRU-VNTR was only observed in 2001 and could suggest a local temporary outbreak. Risk factor determination for TB was evaluated through association of cluster formation of isolates with recent transmission of TB between patients. This was performed for the three typing methods and for the combined MIRU-VNTR and spoligotyping procedure. The only risk factor that was consistently related with recent transmission was being infected with a resistant or multi-drug resistant strain. No difference in clustering rates was observed between the two DOT procedures suggesting either the absence of association between clustering of genotypes and recent transmission of TB or the lack of influence of the additional procedures inherent to DOT-A in relation to DOT on TB transmission in the investigated population. Additional approaches of data analysis should however be performed and are underway.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porMycobacterium tuberculosisTuberculosePolimorfismo de Fragmento de RestriçãoAvaliação influência do tratamento diretamente observado (DOT) com e sem profilaxia na transmissão da tuberculose em centros médicos de saúde do município do Rio de Janeiro, utilizando técnicas de tipagem molecular em cepas de M. tuberculosisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2006Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de Janeiro,Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecularinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35567/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALida_baptista_ioc_dout_2006.pdfapplication/pdf2585789https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35567/2/ida_baptista_ioc_dout_2006.pdf67d4dfa5748701a8a3a8634e49b5935aMD52TEXTida_baptista_ioc_dout_2006.pdf.txtida_baptista_ioc_dout_2006.pdf.txtExtracted texttext/plain260595https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35567/3/ida_baptista_ioc_dout_2006.pdf.txta1af1151a765ecbcd32017bbdfe18276MD53icict/355672019-09-13 20:05:43.411oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-09-13T23:05:43Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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