Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Mendes, Joycenea Matsuda
Data de Publicação: 2008
Outros Autores: Machado, Silvia Maria Almeida, Lourenço, Maria Cristina da Silva, Ferreira, Rosa Maria Carvalho, Fonseca, Leila de Souza, Saad, Maria Helena Feres
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/1929
Resumo: Este estudo retrospectivo envolvendo polimorfismo de fragmento de restrição e utilizando como marcador a seqüência de inserção 6110, foi realizado para fornecer informações iniciais quanto à diversidade genética das cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas em favelas do Complexo de Manguinhos, na cidade do Rio de Janeiro. Das 67 cepas isoladas, 23 (34,3%) foram agrupadas em clusters (total de clusters, 10). A transmissão entre comunicantes domiciliares e extra-domicialiares estave associada a 20% e 60% dos clusters, respectivamente. Ser morador do Conjunto Habitacional Programado 2 foi associado à presença de clusters. Embora não significativo, é relevante o fato de que 26% das cepas em cluster apresentaram resistência primária. Estes achados, embora possivelmente subestimados devido à impossibilidade de analisar todas as cepas, fornecem subsídios para a melhoria do programa local de controle da tuberculose.
id CRUZ_83c2235a5399922ae6f0015c2c3d7e6d
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/1929
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Mendes, Joycenea MatsudaMachado, Silvia Maria AlmeidaLourenço, Maria Cristina da SilvaFerreira, Rosa Maria CarvalhoFonseca, Leila de SouzaSaad, Maria Helena Feres2011-04-21T15:42:50Z2011-04-21T15:42:50Z2008MENDES, Joycenea Matsuda et al. Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil. Jornal Brasileiro de Pneumologia, v. 34, n. 12, p. 1063-1068, 2008.1806-3713https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/192910.1590/S1806-37132008001200012Este estudo retrospectivo envolvendo polimorfismo de fragmento de restrição e utilizando como marcador a seqüência de inserção 6110, foi realizado para fornecer informações iniciais quanto à diversidade genética das cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas em favelas do Complexo de Manguinhos, na cidade do Rio de Janeiro. Das 67 cepas isoladas, 23 (34,3%) foram agrupadas em clusters (total de clusters, 10). A transmissão entre comunicantes domiciliares e extra-domicialiares estave associada a 20% e 60% dos clusters, respectivamente. Ser morador do Conjunto Habitacional Programado 2 foi associado à presença de clusters. Embora não significativo, é relevante o fato de que 26% das cepas em cluster apresentaram resistência primária. Estes achados, embora possivelmente subestimados devido à impossibilidade de analisar todas as cepas, fornecem subsídios para a melhoria do programa local de controle da tuberculose.This retrospective molecular study involving restriction fragment length polymorphism, using insertion sequence 6110 as a marker, was conducted in order to provide an initial insight into the genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in the slums of the Complexo de Manguinhos, located in the city of Rio de Janeiro, Brazil. Of the 67 strains evaluated, 23 (34.3%) were found to belong to clusters (total clusters, 10). Household and social chains of transmission were associated with clustering, in 20% and 60%, respectively. Living in the Conjunto Habitacional Programado 2 slum was associated with clustering. Although not significant, it is relevant that 26% of the clustered strains presented primary resistance. These findings, although possibly underestimating the prevalence due to the failure to analyze all strains, could help improve the local tuberculosis control program.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Leônidas & Maria Deane. Manaus, AM, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratory of Cellular Microbiology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Department of Bacteriology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Department of Bacteriology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Laboratory of Mycobacteriology. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratory of Cellular Microbiology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.engTuberculoseEpidemiologia molecularMycobacterium tuberculosis/transmissãoPolimorfismo de Fragmento de RestriçãoTuberculosisEpidemiologymolecularMycobacterium tuberculosis/transmissionPolymorphism, Restriction Fragment LengthMolecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, BrazilDiversidade molecular de cepas de Mycobacterium tuberculosis em uma região de favela da cidade do Rio de Janeiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALMolecular diversity of Mycobacterium.pdfMolecular diversity of Mycobacterium.pdfapplication/pdf139891https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/1/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdfaa85fa7efa7a4fa70e4ee67bff8eab2cMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81648https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/2/license.txte095249ac7cacefbfe39684dfe45e706MD52TEXTMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.txtMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.txtExtracted texttext/plain27420https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/5/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.txt1b92cc68987e70f9efe1c1e1e8bd554aMD55THUMBNAILMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.jpgMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1885https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/4/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.jpgdcf6191b5feb4122b7ae3eaf7e1586bfMD54icict/19292023-02-11 15:54:16.531oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-02-11T18:54:16Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Diversidade molecular de cepas de Mycobacterium tuberculosis em uma região de favela da cidade do Rio de Janeiro
title Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
spellingShingle Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
Mendes, Joycenea Matsuda
Tuberculose
Epidemiologia molecular
Mycobacterium tuberculosis/transmissão
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
Tuberculosis
Epidemiology
molecular
Mycobacterium tuberculosis/transmission
Polymorphism, Restriction Fragment Length
title_short Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
title_full Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
title_fullStr Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
title_full_unstemmed Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
title_sort Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
author Mendes, Joycenea Matsuda
author_facet Mendes, Joycenea Matsuda
Machado, Silvia Maria Almeida
Lourenço, Maria Cristina da Silva
Ferreira, Rosa Maria Carvalho
Fonseca, Leila de Souza
Saad, Maria Helena Feres
author_role author
author2 Machado, Silvia Maria Almeida
Lourenço, Maria Cristina da Silva
Ferreira, Rosa Maria Carvalho
Fonseca, Leila de Souza
Saad, Maria Helena Feres
author2_role author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Mendes, Joycenea Matsuda
Machado, Silvia Maria Almeida
Lourenço, Maria Cristina da Silva
Ferreira, Rosa Maria Carvalho
Fonseca, Leila de Souza
Saad, Maria Helena Feres
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Tuberculose
Epidemiologia molecular
Mycobacterium tuberculosis/transmissão
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
topic Tuberculose
Epidemiologia molecular
Mycobacterium tuberculosis/transmissão
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
Tuberculosis
Epidemiology
molecular
Mycobacterium tuberculosis/transmission
Polymorphism, Restriction Fragment Length
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv Tuberculosis
Epidemiology
molecular
Mycobacterium tuberculosis/transmission
Polymorphism, Restriction Fragment Length
description Este estudo retrospectivo envolvendo polimorfismo de fragmento de restrição e utilizando como marcador a seqüência de inserção 6110, foi realizado para fornecer informações iniciais quanto à diversidade genética das cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas em favelas do Complexo de Manguinhos, na cidade do Rio de Janeiro. Das 67 cepas isoladas, 23 (34,3%) foram agrupadas em clusters (total de clusters, 10). A transmissão entre comunicantes domiciliares e extra-domicialiares estave associada a 20% e 60% dos clusters, respectivamente. Ser morador do Conjunto Habitacional Programado 2 foi associado à presença de clusters. Embora não significativo, é relevante o fato de que 26% das cepas em cluster apresentaram resistência primária. Estes achados, embora possivelmente subestimados devido à impossibilidade de analisar todas as cepas, fornecem subsídios para a melhoria do programa local de controle da tuberculose.
publishDate 2008
dc.date.issued.fl_str_mv 2008
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2011-04-21T15:42:50Z
dc.date.available.fl_str_mv 2011-04-21T15:42:50Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv MENDES, Joycenea Matsuda et al. Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil. Jornal Brasileiro de Pneumologia, v. 34, n. 12, p. 1063-1068, 2008.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/1929
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 1806-3713
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.1590/S1806-37132008001200012
identifier_str_mv MENDES, Joycenea Matsuda et al. Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil. Jornal Brasileiro de Pneumologia, v. 34, n. 12, p. 1063-1068, 2008.
1806-3713
10.1590/S1806-37132008001200012
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/1929
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/1/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/2/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/5/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/4/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv aa85fa7efa7a4fa70e4ee67bff8eab2c
e095249ac7cacefbfe39684dfe45e706
1b92cc68987e70f9efe1c1e1e8bd554a
dcf6191b5feb4122b7ae3eaf7e1586bf
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1813008844593299456