Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2008 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/1929 |
Resumo: | Este estudo retrospectivo envolvendo polimorfismo de fragmento de restrição e utilizando como marcador a seqüência de inserção 6110, foi realizado para fornecer informações iniciais quanto à diversidade genética das cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas em favelas do Complexo de Manguinhos, na cidade do Rio de Janeiro. Das 67 cepas isoladas, 23 (34,3%) foram agrupadas em clusters (total de clusters, 10). A transmissão entre comunicantes domiciliares e extra-domicialiares estave associada a 20% e 60% dos clusters, respectivamente. Ser morador do Conjunto Habitacional Programado 2 foi associado à presença de clusters. Embora não significativo, é relevante o fato de que 26% das cepas em cluster apresentaram resistência primária. Estes achados, embora possivelmente subestimados devido à impossibilidade de analisar todas as cepas, fornecem subsídios para a melhoria do programa local de controle da tuberculose. |
id |
CRUZ_83c2235a5399922ae6f0015c2c3d7e6d |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.arca.fiocruz.br:icict/1929 |
network_acronym_str |
CRUZ |
network_name_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
repository_id_str |
2135 |
spelling |
Mendes, Joycenea MatsudaMachado, Silvia Maria AlmeidaLourenço, Maria Cristina da SilvaFerreira, Rosa Maria CarvalhoFonseca, Leila de SouzaSaad, Maria Helena Feres2011-04-21T15:42:50Z2011-04-21T15:42:50Z2008MENDES, Joycenea Matsuda et al. Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil. Jornal Brasileiro de Pneumologia, v. 34, n. 12, p. 1063-1068, 2008.1806-3713https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/192910.1590/S1806-37132008001200012Este estudo retrospectivo envolvendo polimorfismo de fragmento de restrição e utilizando como marcador a seqüência de inserção 6110, foi realizado para fornecer informações iniciais quanto à diversidade genética das cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas em favelas do Complexo de Manguinhos, na cidade do Rio de Janeiro. Das 67 cepas isoladas, 23 (34,3%) foram agrupadas em clusters (total de clusters, 10). A transmissão entre comunicantes domiciliares e extra-domicialiares estave associada a 20% e 60% dos clusters, respectivamente. Ser morador do Conjunto Habitacional Programado 2 foi associado à presença de clusters. Embora não significativo, é relevante o fato de que 26% das cepas em cluster apresentaram resistência primária. Estes achados, embora possivelmente subestimados devido à impossibilidade de analisar todas as cepas, fornecem subsídios para a melhoria do programa local de controle da tuberculose.This retrospective molecular study involving restriction fragment length polymorphism, using insertion sequence 6110 as a marker, was conducted in order to provide an initial insight into the genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in the slums of the Complexo de Manguinhos, located in the city of Rio de Janeiro, Brazil. Of the 67 strains evaluated, 23 (34.3%) were found to belong to clusters (total clusters, 10). Household and social chains of transmission were associated with clustering, in 20% and 60%, respectively. Living in the Conjunto Habitacional Programado 2 slum was associated with clustering. Although not significant, it is relevant that 26% of the clustered strains presented primary resistance. These findings, although possibly underestimating the prevalence due to the failure to analyze all strains, could help improve the local tuberculosis control program.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Leônidas & Maria Deane. Manaus, AM, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratory of Cellular Microbiology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Department of Bacteriology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Department of Bacteriology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Laboratory of Mycobacteriology. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratory of Cellular Microbiology. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.engTuberculoseEpidemiologia molecularMycobacterium tuberculosis/transmissãoPolimorfismo de Fragmento de RestriçãoTuberculosisEpidemiologymolecularMycobacterium tuberculosis/transmissionPolymorphism, Restriction Fragment LengthMolecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, BrazilDiversidade molecular de cepas de Mycobacterium tuberculosis em uma região de favela da cidade do Rio de Janeiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALMolecular diversity of Mycobacterium.pdfMolecular diversity of Mycobacterium.pdfapplication/pdf139891https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/1/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdfaa85fa7efa7a4fa70e4ee67bff8eab2cMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81648https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/2/license.txte095249ac7cacefbfe39684dfe45e706MD52TEXTMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.txtMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.txtExtracted texttext/plain27420https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/5/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.txt1b92cc68987e70f9efe1c1e1e8bd554aMD55THUMBNAILMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.jpgMolecular diversity of Mycobacterium.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1885https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/4/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.jpgdcf6191b5feb4122b7ae3eaf7e1586bfMD54icict/19292023-02-11 15:54:16.531oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-02-11T18:54:16Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil |
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv |
Diversidade molecular de cepas de Mycobacterium tuberculosis em uma região de favela da cidade do Rio de Janeiro |
title |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil |
spellingShingle |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil Mendes, Joycenea Matsuda Tuberculose Epidemiologia molecular Mycobacterium tuberculosis/transmissão Polimorfismo de Fragmento de Restrição Tuberculosis Epidemiology molecular Mycobacterium tuberculosis/transmission Polymorphism, Restriction Fragment Length |
title_short |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil |
title_full |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil |
title_fullStr |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil |
title_full_unstemmed |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil |
title_sort |
Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil |
author |
Mendes, Joycenea Matsuda |
author_facet |
Mendes, Joycenea Matsuda Machado, Silvia Maria Almeida Lourenço, Maria Cristina da Silva Ferreira, Rosa Maria Carvalho Fonseca, Leila de Souza Saad, Maria Helena Feres |
author_role |
author |
author2 |
Machado, Silvia Maria Almeida Lourenço, Maria Cristina da Silva Ferreira, Rosa Maria Carvalho Fonseca, Leila de Souza Saad, Maria Helena Feres |
author2_role |
author author author author author |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Mendes, Joycenea Matsuda Machado, Silvia Maria Almeida Lourenço, Maria Cristina da Silva Ferreira, Rosa Maria Carvalho Fonseca, Leila de Souza Saad, Maria Helena Feres |
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv |
Tuberculose Epidemiologia molecular Mycobacterium tuberculosis/transmissão Polimorfismo de Fragmento de Restrição |
topic |
Tuberculose Epidemiologia molecular Mycobacterium tuberculosis/transmissão Polimorfismo de Fragmento de Restrição Tuberculosis Epidemiology molecular Mycobacterium tuberculosis/transmission Polymorphism, Restriction Fragment Length |
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv |
Tuberculosis Epidemiology molecular Mycobacterium tuberculosis/transmission Polymorphism, Restriction Fragment Length |
description |
Este estudo retrospectivo envolvendo polimorfismo de fragmento de restrição e utilizando como marcador a seqüência de inserção 6110, foi realizado para fornecer informações iniciais quanto à diversidade genética das cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas em favelas do Complexo de Manguinhos, na cidade do Rio de Janeiro. Das 67 cepas isoladas, 23 (34,3%) foram agrupadas em clusters (total de clusters, 10). A transmissão entre comunicantes domiciliares e extra-domicialiares estave associada a 20% e 60% dos clusters, respectivamente. Ser morador do Conjunto Habitacional Programado 2 foi associado à presença de clusters. Embora não significativo, é relevante o fato de que 26% das cepas em cluster apresentaram resistência primária. Estes achados, embora possivelmente subestimados devido à impossibilidade de analisar todas as cepas, fornecem subsídios para a melhoria do programa local de controle da tuberculose. |
publishDate |
2008 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2008 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2011-04-21T15:42:50Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2011-04-21T15:42:50Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
MENDES, Joycenea Matsuda et al. Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil. Jornal Brasileiro de Pneumologia, v. 34, n. 12, p. 1063-1068, 2008. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/1929 |
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv |
1806-3713 |
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv |
10.1590/S1806-37132008001200012 |
identifier_str_mv |
MENDES, Joycenea Matsuda et al. Molecular diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in a slum area of Rio de Janeiro, Brazil. Jornal Brasileiro de Pneumologia, v. 34, n. 12, p. 1063-1068, 2008. 1806-3713 10.1590/S1806-37132008001200012 |
url |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/1929 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) instacron:FIOCRUZ |
instname_str |
Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
instacron_str |
FIOCRUZ |
institution |
FIOCRUZ |
reponame_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
collection |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/1/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/2/license.txt https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/5/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.txt https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/1929/4/Molecular%20diversity%20of%20Mycobacterium.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
aa85fa7efa7a4fa70e4ee67bff8eab2c e095249ac7cacefbfe39684dfe45e706 1b92cc68987e70f9efe1c1e1e8bd554a dcf6191b5feb4122b7ae3eaf7e1586bf |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.arca@fiocruz.br |
_version_ |
1813008844593299456 |