Diversidade genética de isolados de Trypanosoma cruzi DTU I obtidos de mamíferos silvestres e triatomíneos de biomas brasileiros, avaliada por genes variáveis e constitutivos
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/27445 |
Resumo: | Trypanosoma cruzi, parasita hemoflagelado, é geneticamente heterogêneo e atualmente representado por seis linhagens (Discrete Typing Units, DTUs) designados TcI-TcVI. TcI é a DTU mais amplamente distribuída e é capaz de infectar centenas de espécies de mamíferos em todos os estratos florestais. Embora várias investigações sobre a diversidade genética e distribuição de genótipos de TcI tenham sido realizadas no norte de América do Sul, pouco se sabe sobre essa diversidade no Brasil. Nosso objetivo foi contribuir com entendimento da diversidade de TcI utilizando marcadores de evolução rápida e lenta para estudar isolados de TcI obtidos de animais silvestres de cinco biomas brasileiros. Este constitui o primeiro trabalho em que a análise de diversidade por multilocus sequence typing (MLST) foi combinada com análise por multilocus microsatélite typing (MLMT) e por maxicírculo. Os resultados demonstraram a existência de alta diversidade genética e de ocorrência de eventos de introgressão mitocondrial. Não foram observadas evidências robustas de intercâmbio genético em isolados de TcI do Brasil. A ocorrência de fluxo genético entre os isolados foi evidenciada em todos os biomas, excetuando-se a Amazônia, onde se observou isolamento genético dos isolados TcI, e a mais alta heterogeneidade genética. Foi observada ausência de associações estritas de genótipos TcI com áreas geográficas e/ou espécies hospedeiras, no entanto essas associações não podem ser descartadas totalmente. Adicionalmente, evidenciou-se que Didelphis marsupialis pode desempenhar um papel como o principal bioacumulador e dispersor de TcI. |
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Roman Maldonado, Irene FabiolaJansen, Ana Maria2018-07-10T19:02:12Z2018-07-10T19:02:12Z2018ROMAN MALDONADO, Irene Fabiola. Diversidade genética de isolados de Trypanosoma cruzi DTU I obtidos de mamíferos silvestres e triatomíneos de biomas brasileiros, avaliada por genes variáveis e constitutivos. 2018. 148 f. Tese (Doutorado em Biologia Parasitária)-Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/27445Trypanosoma cruzi, parasita hemoflagelado, é geneticamente heterogêneo e atualmente representado por seis linhagens (Discrete Typing Units, DTUs) designados TcI-TcVI. TcI é a DTU mais amplamente distribuída e é capaz de infectar centenas de espécies de mamíferos em todos os estratos florestais. Embora várias investigações sobre a diversidade genética e distribuição de genótipos de TcI tenham sido realizadas no norte de América do Sul, pouco se sabe sobre essa diversidade no Brasil. Nosso objetivo foi contribuir com entendimento da diversidade de TcI utilizando marcadores de evolução rápida e lenta para estudar isolados de TcI obtidos de animais silvestres de cinco biomas brasileiros. Este constitui o primeiro trabalho em que a análise de diversidade por multilocus sequence typing (MLST) foi combinada com análise por multilocus microsatélite typing (MLMT) e por maxicírculo. Os resultados demonstraram a existência de alta diversidade genética e de ocorrência de eventos de introgressão mitocondrial. Não foram observadas evidências robustas de intercâmbio genético em isolados de TcI do Brasil. A ocorrência de fluxo genético entre os isolados foi evidenciada em todos os biomas, excetuando-se a Amazônia, onde se observou isolamento genético dos isolados TcI, e a mais alta heterogeneidade genética. Foi observada ausência de associações estritas de genótipos TcI com áreas geográficas e/ou espécies hospedeiras, no entanto essas associações não podem ser descartadas totalmente. Adicionalmente, evidenciou-se que Didelphis marsupialis pode desempenhar um papel como o principal bioacumulador e dispersor de TcI.Trypanosoma cruzi, is a is genetically heterogeneous hemoflagellate parasite,and is currently represented by six lineages (Discrete Typing Units, DTU) called TcI-TcVI. TcI is the most widely distributed DTU and is able to infect hundreds mammalian species in all forest strata. Although several investigations into the genetic diversity and distribution of TcI genotypes have been conducted in northern South America, little is known about this diversity in Brazil. Our objective was to contribute with an understanding of TcI diversity using fast and slow evolution markers to study TcI isolates obtained from wild animals from five Brazilian biomes. This is the first work in which diversity analysis based on multilocus sequence typing (MLST) was combined with multilocus microsatellite typing (MLMT) and maxicircle analysis. The results demonstrated the existence of high genetic diversity and the occurrence of mitochondrial introgression events. No robust evidence of genetic exchange was observed in isolates of TcI from Brazil; the occurrence of genetic flow among the isolates was evidenced in all biomes, except for the Amazon, where genetic isolation of the TcI isolates was observed, and the highest genetic heterogeneity. We observed the absence of strict associations of TcI genotypes with geographical areas and/or host species, although these associations cannot be completely ruled out. In addition, it has been shown that Didelphis marsupialis may play a role as the main bioaccumulator and dispersant of TcI.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porTrypanosoma CruziTipagem de Sequências MultilocusDNA de CinetoplastoVariação GenéticaDiversidade genética de isolados de Trypanosoma cruzi DTU I obtidos de mamíferos silvestres e triatomíneos de biomas brasileiros, avaliada por genes variáveis e constitutivosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2018Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Parasitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/27445/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALirene_maldonado_ioc_dout_2018.pdfapplication/pdf14423352https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/27445/2/irene_maldonado_ioc_dout_2018.pdf9bc66c59a74947fb606be8f3499fb433MD52TEXTirene_maldonado_ioc_dout_2018.pdf.txtirene_maldonado_ioc_dout_2018.pdf.txtExtracted texttext/plain92843https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/27445/3/irene_maldonado_ioc_dout_2018.pdf.txt18b6ffddfcf72b1c638e6e9e8fc27b19MD53icict/274452022-06-24 13:10:46.194oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-06-24T16:10:46Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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