Estudo da colonização nasofaringeana por Streptococcus pneumoniae em crianças com suspeita clínica de pneumonia
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Data de Publicação: | 2011 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/4220 |
Resumo: | Streptococcus pneumoniae constitui um dos mais importantes patógenos bacterianos do trato respiratório, podendo causar infecções invasivas e não invasivas, levando a altas taxas de morbi-mortalidade, particularmente em crianças menores de cinco anos de idade. A bactéria ganha acesso ao hospedeiro através da colonização da nasofaringe, que representa um importante reservatório para a transmissão deste patógeno na comunidade, contribuindo para a disseminação horizontal de S. pneumoniae entre os indivíduos de uma população. No presente estudo, procuramos caracterizar o perfil de colonização nasofaringeana por S. pneumoniae em pacientes menores de cinco anos de idade com suspeita clínica de pneumonia, atendidos na Unidade de Saúde de São Marcos, Bairro de Pau da Lima, Salvador, no ano de 2009. Um total de 205 swabs foram coletados entre as crianças consideradas elegíveis para o estudo. Os isolados de S. pneumoniae foram identificados através de métodos microbiológicos clássicos e a determinação do sorogrupo/sorotipo foi realizada empregando-se a técnica de Multiplex-PCR. A sensibilidade a sete antimicrobianos foi testada através da técnica de microdiluição em caldo, sendo que os isolados com CIM para penicilina ≥ 0,125 μg/mL foram considerados não-susceptíveis. A técnica de PFGE foi realizada para 26 isolados correspondentes aos sorotipos mais frequentes e associados a não-sensibilidade à penicilina (sorotipos 14, 19F e 23F). Um total de 72 (35,1%) crianças foram diagnosticadas com pneumonia, sendo 39 (54,2%) menores de dois anos de idade. A taxa de colonização geral foi de 50,2%, não havendo diferença entre essas taxas quando se considerou o grupo de crianças confirmadas e suspeitas para pneumonia. Crianças na faixa etária de 36 a 47 meses formaram o grupo com maior risco de ter pneumonia bacteriana (OR: 3.17 [1.29-7.88]). Entre os sorotipos encontrados, o sorogrupo 6 (6A/6B) (17,3%) foi predominante, seguido dos sorotipos 14 (15,4%), 19F (10,6%), sorogrupo 15 (15B/15C) (9,6%), 23F (6,7%) e o sorotipo 19A (6,7%). Os demais sorotipos e sorogrupos compreenderam 33,7%. O padrão de sorotipos foi semelhante aqueles encontrados nos casos de meningite pneumocócica na cidade de Salvador. Um total de 41 isolados (39,8%) apresentaram CIM ≥ 0,125 μg/mL para penicilina e a resistência a SMX-TMP foi identificada em 69,2% dois isolados. A tipagem por PFGE identificou 11 padrões eletroforéticos, sendo que a maioria dos isolados do sorotipo 14 estavam relacionados a clones amplamente disseminados entre os casos de doença pneumocócica (“A” e “GK”). Um total de 50,5% dos isolados foram de sorotipos inclusos na vacina decavalente (PCV10) e considerando os isolados não-susceptíveis à penicilina, esta representatividade foi de 90,2%. O estudo ressalta a importância de um contínuo monitoramento do perfil de sorotipos na colonização nasofaringeana por S. pneumoniae, no período pós-vacina e da necessidade de busca de novos métodos de diagnóstico que otimizem a definição da pneumonia. |
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Silva Júnior, Jailton de AzevedoCampos, Leila CarvalhoPedreira, Joice Neves Reis2012-07-19T21:35:50Z2012-07-19T21:35:50Z2011SILVA JÚNIOR, J. A. Estudo da colonização nasofaringeana por Streptococcus pneumoniae em crianças com suspeita clínica de pneumonia. 2011. 89 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) -Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Salvador, 2011.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/4220Streptococcus pneumoniae constitui um dos mais importantes patógenos bacterianos do trato respiratório, podendo causar infecções invasivas e não invasivas, levando a altas taxas de morbi-mortalidade, particularmente em crianças menores de cinco anos de idade. A bactéria ganha acesso ao hospedeiro através da colonização da nasofaringe, que representa um importante reservatório para a transmissão deste patógeno na comunidade, contribuindo para a disseminação horizontal de S. pneumoniae entre os indivíduos de uma população. No presente estudo, procuramos caracterizar o perfil de colonização nasofaringeana por S. pneumoniae em pacientes menores de cinco anos de idade com suspeita clínica de pneumonia, atendidos na Unidade de Saúde de São Marcos, Bairro de Pau da Lima, Salvador, no ano de 2009. Um total de 205 swabs foram coletados entre as crianças consideradas elegíveis para o estudo. Os isolados de S. pneumoniae foram identificados através de métodos microbiológicos clássicos e a determinação do sorogrupo/sorotipo foi realizada empregando-se a técnica de Multiplex-PCR. A sensibilidade a sete antimicrobianos foi testada através da técnica de microdiluição em caldo, sendo que os isolados com CIM para penicilina ≥ 0,125 μg/mL foram considerados não-susceptíveis. A técnica de PFGE foi realizada para 26 isolados correspondentes aos sorotipos mais frequentes e associados a não-sensibilidade à penicilina (sorotipos 14, 19F e 23F). Um total de 72 (35,1%) crianças foram diagnosticadas com pneumonia, sendo 39 (54,2%) menores de dois anos de idade. A taxa de colonização geral foi de 50,2%, não havendo diferença entre essas taxas quando se considerou o grupo de crianças confirmadas e suspeitas para pneumonia. Crianças na faixa etária de 36 a 47 meses formaram o grupo com maior risco de ter pneumonia bacteriana (OR: 3.17 [1.29-7.88]). Entre os sorotipos encontrados, o sorogrupo 6 (6A/6B) (17,3%) foi predominante, seguido dos sorotipos 14 (15,4%), 19F (10,6%), sorogrupo 15 (15B/15C) (9,6%), 23F (6,7%) e o sorotipo 19A (6,7%). Os demais sorotipos e sorogrupos compreenderam 33,7%. O padrão de sorotipos foi semelhante aqueles encontrados nos casos de meningite pneumocócica na cidade de Salvador. Um total de 41 isolados (39,8%) apresentaram CIM ≥ 0,125 μg/mL para penicilina e a resistência a SMX-TMP foi identificada em 69,2% dois isolados. A tipagem por PFGE identificou 11 padrões eletroforéticos, sendo que a maioria dos isolados do sorotipo 14 estavam relacionados a clones amplamente disseminados entre os casos de doença pneumocócica (“A” e “GK”). Um total de 50,5% dos isolados foram de sorotipos inclusos na vacina decavalente (PCV10) e considerando os isolados não-susceptíveis à penicilina, esta representatividade foi de 90,2%. O estudo ressalta a importância de um contínuo monitoramento do perfil de sorotipos na colonização nasofaringeana por S. pneumoniae, no período pós-vacina e da necessidade de busca de novos métodos de diagnóstico que otimizem a definição da pneumonia.Streptococcus pneumoniae is one of the most important bacterial pathogens of the respiratory tract, causing invasive and noninvasive infections, leading to high rates of morbidity and mortality, particularly among children under five years old. The bacterium gains access to the host by colonizing the nasopharynx, which represents an important reservoir for transmission of this pathogen in the community, contributing to the horizontal spread of S. pneumoniae among individuals in a population. In this study, we sought to characterize the profile of nasopharyngeal colonization by S. pneumoniae in patients under five years of age with clinical suspicion of pneumonia seeking medical care at the Unidade de Saúde de São Marcos, District of Pau da Lima, Salvador, in 2009. A total of 205 swabs were collected from children eligible for the study. The isolates of S. pneumoniae were identified by classical methods and the determination of the serogroup / serotype was performed using the technique of multiplex-PCR. The sensitivity to seven antibiotics was tested by the microdilution broth method, and strains with MIC for penici≥lli n 0.125 mg/mL were considered non-susceptible. The PFGE technique was performed for 26 strains corresponding to serotypes more frequent and associated with nonsusceptibility to penicillin (serotypes 14, 19F and 23F). A total of 72 (35.1%) children were diagnosed with pneumonia, 39 (54.2%) less than two years old. The overall colonization rate was 50.2%, with no difference between those rates when considering the children's group confirmed and suspected to pneumonia. Children aged 36 to 47 months formed the group with higher risk for bacterial pneumonia (OR: 3.17 [1.29-7.88]). Among the serotypes, serogroup 6 (6A/6B) (17.3%) predominated, followed by serotypes 14 (15.4%), 19F (10.6%), serogroup 15 (15B/15C) (9.6%), 23F (6.7%) and serotype 19A (6.7%). The other serotypes and serogroups comprised 33.7%. The pattern of serotypes was similar to those found in cases of pneumococcal meningitis in Salvador. A total of 41 isolates (39.8%) had MIC ≥ 0.125 mg / mL and resistance to TMP-SMX was identified in 69.2% of isolates. Molecular typing identified 11 electrophoretic patterns, whereas most isolates of serotype 14 was associated with widespread clones among cases of pneumococcal disease ("A" and "GK"). The 10-valent conjugate vaccine (PCV10) implemented in Brazil shows a coverage of 50.5% from serotypes in the population and 90.2% for isolates not susceptible to penicillin. The study underscores the importance of continued monitoring of the prevalence of serotypes in nasopharyngeal colonization by S. pneumoniae, in the post-vaccine era, and the need to search for new methods for diagnosing pneumonia.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilporStreptococcus pneumoniaeColonização nasofaringeanaPneumoniaVigilânciaPCV10Streptococcus pneumoniaeNasopharyngeal colonizationPneumoniaPCV10SurveillanceEstudo da colonização nasofaringeana por Streptococcus pneumoniae em crianças com suspeita clínica de pneumoniainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2011Centro de Pesquisas Gonçalo MonizFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo MonizSalvadorPós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALJailton de Azevedo Silva Junior Estudo da colonização....pdfJailton de Azevedo Silva Junior Estudo da colonização....pdfapplication/pdf1101716https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/4220/1/Jailton%20de%20Azevedo%20Silva%20Junior%20Estudo%20da%20coloniza%c3%a7%c3%a3o....pdf049972199c76bb97406fc006c2ba9c27MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81990https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/4220/2/license.txtb6ead4607e393dee1190c21ba08397beMD52TEXTJailton de Azevedo Silva Junior Estudo da colonização....pdf.txtJailton de Azevedo Silva Junior Estudo da colonização....pdf.txtExtracted texttext/plain129999https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/4220/5/Jailton%20de%20Azevedo%20Silva%20Junior%20Estudo%20da%20coloniza%c3%a7%c3%a3o....pdf.txt73d1b9fe9801391e06ff035578fddfe3MD55THUMBNAILJailton de Azevedo Silva Junior Estudo da colonização....pdf.jpgJailton de Azevedo Silva Junior Estudo da colonização....pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1554https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/4220/4/Jailton%20de%20Azevedo%20Silva%20Junior%20Estudo%20da%20coloniza%c3%a7%c3%a3o....pdf.jpge7d2a9ffd7d2dbbbb4415e615b3c3cb8MD54icict/42202018-05-22 15:54:40.936oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352018-05-22T18:54:40Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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