Identificação de proteínas imunodominantes provenientes dos subgêneros Viannia e Leishmania como potenciais candidatos vacinais pan específicos no controle das leishmanioses
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Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/47398 |
Resumo: | As leishmanioses são causadas por cerca de 20 espécies de Leishmania e se apresentam em diversas formas clínicas, que podem variar de branda a muito grave. Elas afetam milhões de pessoas e até então não existem medidas de controle eficazes. Assim, a imunização da população seria uma alternativa eficiente de controle. Evidências sugerem que a resposta imune que se estabelece após a cura clínica de leishmanioses deva constituir um padrão de resposta imunológica associado à proteção, e que uma preparação vacinal deveria estimulá-la preferencialmente. Nosso grupo demonstrou que antígenos de L. (Viannia) naiffi (espécie considerada benigna) conseguem induzir respostas bem moduladas, e que soros de voluntários curados de leishmaniose tegumentar cutânea reconheceram frações desse antígeno consideradas imunodominantes. Experimentos anteriores demonstraram em hamster que a imunização intranasal com antígenos totais dessa espécie são capazes de induzir uma imunidade protetora contra L. (V.) braziliensis. O mesmo grupo já havia obtido a mesma resposta protetora utilizando o antígeno total de L. (L.) amazonensis. No entanto, sabe-se que nem todos os componentes presentes nesses antígenos estão associados à proteção e que a identificação de proteínas que sejam imunogênicas é uma etapa indispensável na formulação de uma vacina O objetivo deste trabalho foi identificar as proteínas imunodominantes presentes nas frações solúveis de L. (L.) amazonensis (LaAg(s)) e L.(V.) naiffi (LnAg(s)), que sejam conservadas dentro do gênero Leishmania, para formular uma vacina pan específica para o controle das leishmanioses. Primeiramente, os antígenos LnAg(s) e LaAg(s) foram subfracionados em gel de poliacrilamida e as bandas com peso molecular entre 35 e 100KDa foram extraídas e submetidas à análise por espectrometria de massa para análise proteômica. Desta análise, foram obtidas as sequências de aminoácidos, o tamanho das sequências, e a abundância das proteínas. As proteínas mais abundantes foram submetidas à análise de similaridade com proteínas de hospedeiros. As proteínas de LnAg(s) e LaAg(s) com baixa similaridade (<30%) às proteínas humanas foram analisadas por preditores de epítopos reconhecidos por linfócitos B. Em paralelo, a predição de epítopos presentes em LnAg(s) e LaAg(s), capazes de se ligar com alta afinidade a moléculas HLA classes I e II, assim como a promiscuidade de ligação a alelos de HLA para cada proteína, foram avaliados dentre aquelas que apresentaram maior abundância e baixa similaridade. Por fim, após a análise de homologia das proteínas entre as espécies de Leishmania, foram identificadas 11 proteínas com mais homólogos. Elas apresentaram potencial de reconhecimento por linfócitos B, assim como também por componentes da resposta imune celular (como predito para a apresentação por HLA classes I e II). O potencial de ativação de linfócitos T pelos epítopos presentes nas 11 proteínas foi incrementado pela ampla capacidade de apresentação antigênica na população humana, devido à alta promiscuidade quanto à capacidade de ligação destes epítopos a alelos de HLA. Esses resultados contribuem para a identificação de antígenos com potencial de compor um protótipo vacinal capaz de induzir uma resposta imune protetora pan específica em humanos, com características imunodominantes e indutoras de resposta humoral e celular, para serem empregados no controle das leishmanioses. |
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Oliveira, Prisciliana Jesus dePinto, Eduardo Fonseca2021-05-26T16:56:05Z2021-05-26T16:56:05Z2020OLIVEIRA, Prisciliana Jesus de. Identificação de proteínas imunodominantes provenientes dos subgêneros Viannia e Leishmania como potenciais candidatos vacinais pan específicos no controle das leishmanioses. 2020. 173 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2020.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/47398As leishmanioses são causadas por cerca de 20 espécies de Leishmania e se apresentam em diversas formas clínicas, que podem variar de branda a muito grave. Elas afetam milhões de pessoas e até então não existem medidas de controle eficazes. Assim, a imunização da população seria uma alternativa eficiente de controle. Evidências sugerem que a resposta imune que se estabelece após a cura clínica de leishmanioses deva constituir um padrão de resposta imunológica associado à proteção, e que uma preparação vacinal deveria estimulá-la preferencialmente. Nosso grupo demonstrou que antígenos de L. (Viannia) naiffi (espécie considerada benigna) conseguem induzir respostas bem moduladas, e que soros de voluntários curados de leishmaniose tegumentar cutânea reconheceram frações desse antígeno consideradas imunodominantes. Experimentos anteriores demonstraram em hamster que a imunização intranasal com antígenos totais dessa espécie são capazes de induzir uma imunidade protetora contra L. (V.) braziliensis. O mesmo grupo já havia obtido a mesma resposta protetora utilizando o antígeno total de L. (L.) amazonensis. No entanto, sabe-se que nem todos os componentes presentes nesses antígenos estão associados à proteção e que a identificação de proteínas que sejam imunogênicas é uma etapa indispensável na formulação de uma vacina O objetivo deste trabalho foi identificar as proteínas imunodominantes presentes nas frações solúveis de L. (L.) amazonensis (LaAg(s)) e L.(V.) naiffi (LnAg(s)), que sejam conservadas dentro do gênero Leishmania, para formular uma vacina pan específica para o controle das leishmanioses. Primeiramente, os antígenos LnAg(s) e LaAg(s) foram subfracionados em gel de poliacrilamida e as bandas com peso molecular entre 35 e 100KDa foram extraídas e submetidas à análise por espectrometria de massa para análise proteômica. Desta análise, foram obtidas as sequências de aminoácidos, o tamanho das sequências, e a abundância das proteínas. As proteínas mais abundantes foram submetidas à análise de similaridade com proteínas de hospedeiros. As proteínas de LnAg(s) e LaAg(s) com baixa similaridade (<30%) às proteínas humanas foram analisadas por preditores de epítopos reconhecidos por linfócitos B. Em paralelo, a predição de epítopos presentes em LnAg(s) e LaAg(s), capazes de se ligar com alta afinidade a moléculas HLA classes I e II, assim como a promiscuidade de ligação a alelos de HLA para cada proteína, foram avaliados dentre aquelas que apresentaram maior abundância e baixa similaridade. Por fim, após a análise de homologia das proteínas entre as espécies de Leishmania, foram identificadas 11 proteínas com mais homólogos. Elas apresentaram potencial de reconhecimento por linfócitos B, assim como também por componentes da resposta imune celular (como predito para a apresentação por HLA classes I e II). O potencial de ativação de linfócitos T pelos epítopos presentes nas 11 proteínas foi incrementado pela ampla capacidade de apresentação antigênica na população humana, devido à alta promiscuidade quanto à capacidade de ligação destes epítopos a alelos de HLA. Esses resultados contribuem para a identificação de antígenos com potencial de compor um protótipo vacinal capaz de induzir uma resposta imune protetora pan específica em humanos, com características imunodominantes e indutoras de resposta humoral e celular, para serem empregados no controle das leishmanioses.Leishmaniasis is caused by 20 Leishmania species and presents several clinical forms, which can vary from mild to very severe. They affect millions of people and so far there are no effective control measures. Thus, the immunization of population would be an efficient control alternative. Some evidence suggests that the immune response that is established after the long-lasting clinical cure of leishmaniasis should constitute an immune response pattern associated with protection, and that a vaccine preparation should preferably stimulate this immune profile. Our group showed that L. (Viannia) naiffi antigens (a species considered benign) can induce well-modulated responses, and that sera from volunteers cured of cutaneous leishmaniasis recognized immunodominant fractions of this antigen. Previous experiments showed in hamsters that intranasal immunization with total antigens of this species is capable of inducing protective immunity against L. (V.) braziliensis. Previously, the same group had already obtained the same protective response using the total antigen of L. (L.) amazonensis. However, it is known that not all antigenic components in total antigens are associated with protection, and that the identification of these proteins is an indispensable step in the formulation of a vaccine. The objective of this work was to identify the immunodominant proteins present in the soluble fractions of L. (L.) amazonensis (LaAg(s)) and L. (V.) naiffi (LnAg(s)), which are conserved within the genus Leishmania, to formulate a pan specific vaccine for the control of leishmaniasis. First, LnAg(s) and LaAg(s) antigens were sub fractionated on polyacrylamide gel and bands with molecular weight between 35 and 100KDa were extracted and subjected to mass spectrometry for proteomic analysis. From this analysis, the amino acid sequences, the size of the sequences, and the abundance of proteins were obtained. The most abundant were subjected to analysis of similarity with host proteins. LnAg(s) and LaAg(s) proteins with low similarity (<30%) to human proteins were analyzed by predictors of epitopes recognized by B lymphocytes. In parallel, the prediction of epitopes present in LnAg(s) and LaAg(s), capable of binding with high affinity to the HLA class I and II molecules as well as the promiscuity of each protein for HLA alleles, were evaluated among those that showed abundance and low similarity. Finally, after analyzing the protein homology between Leishmania species, 11 proteins were identified with more orthologists. They were potentially recognized by B lymphocytes, as well as by components of the cellular immune response (predictors of HLA class I and II presentation). Finally, after analyzing the homology of proteins among Leishmania species, 11 proteins were identified with more orthologous They were potentially recognized by B lymphocytes, as well as by components of the cellular immune response predicted by HLA class I and II antigen presentation. This potential for activation of T lymphocytes by the epitopes present in the 11 proteins was increased by the ample capacity of antigenic presentation in the human population, due to the high promiscuity among the HLA alleles regarding the capacity of binding to the epitopes. These results contribute to the identification of antigens potentially capable of composing a vaccine prototype capable of inducing a specific protective immune response in humans, with immunodominant characteristics and inducing humoral and cellular responses, to be used in the control of leishmaniasis.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porAtivação LinfocitáriaEpitopos de Linfócito TLeishmania mexicanaLeishmaniose prevenção & controleAtivação LinfocitáriaEpitopos de Linfócito TLeishmania mexicanaLeishmanioseprevenção & controleImunizaçãoIdentificação de proteínas imunodominantes provenientes dos subgêneros Viannia e Leishmania como potenciais candidatos vacinais pan específicos no controle das leishmaniosesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2020Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Medicina Tropicalinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/47398/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALprisciliana_oliveira_ioc_mest_2020.pdfapplication/pdf3369536https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/47398/2/prisciliana_oliveira_ioc_mest_2020.pdfbd35f705989730305a32c6eb3bd461f7MD52TEXTprisciliana_oliveira_ioc_mest_2020.pdf.txtprisciliana_oliveira_ioc_mest_2020.pdf.txtExtracted texttext/plain306288https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/47398/3/prisciliana_oliveira_ioc_mest_2020.pdf.txtac76d9b99939eac7ab3596ff43502736MD53icict/473982023-09-04 11:49:20.504oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-09-04T14:49:20Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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