Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gonzaga, Rosa Maria S
Data de Publicação: 2008
Outros Autores: Rodart, Itatiana Ferreira, Reis, Mitermayer Galvão dos, Ramalho Neto, Cícero Eduardo, Silva, Denise Wanderlei
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6174
Resumo: A frequência de genótipos do vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos anti-HCV no estado de Alagoas, Brasil, foi determinada através da RT-PCR aninhada da região 5'NCR seguida pela análise do polimorfismo de comprimento dos fragmentos de restrição (RFLP). A RT-PCR aninhada utilizando primers genótipo-específicos da região core foi efetuada quando não foi possível determinar o genótipo pelo primeiro método. Níveis detectáveis de HCV-RNA estavam presentes em 115 (74,7 por cento) das 154 amostras de soro. O genótipo 1 foi o mais freqüente (77,4 por cento), contra 20,9 por cento do genótipo 3 e 0,8 por cento do genótipo 2. O subtipo 1b foi predominante (65,2 por cento), seguido pelos subtipos 1a (8,7 por cento) e 3a (6,1 por cento). Co-infecção (1a/3a) foi detectada em 0,8 por cento das amostras. Não foram encontradas diferenças significativas quanto à prevalência do genótipo 1 em relação ao que tem sido obtido de pacientes soropositivos anti-HCV de outras localidades do Brasil. Este é o primeiro relato da presença do genótipo 2 no estado.
id CRUZ_91e51152ad044150fb535168c9cfe1dd
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/6174
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Gonzaga, Rosa Maria SRodart, Itatiana FerreiraReis, Mitermayer Galvão dosRamalho Neto, Cícero EduardoSilva, Denise Wanderlei2013-01-11T20:33:14Z2013-01-11T20:33:14Z2008GONZAGA, R. M. S. et al. Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 39, n.4, p. 644-647, dec. 2008.1517-8382https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6174A frequência de genótipos do vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos anti-HCV no estado de Alagoas, Brasil, foi determinada através da RT-PCR aninhada da região 5'NCR seguida pela análise do polimorfismo de comprimento dos fragmentos de restrição (RFLP). A RT-PCR aninhada utilizando primers genótipo-específicos da região core foi efetuada quando não foi possível determinar o genótipo pelo primeiro método. Níveis detectáveis de HCV-RNA estavam presentes em 115 (74,7 por cento) das 154 amostras de soro. O genótipo 1 foi o mais freqüente (77,4 por cento), contra 20,9 por cento do genótipo 3 e 0,8 por cento do genótipo 2. O subtipo 1b foi predominante (65,2 por cento), seguido pelos subtipos 1a (8,7 por cento) e 3a (6,1 por cento). Co-infecção (1a/3a) foi detectada em 0,8 por cento das amostras. Não foram encontradas diferenças significativas quanto à prevalência do genótipo 1 em relação ao que tem sido obtido de pacientes soropositivos anti-HCV de outras localidades do Brasil. Este é o primeiro relato da presença do genótipo 2 no estado.We determined the frequency of hepatitis C virus (HCV) genotypes in anti-HCV seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil, by means of nested-reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-nested-PCR) followed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) of amplified fragments of the 5ïNCR. The nested-PCR with genotype-specific primers from the core region was carried out when detection was not possible by the first approach. Detectable HCV-RNA was present in 115 (74.7 percent) of 154 serum samples. Genotype 1 was the most frequent (77.4 percent), against 20.9 percent of genotype 3 and 0.8 percent of genotype 2. Subtype 1b was predominant (65.2 percent), followed by subtypes 1a (8.7 percent), and 3a (6.1 percent). Coinfection (1a/3a) was detected in 0.8 percent of the samples. Indeed, there was no significant differences in the prevalence of genotype 1 compared to what has been obtained from anti-HCV seropositive patients from other locations in Brazil. Here we report for the first time the genotype 2 in the state of Alagoas.Universidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, BrasilUniversidade Federal de Alagoas. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Maceió, AL, BrasilengDistribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleHepatitis C virus5’NCRCore regionRT-nested-PCRGenotypesVirosesVírus da HepatiteGenótipoFrequência do GeneReação em Cadeia da PolimerasePolimorfismo GenéticoHepacivirus/isolamento & purificaçãoSorotipagemPacientesMétodosTécnicasProcedimentos ClínicosHumanosIn VitroRelatos de Casosinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALGonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdfGonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdfapplication/pdf147559https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/1/Gonzaga%2c%20Rosa%20Maria%20S%20Distribution....pdfdb62cb9d398d805b2d1995c970eb86bbMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81914https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/2/license.txt7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81fMD52TEXTGonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdf.txtGonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdf.txtExtracted texttext/plain17324https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/5/Gonzaga%2c%20Rosa%20Maria%20S%20Distribution....pdf.txt5629d1667be1798afd7ff6e07f6012beMD55THUMBNAILGonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdf.jpgGonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2130https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/4/Gonzaga%2c%20Rosa%20Maria%20S%20Distribution....pdf.jpg63142698b02cf33b210fb19b8f12e4c6MD54icict/61742023-03-15 14:32:58.15oai:www.arca.fiocruz.br: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ório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-03-15T17:32:58Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
title Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
spellingShingle Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
Gonzaga, Rosa Maria S
Hepatitis C virus
5’NCR
Core region
RT-nested-PCR
Genotypes
Viroses
Vírus da Hepatite
Genótipo
Frequência do Gene
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo Genético
Hepacivirus/isolamento & purificação
Sorotipagem
Pacientes
Métodos
Técnicas
Procedimentos Clínicos
Humanos
In Vitro
Relatos de Casos
title_short Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
title_full Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
title_fullStr Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
title_full_unstemmed Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
title_sort Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil
author Gonzaga, Rosa Maria S
author_facet Gonzaga, Rosa Maria S
Rodart, Itatiana Ferreira
Reis, Mitermayer Galvão dos
Ramalho Neto, Cícero Eduardo
Silva, Denise Wanderlei
author_role author
author2 Rodart, Itatiana Ferreira
Reis, Mitermayer Galvão dos
Ramalho Neto, Cícero Eduardo
Silva, Denise Wanderlei
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Gonzaga, Rosa Maria S
Rodart, Itatiana Ferreira
Reis, Mitermayer Galvão dos
Ramalho Neto, Cícero Eduardo
Silva, Denise Wanderlei
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv Hepatitis C virus
5’NCR
Core region
RT-nested-PCR
Genotypes
topic Hepatitis C virus
5’NCR
Core region
RT-nested-PCR
Genotypes
Viroses
Vírus da Hepatite
Genótipo
Frequência do Gene
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo Genético
Hepacivirus/isolamento & purificação
Sorotipagem
Pacientes
Métodos
Técnicas
Procedimentos Clínicos
Humanos
In Vitro
Relatos de Casos
dc.subject.decs.pt_BR.fl_str_mv Viroses
Vírus da Hepatite
Genótipo
Frequência do Gene
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo Genético
Hepacivirus/isolamento & purificação
Sorotipagem
Pacientes
Métodos
Técnicas
Procedimentos Clínicos
Humanos
In Vitro
Relatos de Casos
description A frequência de genótipos do vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos anti-HCV no estado de Alagoas, Brasil, foi determinada através da RT-PCR aninhada da região 5'NCR seguida pela análise do polimorfismo de comprimento dos fragmentos de restrição (RFLP). A RT-PCR aninhada utilizando primers genótipo-específicos da região core foi efetuada quando não foi possível determinar o genótipo pelo primeiro método. Níveis detectáveis de HCV-RNA estavam presentes em 115 (74,7 por cento) das 154 amostras de soro. O genótipo 1 foi o mais freqüente (77,4 por cento), contra 20,9 por cento do genótipo 3 e 0,8 por cento do genótipo 2. O subtipo 1b foi predominante (65,2 por cento), seguido pelos subtipos 1a (8,7 por cento) e 3a (6,1 por cento). Co-infecção (1a/3a) foi detectada em 0,8 por cento das amostras. Não foram encontradas diferenças significativas quanto à prevalência do genótipo 1 em relação ao que tem sido obtido de pacientes soropositivos anti-HCV de outras localidades do Brasil. Este é o primeiro relato da presença do genótipo 2 no estado.
publishDate 2008
dc.date.issued.fl_str_mv 2008
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2013-01-11T20:33:14Z
dc.date.available.fl_str_mv 2013-01-11T20:33:14Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv GONZAGA, R. M. S. et al. Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 39, n.4, p. 644-647, dec. 2008.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6174
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 1517-8382
identifier_str_mv GONZAGA, R. M. S. et al. Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 39, n.4, p. 644-647, dec. 2008.
1517-8382
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6174
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/1/Gonzaga%2c%20Rosa%20Maria%20S%20Distribution....pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/2/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/5/Gonzaga%2c%20Rosa%20Maria%20S%20Distribution....pdf.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/6174/4/Gonzaga%2c%20Rosa%20Maria%20S%20Distribution....pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv db62cb9d398d805b2d1995c970eb86bb
7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f
5629d1667be1798afd7ff6e07f6012be
63142698b02cf33b210fb19b8f12e4c6
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1822792090477658112